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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?
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wwsw38

铁虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列? 已有14人参与

问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?

我用的16SRDNA通用引物,测序公司给我们的序列里会不会包括该通用引物的序列?
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为自己加油
1楼 2010-05-05 12:44:47
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liyong1981

金虫 (正式写手)
那是肯定有的～
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5楼2010-05-05 13:17:51
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gaiyf

金虫 (正式写手)
一般不会出现这种况，但是也会出现当你用contig连接的时候会有一个引物连不上的情况，如果是这样，那就需要测序公司重新测
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多看文献，多学知识
3楼2010-05-05 13:05:28
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wwsw38

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by wwsw38 at 2010-05-05 12:44:47:
问个问题,测PCR产物序列的时候会不会测出引物的序列?

我用的16SRDNA通用引物,测序公司给我们的序列里会不会包括该通用引物的序列?

那就是说如果我的上游引物是:AgA gTT TgA TCC Tgg CTC Ag的话,那测序公司给我的序列的一条链开始就是:AgA gTT TgA TCC Tgg CTC Ag
?
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为自己加油
4楼2010-05-05 13:15:19
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蓝粉笔

铁虫 (初入文坛)
★ ★
scelab(金币+2):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-05-05 15:35:40
你测序送样为PCR产物时，所得到的结果里不会有PCR扩增引物序列的，因为现在测序使用的原理都是SANGER测序法：使用带有荧光的dNTP及ddNTP进行链延长，电泳记录信号，引物上是没有荧光信号的，所以结果上是看不到引物本身的，而且测序结果的开头会有10到20个碱基是不可信的，这是无法避免的损失。
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6楼2010-05-05 14:26:07
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