应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 【求助/交流】为什么用拼接软件，不能将我的序列拼接起来？
101/1返回列表
查看: 2260  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ltakashi

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】为什么用拼接软件，不能将我的序列拼接起来？ 已有6人参与

如题！
哪位高手指导下！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-03-10 10:26:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ltakashi

银虫 (小有名气)
有人不？
回复此楼
2楼2011-03-10 10:45:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+2): 鼓励 2011-03-10 11:52:18
我也遇到过这样的问题。我当初是拿基因全长，3‘、5’与我已有片段就是拼不起来，分析的结果是PCR产物特异性不够，在我测序序列中尽然找不到我的引物。我不知道你具体是做的什么，所以以上仅供参考！！！
赞一下(2人) 回复此楼
持之以恒、永不放弃！
3楼2011-03-10 11:00:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ltakashi

银虫 (小有名气)
1949stone: 见楼下 2011-03-10 11:54:01
怎么手动拼接？
我的是16s rDNA特征片段
当时没拼接，现在我想要拼接的序列，上传到GENBANK里
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-03-10 11:02:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wqj1988926

金虫 (正式写手)
学习下，呵呵，帮顶
回复此楼
风雪夜归人
5楼2011-03-10 11:09:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yabxxh

木虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+2): 顶--- 2011-03-10 11:54:18
拼接的方法就是用比对软件把你的测序结果的重合部分找出来，理想的情况是你的重合部分100%一样，然后把前段、重合的部分和后端拼接起来就可以了。多条测序结果的话同理。不过有时候测序公司会给你反向互补，有时候又不反向互补，所以拼接的时候如果没重合部分，就反向互补以下。好运
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2011-03-10 11:10:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
1949stone(金币+1): 估计不会这么惨吧 2011-03-10 11:54:46
引用回帖:
Originally posted by ltakashi at 2011-03-10 11:02:50:
怎么手动拼接？
我的是16s rDNA特征片段
当时没拼接，现在我想要拼接的序列，上传到GENBANK里

如果你的两个序列没能测到重叠的部分，肯定拼接不上啊。
比如：1500bp的序列，正向测到700，反向测到700，那中间有100bp的gap，那肯定拼不上。
赞一下(2人) 回复此楼
7楼2011-03-10 11:48:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by ltakashi at 2011-03-10 11:02:50:
怎么手动拼接？
我的是16s rDNA特征片段
当时没拼接，现在我想要拼接的序列，上传到GENBANK里

拼接的前提是你的片段有重复序列。这样你只需要下载一个拼接软件就可以了，比如DNAstar。
赞一下(1人) 回复此楼
持之以恒、永不放弃！
8楼2011-03-10 11:56:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cjl2fl

金虫 (正式写手)
Vector这个软件试试
赞一下 回复此楼
9楼2011-03-10 13:16:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ltakashi

银虫 (小有名气)
谢谢大家的回复！
回复此楼
10楼2011-03-11 12:31:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ltakashi 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 4/200 2026-11-07 19:03 by Xc2FxHsHkBNc
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 BMTdnp4OJO9f 2026-11-06 5/250 2026-11-07 17:56 by Xc2FxHsHkBNc
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 4/200 2026-11-07 16:50 by Xc2FxHsHkBNc
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 4/200 2026-11-07 16:28 by Xc2FxHsHkBNc
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 5sJFDKp2kwuI 2026-11-06 5/250 2026-11-07 16:06 by Xc2FxHsHkBNc
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 8/400 2026-11-06 16:34 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 14/700 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 18/900 2026-11-06 13:36 by BkA9Bi5cMhkD
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 10/500 2026-11-06 12:32 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-05 11:10 by PYZmcHr5kSaq
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭