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我好暴躁啊

新虫 (小有名气)

[求助] 双酶切连接不成功 已有7人参与

双酶切连接这么难吗,怎么就连不上!目的片段3300,载体3000,酶是NEB的。,双酶切后10ulT4连接体系,体积比设了好几个,转化子长了好多,挑菌,菌液PCR都是假阳性,欲哭无泪( ˙-˙ ),该怎么办?

双酶切连接不成功


双酶切连接不成功-1


双酶切连接不成功-2


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kangaroo0513

新虫 (正式写手)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-05-30 22:40:29
包给我做吧~~~呵呵。大片段本身就不太好连,另外,你酶切位点没有选紧邻的两个吧。。那样可能切不开哈。。然后,你回收片段关注下260/230,最好2左右,最差也要大于1.5,要么成功率会很低。
4楼2017-05-30 22:32:27
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铭记于心2222

铜虫 (初入文坛)

确保酶切效果,去磷酸化效果,连接体系,跑胶可以看看哦,别切碎了  做对照看看哪步出问题了

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5楼2017-05-30 22:48:06
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原来,是这样

金虫 (小有名气)


西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2017-06-02 22:42:53
目的片段大于两千就已经很难连接了,更何况是3300的片段。。。体积比还是要看你的片段及载体浓度,目的片段和载体浓度都不能低,10ul的体系DNA总量最好不要少于1mg。

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6楼2017-05-30 23:10:49
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wangxiaoguo

木虫 (正式写手)

t4连接看是否长,如果长的话,说明酶切不完全。

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202010
14楼2017-05-31 22:11:37
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wangxiaoguo

木虫 (正式写手)

第二,酶切和连接时间最好长一些。一般双酶切出现假阳性的话,很可能是酶切不是很完全。如果两个酶位点太近的话会有位置效应的。另外,确认一下你检测的引物是唯一的。要不可能会出现扩增的并不是目的片段长度,但实际上确连好了

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202010
15楼2017-05-31 22:15:16
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lusandanooo

银虫 (小有名气)

用一部克隆吧,就国产的,好用的不行,我之前片段3.8k载体3k,双酶切折腾了三个月连不上,一步克隆做了一次两天搞定。

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毕了业真开心嘻嘻嘻嘻嘻
20楼2017-06-01 20:58:47
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luoyl210

新虫 (著名写手)

我们一般克隆的假阳性比较多,亚克隆不太会出现假阳性

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3楼2017-05-30 22:13:28
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 原来,是这样 at 2017-05-30 23:10:49
目的片段大于两千就已经很难连接了,更何况是3300的片段。。。体积比还是要看你的片段及载体浓度,目的片段和载体浓度都不能低,10ul的体系DNA总量最好不要少于1mg。
...

1mg.....会死人的~~~
7楼2017-05-31 07:57:11
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司空呆呆

新虫 (小有名气)

你的载体有点小,换一个7000左右的,很好链接的。

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17楼2017-06-01 13:41:34
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
大片段不好连接,效率低,但是还是有阳性的。我的问题是重组质粒超过10 kb,很难转化进去,加上重组效率低筛不到目的菌。
18楼2017-06-01 16:05:37
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贱贱JMe

木虫 (小有名气)

教导主任

【答案】应助回帖

引用回帖:
28楼: Originally posted by 我好暴躁啊 at 2017-06-02 12:50:24
我是本科实习新手,求教一部克隆是什么
...

In-Fusion试剂盒或者无缝克隆试剂盒,就是你说的同源重组,你的片段较大,应该也可以,咨询一下厂家,2K以内效率极高
想做一位科研好人
32楼2017-06-02 14:53:29
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最美的平凡

铁虫 (正式写手)

换一种方式吧,市场上现在比较流行同源重组克隆,有的叫无缝拼接,效率很高

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学术狗
34楼2017-06-02 15:19:34
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普通回帖
2楼2017-05-30 22:01:09
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原来,是这样

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2017-05-31 07:57:11
1mg.....会死人的~~~...

记错了,是1ug,不好意思啊

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8楼2017-05-31 08:22:12
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我好暴躁啊

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by kangaroo0513 at 2017-05-30 22:32:27
包给我做吧~~~呵呵。大片段本身就不太好连,另外,你酶切位点没有选紧邻的两个吧。。那样可能切不开哈。。然后,你回收片段关注下260/230,最好2左右,最差也要大于1.5,要么成功率会很低。

回收片段测浓度确实260/230不好,260都没有峰值。我是第一个酶切后65度灭火20min,然后直接加第二个酶,可是回收的时候浓度还是很低。切3ug,回收了60ng。T_T

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9楼2017-05-31 08:49:05
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我好暴躁啊

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 铭记于心2222 at 2017-05-30 22:48:06
确保酶切效果,去磷酸化效果,连接体系,跑胶可以看看哦,别切碎了  做对照看看哪步出问题了

酶切效果怎么看,侧浓度看260/230,吗? 没有去磷酸化 我问师兄,他说没做过,连接体系我再优化一下,还有大神我怎么设置对照?
10楼2017-05-31 09:14:40
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