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新虫 (小有名气)

[交流] 载体、目的基因双酶切、连接问题 已有17人参与

各位大侠,帮我分析下PET-28a载体上用BamH I、Sal I酶切能切开吗?,序列见图。两个位点相差13bp,还有我在目的基因上设计酶切引物,引物前方只加了三个保护性碱基,这样子行不?我连接了好久了都没连接上。我用的酶是TAKARA的,按照公司推荐的载体切2-3小时,800多bp的目的切2小时。两个酶buffer不一样,有10xT的公用buffer,反应温度也不一样,BamH I30℃,Sal I37℃,按照takara推荐的公用buffer以及37℃酶切,直接双酶切以及分步酶切都试过了,挑取的阳性克隆,提质粒后与原始载体大小接近,目的基因未连接成功有没有什么方法能够证明双酶切切开了?

载体、目的基因双酶切、连接问题
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小静儿000

新虫 (初入文坛)


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我的实验也碰到了相同的问题,连了好久都没成功,后来实验室师兄教给我用同源重组的方法进行克隆,结果就连上了,而且目的片段不用酶切,直接把载体酶切之后用Dnp1酶消化一下就没有环状质粒了,不会有假阳性的,我用的是Vazyme的同源重组克隆试剂盒,你可以试试
14楼2016-08-04 10:15:50
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原海亮

木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:43:14
xn8008: 金币+1, 应助指数+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:45:11
空载载体的处理确实容易出现这样情况,可以将回收后的载体重复二次酶切试试,保证酶切完全。或者可以找实验室心里构建好的pET+目的片段的载体,那它作为出发载体进行双酶切(当然这个载体上保留着你需要的双酶切位点),这样你回收载体时候,就可以同过看有没有目的条带切出来,来判断载体的酶切情况。第二,片段的处理,首先确定所选的酶为在目的片段里不存在,然后酶切处理同样要求尽可能的酶切完全,很多人为了避免后面出现类似麻烦的事情,可以把pcr产物连接T载体,一方面可以送测序验证是否正确后,再安排接下来实验。另一方面,这样做你酶切目的片段时候,就可以通过回收从T载体上切下来的片段进行连接转化,祝好!

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
3楼2016-03-23 12:18:32
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卡维斯

金虫 (正式写手)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:47:36
可以试一下用高浓度 的胶去跑电泳,多跑会,然后用凝胶成像里面的负片模式拍照。我们实验有做过切下25bp的.
2楼2016-03-23 11:26:48
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普通回帖

Bearxionghui

新虫 (初入文坛)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:46:04
检验双酶切是否切开,可以用琼脂糖凝胶电泳,把酶切产物与原质粒电泳,正常情况,酶切后迁移率较慢,条带在原质粒后。或者你可以试试TAKARA的快切酶,时间快而且酶切缓冲液一样,可以同时双酶切。
鐩镐俊鑷繁锛?
4楼2016-03-24 21:44:23
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dxw2015

金虫 (初入文坛)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:46:15
xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:46:28
不好检测,可以把胶的浓度提高

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5楼2016-03-24 22:25:35
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刘大梦梦

新虫 (初入文坛)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:47:45
总琼脂糖凝胶电泳检测。一个原质粒做对照,一个双酶切,两个单酶切。成像规律,最下边是原质粒对照,其次是双酶切,最上边是两条单酶切的带。有细微差别。参考。

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6楼2016-03-26 20:46:20
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仇峰12306

铁虫 (小有名气)

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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:47:53
会不会是连接出问题了?
7楼2016-03-26 20:56:17
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凯伦爱佳佳

金虫 (正式写手)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:47:59
我用pet-32a质粒,酶切位点bamh1和ecor1,我半个小时就切开了
8楼2016-03-28 17:38:58
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张凡云

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:48:05
很简单啊,你设置一组对照就知道有木有切开啊

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9楼2016-03-31 12:18:06
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想学好的学渣

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
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xn8008: 金币+1, 欢迎发帖交流 2016-08-04 06:48:14
用他们公司的快切酶,最好不要用sal I那个酶。三个保护碱基够了。你要保证你插入的片段不会造成移码突变。另外载体和片段配比也要保证好。推荐全式金的原核表达的载体,用着还可以

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10楼2016-03-31 14:39:11
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