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雨中飞蝶

新虫 (初入文坛)

[求助] 双酶切 已有5人参与

我现在想把目的基因构建到表达载体PET-30a中,选用的酶是Ecor1和Xho1,使用的Takara的快切酶。我是先将目的片段构建至PMD-18中,然后再同表达载体同时做双酶切,但每次T载体中目的片段可以切下来,但表达载体却切不开,不知道是怎么回事,时间、反应体系都是一样的。我想问一下,大家用过快切酶吗?反应时间一般都要多久,说明书说5min即可,但每次酶切效果都很弱,即使我延长到2小时,或是增加质粒的量,切下来的目的片段条带也很弱,而载体根本切不下来(载体上两酶切位点相距33bp)。大家有好的建议吗?或是遇到过类似的问题吗?
我的图片是TIFF格式,上传不上来.....
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bright8

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-25 22:11:31
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-25 22:11:39
载体双酶切以后,跑胶看不大切下来的条带,太小了,建议你直接连接,再做菌落PCR就知道啦。我实验室用的酶都是NEB的,比Takara要好一点啦,说明书上15min,我一般切20h ,效果要好一点。按照说明书上,只有部分切开的。
7楼2015-06-25 21:21:42
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sundan611

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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雨中飞蝶: 金币+4, ★★★很有帮助 2015-07-01 14:41:46
两个酶切位点只是相距33bp,你双酶切单凭跑胶根本看不出来有没有同时切开,不嫌麻烦保证连接成功最好就是分别单切,如果要是嫌麻烦想双切一次,你连接转化的时候就得好好做对照,要不然就是切不开怎么都是自连,你的目的片段切下来浓度低的话就得多切几管50ul体系至少6管,保证一定浓度,目的片段要是小的话浓度上不去也没事,因为你载体要是单切2次回收以后浓度也不会太高,在保证载体和目的片段都切开的情况下,多调节连接比例一定能行,一定要做好对照!
9楼2015-06-26 16:05:55
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普通回帖

li201018

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-25 22:10:10
雨中飞蝶: 金币+1, 有帮助 2015-07-01 14:41:06
很正常,表达载体很大,目的片段相对很小,有时候肉眼看不见双酶切的小片段,但是胶回收目的区域的胶,PCR验证还是有东西,我就遇到过此类情况。
低调!务实!
2楼2015-06-24 11:21:26
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雨中飞蝶

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by li201018 at 2015-06-24 11:21:26
很正常,表达载体很大,目的片段相对很小,有时候肉眼看不见双酶切的小片段,但是胶回收目的区域的胶,PCR验证还是有东西,我就遇到过此类情况。

但是看不到东西,怎么判断条带出现的区域呢?
3楼2015-06-24 16:08:57
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雨中飞蝶

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by li201018 at 2015-06-24 11:21:26
很正常,表达载体很大,目的片段相对很小,有时候肉眼看不见双酶切的小片段,但是胶回收目的区域的胶,PCR验证还是有东西,我就遇到过此类情况。

现在是目的片段能隐约看到,但是载体像是切不开....
4楼2015-06-24 16:13:16
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li201018

至尊木虫 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 雨中飞蝶 at 2015-06-24 16:08:57
但是看不到东西,怎么判断条带出现的区域呢?...

你直接用连接后的表达质粒为模板,跑PCR看有木有条带就知道表达载体有木有连接上目的条带。
低调!务实!
5楼2015-06-24 16:28:45
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wuwenmei

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-06-25 22:11:03
载体双酶切电泳应该看不到被切开条带吧。切开就是十几个bp而已,你直接胶回收做连接看看能不能连上就好的嘛。
下雨天就算没有伞,我也要学会努力奔跑!
6楼2015-06-25 14:29:34
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易水秋寒

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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你确认载体上有EcoR I和Xho I的酶切位点吗?你再查查看吧,我看到的pMD-18载体序列上没有Xho I的酶切位点。
8楼2015-06-26 08:31:30
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雨中飞蝶

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by bright8 at 2015-06-25 21:21:42
载体双酶切以后,跑胶看不大切下来的条带,太小了,建议你直接连接,再做菌落PCR就知道啦。我实验室用的酶都是NEB的,比Takara要好一点啦,说明书上15min,我一般切20h ,效果要好一点。按照说明书上,只有部分切开 ...

你是切20个小时?这么久,酶自身的活性不会失活吗?
10楼2015-07-01 14:36:51
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