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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 测序的序列比对问题！
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su-qiong

新虫 (初入文坛)

[交流] 测序的序列比对问题！ 已有4人参与

将测序回来的序列在NCBI上进行比对，结果如下图。为什么会出现有大写也有小写的？求高手帮帮忙！

测序的序列比对问题！
(V25HTLH%)%0$Y1VO4KU5E1.jpg
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1楼 2014-10-08 14:56:22
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2007090351

铜虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小写部分为低复杂度的序列，像简单重复序列等。
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4楼2014-10-11 15:04:10
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去哪里看海

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 鼓励交流 2014-10-13 09:15:43
这个比对的方式不对，换换选项，我记不清了，这只是其中一种显示结果的方式而已，还有其他的
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2楼2014-10-08 21:10:14
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bbqlhb

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-11 23:02:10
参考这个http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7050668
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3楼2014-10-09 09:38:36
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反应链

新虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-10-11 23:02:34
序列比对，DNAMAN软件很好用

1.从NCBI下载参考序列

2. 在DNAMAN软件中，测序序列与参考序列比对。可参考这个“分子生物学专业软件DNAMAN使用方法介绍”http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7931091&fpage=1&target=blank
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5楼2014-10-11 19:17:54
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