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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 测序完之后，怎么看测序结果？请指教
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wanglixia815

新虫 (正式写手)

[求助] 测序完之后，怎么看测序结果？请指教 已有2人参与

我现在拿到了测序结果，每个样里有三个文件如图1。我是要鉴别种类的用unite网站，可是目前不会看结果，如图2，怎样的图算是可以用来鉴别种类的
还有就是你们有没有用过unite 网站  怎么使用这个网站做blast 分析  鉴别种类啊。。谢谢各位了

测序完之后，怎么看测序结果？请指教
1.jpg


测序完之后，怎么看测序结果？请指教-1
2.jpg
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有点矛盾。有点纠结
1楼 2014-05-27 19:37:27
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-05-27 22:58:16
我鉴别种类是先将测序结果到NCBI blast 一下
然后将序列下载,用MEGA6画进化树就哦了
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
2楼2014-05-27 22:11:05
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼上正解。你这个是单向序列吧？一般是用NCBI，.unite 网站没用过。
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学习使你立于不败之地
3楼2014-05-28 18:04:20
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wanglixia815

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-27 22:11:05
我鉴别种类是先将测序结果到NCBI blast 一下
然后将序列下载,用MEGA6画进化树就哦了

能说的详细点吗？从来也没有接触过这个分子生物。画进化树？。
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有点矛盾。有点纠结
4楼2014-05-28 19:30:11
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wanglixia815

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by yuren2009 at 2014-05-28 18:04:20
楼上正解。你这个是单向序列吧？一般是用NCBI，.unite 网站没用过。

哎 完全是0基础。。单向序列？不清楚呀。。
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有点矛盾。有点纠结
5楼2014-05-28 19:57:02
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人
引用回帖:
4楼: Originally posted by wanglixia815 at 2014-05-28 19:30:11
能说的详细点吗？从来也没有接触过这个分子生物。画进化树？。...

序列给我，我教你吧。
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人生贵在行动，迟疑不决时，不妨先迈出小小一步。
6楼2014-05-29 09:41:13
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wanglixia815

新虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-29 09:41:13
序列给我，我教你吧。...

太好了，谢谢啦
两个样品的序列
第一个
ATTTTTTTTTTAATCTTAAATTATATTGGGAAAAAGACTAATATATATAG
TTTTAGAATGACCCTTAGAGGAGGACCCTTTACTCGACCCGCGCCGTTCC
TTTTTTTCACCCTAGACCGCCGAAGGGGTGCAACGGCTTTTTCTCCGGTA
AGTATTTAACAAATGACCGGACCTTCGCCGGCACCCTCCAAGTTCAATCC
CCA
第二个
CTCCGGTACTCAAGATGATGAGAGGTCAAAGTCATATGTATATATCGTCC
GAGAGGACCTTTGGAAGCGGACCTTAAGCTCGACCGCAGCGCAACATCAT
TATCACGCTGAACGGCCAGAGGCGCAAAAGGCATTTTCTCCGCTGATGCA
TTTAAAGAGGAGCCGACCTTCGCCAGCACGCTCCAAGTCCAATCCCCACC
GAAACGAATCGGAGGGGTTGAGGATTTAATGACACTCAAACAGGCATGCC
CCTCGGAATACCAAGGGGCGCAAGGTGCGTTCAAAGATTCGATGATTCAC
TGAAAATCTGCAATTCACATTACTTATCGCATTTCGCTGCGTTCTTCATC
GATGCGAGAGCCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGTTGTATAGTTTTCTTTCG
TTACGTTTTCAAGGCAACGAAATGGGTTTACATTCTATTAGACATTCAGA
TTATATGATAAGACATAGGCCCGAAGGCCTACGGTGGGTTCACATGTGGG
GTTGGGAATCAAGGGCTCGGGCGTGCACATGCCCCGAGAGGGCAGCGACA
ACCCTCGCCTACGATTCGATAATGATCCTTCCGCAGGGTCACCTACGGAA
ACCTTGGTACCACTTTTACTTCCTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATGAGA
ATTGG
还有一个问题就是，我在unite上blast 粘贴序列发现大多数可以鉴别，相似度是在百分之多少才是可信的。。假如我的粘贴上去的序列有99%相似的，那么我还用看，那个图好不好嘛，还是只要我可以鉴别种类，不用看图好不好了？谢谢啦
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有点矛盾。有点纠结
7楼2014-05-30 14:43:38
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