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wanglixia815

新虫 (正式写手)

[求助] 测序完之后,怎么看测序结果?请指教已有2人参与

我现在拿到了测序结果,每个样里有三个文件如图1。我是要鉴别种类的用unite网站,可是目前不会看结果,如图2,怎样的图算是可以用来鉴别种类的
还有就是你们有没有用过unite 网站  怎么使用这个网站做blast 分析  鉴别种类啊。。谢谢各位了

测序完之后,怎么看测序结果?请指教
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测序完之后,怎么看测序结果?请指教-1
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有点矛盾。有点纠结
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wanglixia815

新虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-29 09:41:13
序列给我,我教你吧。...

太好了,谢谢啦
两个样品的序列
第一个
ATTTTTTTTTTAATCTTAAATTATATTGGGAAAAAGACTAATATATATAG
TTTTAGAATGACCCTTAGAGGAGGACCCTTTACTCGACCCGCGCCGTTCC
TTTTTTTCACCCTAGACCGCCGAAGGGGTGCAACGGCTTTTTCTCCGGTA
AGTATTTAACAAATGACCGGACCTTCGCCGGCACCCTCCAAGTTCAATCC
CCA
第二个
CTCCGGTACTCAAGATGATGAGAGGTCAAAGTCATATGTATATATCGTCC
GAGAGGACCTTTGGAAGCGGACCTTAAGCTCGACCGCAGCGCAACATCAT
TATCACGCTGAACGGCCAGAGGCGCAAAAGGCATTTTCTCCGCTGATGCA
TTTAAAGAGGAGCCGACCTTCGCCAGCACGCTCCAAGTCCAATCCCCACC
GAAACGAATCGGAGGGGTTGAGGATTTAATGACACTCAAACAGGCATGCC
CCTCGGAATACCAAGGGGCGCAAGGTGCGTTCAAAGATTCGATGATTCAC
TGAAAATCTGCAATTCACATTACTTATCGCATTTCGCTGCGTTCTTCATC
GATGCGAGAGCCAAGAGATCCGTTGTTGAAAGTTGTATAGTTTTCTTTCG
TTACGTTTTCAAGGCAACGAAATGGGTTTACATTCTATTAGACATTCAGA
TTATATGATAAGACATAGGCCCGAAGGCCTACGGTGGGTTCACATGTGGG
GTTGGGAATCAAGGGCTCGGGCGTGCACATGCCCCGAGAGGGCAGCGACA
ACCCTCGCCTACGATTCGATAATGATCCTTCCGCAGGGTCACCTACGGAA
ACCTTGGTACCACTTTTACTTCCTAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATGAGA
ATTGG
还有一个问题就是,我在unite上blast 粘贴序列发现大多数可以鉴别,相似度是在百分之多少才是可信的。。假如我的粘贴上去的序列有99%相似的,那么我还用看,那个图好不好嘛,还是只要我可以鉴别种类,不用看图好不好了?谢谢啦
有点矛盾。有点纠结
7楼2014-05-30 14:43:38
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2014-05-27 22:58:16
我鉴别种类是先将测序结果到NCBI blast 一下
然后将序列下载,用MEGA6画进化树就哦了
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-05-27 22:11:05
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yuren2009

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
楼上正解。你这个是单向序列吧?一般是用NCBI,.unite 网站没用过。
学习使你立于不败之地
3楼2014-05-28 18:04:20
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wanglixia815

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-27 22:11:05
我鉴别种类是先将测序结果到NCBI blast 一下
然后将序列下载,用MEGA6画进化树就哦了

能说的详细点吗?从来也没有接触过这个分子生物。画进化树?。
有点矛盾。有点纠结
4楼2014-05-28 19:30:11
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