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园园补补

铁虫 (小有名气)

[求助] 为什么提取RNA时出现一坨白色沉淀 已有13人参与

提取RNA快一年时间了,之前提取效果一直很好,可是近两次却出现了出题:用Trizol提取RNA,加入异丙醇离心后就会出现一坨白色沉淀,用75%乙醇洗涤沉淀离心后依旧有很明显的白色沉淀,检测的A260/A280比值低于1.8,A260/A230比值低于2.0,(之前的实验没有出现过很明显的白色沉淀,而且A260/A280和A260/A230比值都很正常)。。。很困惑,实验没办法进行了。。。
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as321616

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
园园补补(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-11-12 20:31:54
以前遇到过这种问题。这样处理,加入氯仿离心分层后,吸取上清需要小心,不要吸到中层白色的东西或下层红色有机相,否则pellet会有不溶于水的白色沉淀。如果楼主不介意提取量,取一部分上清就可以了,剩下的不要,这样可以避免蛋白或多糖污染。用这种方法,260/230 一般都能到1.9以上。
希望能帮到。
30楼2014-06-16 13:20:47
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曼舞流苏

新虫 (小有名气)

引用回帖:
25楼: Originally posted by huanzhizhu at 2014-06-14 11:31:26
同感,基本每次提取RNA都会出现某些管子白色沉淀,看了此楼瞬间表示伤不起!...

额额,伤不起是什么个情况嘛?难道白色沉淀不是RNA?越是没有表示越纯?瞬间凌乱了。。。。反正我前三个管子在弃上清时候发现有一坨白色沉淀,干燥时候没有及时观察,干燥的久了一些,我一看,里面东西没有了,变透明了,吓了我一跳,目测这三管不大好溶解啊,后面几组就及时溶解了,后天跑PCR,希望结果良好。
27楼2014-06-14 11:44:08
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普通回帖

飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-05-27 19:04:44
楼主,请仔细看下我们的步骤:
按照TRizol一步法制备总RNA,其步骤简述如下:取膜荚黄芪的叶片500 mg,于液氮预冷的研钵中,液氮速冻后充分研磨成粉末,加入到加有5 mL TRizol的15 mL离心管中,混匀,室温放置5 min,使其充分裂解12 000 rpm,离心5 min,弃沉淀。加入1mL氯仿,震荡混和均匀后放于冰上15 min,于4 ℃,12000 rpm 离心15min。取上清液到新的离心管中,加入等量体积异丙醇,颠倒混合均匀,-20℃ 放置20 min以上,4 ℃,12 000 rpm离心10 min。去上清,加入5 mL 75 %冰乙醇,悬浮沉淀,4℃,12 000 rpm离心5 min,去上清,重复2次。在室温阴凉处空气干燥或真空干燥RNA沉淀。加入50 μL DEPC H2O溶解RNA,将抽提好的总RNA 保存于-70 ℃冰箱中。
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
2楼2014-05-27 14:43:40
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-05-27 19:04:55
很明显,那陀东西不是你要的RNA咯,一般是糖没有除干净。

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-05-27 15:13:23
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园园补补

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-27 14:43:40
楼主,请仔细看下我们的步骤:
按照TRizol一步法制备总RNA,其步骤简述如下:取膜荚黄芪的叶片500 mg,于液氮预冷的研钵中,液氮速冻后充分研磨成粉末,加入到加有5 mL TRizol的15 mL离心管中,混匀,室温放置5 mi ...

方法其实都是大同小异,我之前就是用Trizol一步法制备,都没出现过这种白色沉淀现象,只是最近两次才出现的,会不会是我用的试剂出现问题了或是被污染了。。。
4楼2014-05-28 09:34:37
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园园补补

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-05-27 15:13:23
很明显,那陀东西不是你要的RNA咯,一般是糖没有除干净。

是否可以用氯仿再次抽提一下
5楼2014-05-28 09:35:06
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飞约疯人院

专家顾问 (著名写手)

科学怪人

引用回帖:
4楼: Originally posted by 园园补补 at 2014-05-28 09:34:37
方法其实都是大同小异,我之前就是用Trizol一步法制备,都没出现过这种白色沉淀现象,只是最近两次才出现的,会不会是我用的试剂出现问题了或是被污染了。。。...

那就重新配药品吧,用DEPC处理过的水,可能有污染了
人生贵在行动,迟疑不决时,不妨先迈出小小一步。
6楼2014-05-28 09:56:38
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 园园补补 at 2014-05-28 09:35:06
是否可以用氯仿再次抽提一下...

除糖一般是加盐的

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2014-05-28 11:06:12
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园园补补

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 飞约疯人院 at 2014-05-28 09:56:38
那就重新配药品吧,用DEPC处理过的水,可能有污染了...

打算试试。。。
8楼2014-05-28 14:23:31
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园园补补

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-05-28 11:06:12
除糖一般是加盐的
...

什么?可以具体点儿不
9楼2014-05-28 14:24:14
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hailey

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也怀疑楼主所用东西污染了。。
时刻为梦想而战!!
10楼2014-05-28 16:13:14
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