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引物设计跨内含子
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061719
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引物设计跨内含子
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请问各位,所谓的引物设计跨内含子,指的是上游或者下游引物设计在两个外显子上,还是上游引物在一个外显子上,下游引物在另一个外显子上?
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【求助/交流】外显子和内含子??
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1楼
2014-05-15 20:33:18
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2014-05-15 21:04:07
061719: 金币+2
2014-05-21 21:43:40
上游引物在一个外显子上,下游引物在另一个外显子上。这样可以通过你的pcr产物大小来坚定你的cdna里面是否有gdna污染,通常用于rrt-pcr中
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2楼
2014-05-15 20:41:01
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061719: 金币+3
2014-05-21 21:43:44
都可以,最好一条引物跨2个外显子;如果内含子很大,引物分别在2个外显子上,效果也很好
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3楼
2014-05-16 10:15:10
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grase
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3楼
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Originally posted by
jurkat.1640
at 2014-05-16 10:15:10
都可以,最好一条引物跨2个外显子;如果内含子很大,引物分别在2个外显子上,效果也很好
4楼
2014-05-23 09:46:37
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Renjingyu
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at 2014-05-15 20:41:01
上游引物在一个外显子上,下游引物在另一个外显子上。这样可以通过你的pcr产物大小来坚定你的cdna里面是否有gdna污染,通常用于rrt-pcr中
如果有gdna的污染会出现什么情况?
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即将加入研究生的大军,迷茫!
5楼
2014-05-23 11:12:43
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2014-05-23 17:16:57
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5楼
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Originally posted by
Renjingyu
at 2014-05-23 11:12:43
如果有gdna的污染会出现什么情况?...
假如你的PCR理论产物长度是200BP(从cDNA中扩增出来的), 在没有gDNA污染的情况下。
如果你的两个exon之间的intron大小是1000bp(在基因组中,非mRNA),然后你又gdna污染的话,你的rtpcr产物长度就会变成1200bp和200bp了,那个1200bp就是证明你的cdna里面有gdna污染,说明你提取的mrna就有问题了
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6楼
2014-05-23 15:54:57
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6楼
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DAX1
at 2014-05-23 15:54:57
假如你的PCR理论产物长度是200BP(从cDNA中扩增出来的), 在没有gDNA污染的情况下。
如果你的两个exon之间的intron大小是1000bp(在基因组中,非mRNA),然后你又gdna污染的话,你的rtpcr产物长度就会变成1200bp和 ...
现在我的结果是220,p出来内含子的一部分
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼
2014-05-24 23:39:51
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