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小牛石刀

新虫 (初入文坛)

[求助] RNA提取,怎么老是降解?求指导!! 已有6人参与

最近在提取植物(苜蓿)RNA,用的是博迈德的RNA提取试剂盒,多次提取经过琼胶电泳,条带都很弥散,降解的厉害,求助原因!


     枪头、离心管都是进口的;
     4度离心;
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

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gyesang: 金币+4, 鼓励回帖交流! 2014-03-31 22:20:18
gyesang: 回帖置顶 2014-03-31 22:20:25
引用回帖:
16楼: Originally posted by 283503264 at 2014-03-27 22:01:50
请问大神,我提的rna5s带比其他两条带亮得多,是什么原因,有问题不
...

用agarose gel判断total RNA的完整性,最重要的指标是条带的完整性,也就是说,在28S 18S之间,两者的上下方,有没有弥散性的条带,注意是弥散性而不是很sharp的条带,因为这个取决于你的上样量,你要是跑10μg甚至更多的total RNA,这些地方就能看见其他的sharp 条带。一般而言上500 ng足矣。
因为一般跑total RNA不会用很高浓度的胶,1.5%最高了,所以5S和tRNA经常是一个smear状的,1%左右的时候无法区分5S和tRNA,高一点还可以看见5S下方还有一个弥散性的tRNA。这些小RNA因为是smear状的,所以经常显得亮一些。
最后,如果你是跑的EB胶先加到agarose里面的,要注意多跑一会,这个经常出现,不单单是total RNA,个人理解是这些较大的条带还没有充分吸收EB,如果你就跑一会会,肯定是最小的最亮。
20楼2014-03-28 07:55:44
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wanjunfei153

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by biostar2009 at 2014-03-27 09:40:12
只要你不往管子里吐口水,RNA几乎不会降解,我抽的RNA经常桌上放好几天放忘了,拿去测序还是好好的。我们的枪头都是实验室大叔徒手抓进盒子的,虽说也是进口的散装的。
如果你用的试剂,实验室其余人搞得好,只有在 ...

你确定你提取的是RNA?
7楼2014-03-27 12:38:32
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-03-27 15:12:45
只要你不往管子里吐口水,RNA几乎不会降解,我抽的RNA经常桌上放好几天放忘了,拿去测序还是好好的。我们的枪头都是实验室大叔徒手抓进盒子的,虽说也是进口的散装的。
如果你用的试剂,实验室其余人搞得好,只有在你这才出问题,那么你首先看看你的材料有没有问题,比如细胞,是不是已经半死不活了,这种细胞RNA已经开始降解了。
然后你检测RNA跑得胶,有没有问题,要是别人有确认好的样品你可以带上一个。
6楼2014-03-27 09:40:12
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biostar2009

专家顾问 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by wanjunfei153 at 2014-03-27 12:38:32
你确定你提取的是RNA?...

哈哈,哈哈,哈哈
哎~
9楼2014-03-27 14:04:35
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Hliotrope

木虫 (著名写手)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-27 15:12:54
还是操作问题吧,RNA酶很多地方都存在,稍不注意就进去了,带口罩,带手套,低温操作,没提过,但是看别人提过,反正比DNA严的多。。。
Someone
4楼2014-03-27 09:05:28
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普通回帖

dizang2

新虫 (小有名气)

低温提取,depc水

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2014-03-26 23:39:15
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a315188797

新虫 (初入文坛)

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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-27 15:12:50
请问你们实验室有荧光PCR仪吗?如果没有的话,就得先普通PCR扩增后才能进行凝胶电泳,不然基本扩增不出来,如果有荧光PCR仪,效果会更好。
3楼2014-03-27 08:32:51
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WAX2010

银虫 (小有名气)

★ ★
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-03-27 15:12:58
有Trizol的话可以用Trizol试一试,我们这边一师姐用试剂盒降解,用Trizol不降解
大手牵小手
5楼2014-03-27 09:34:43
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cgspider

木虫 (正式写手)

戴手套!

台面要仔细消毒,找人少的房间,尽量避免一切人闲杂等。
你的能力撑不起你的野心
8楼2014-03-27 13:32:40
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_hwq

新虫 (初入文坛)

你试剂盒是新的吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-03-27 14:09:45
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