| 查看: 1522 | 回复: 10 | |||
[求助]
测序结果的问题
|
|
我做了一批PCR的样品进行测序，用的引物是ITS1Pl （TCCGTAGGTGAACCTGCGGA）ITS1P2（GCTGCGTTCTTCATCGATGC），ITS2P1（GCATCGATGAAGAACGCAGC），ITS2P2（TCCTCCGCTTATTGATATGC），等测序结果出来后，测序方返回给我的是拼接结果，可我怎么都不能在结果中找到我的引物序列，然后我电话咨询后说的是拼接结果无引物序列，求助各位高手啊，那我怎么在一段拼接序列中分辨出哪一段是ITS1Pl和ITS1P2，哪一段是ITS2P1和ITS2P2还有5末端的基因序列啊 求助啊啊啊 这是我的一个拼接结果 TGGTAAGTAAAAATCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAGACCGAAAATATCGAGCGAT TCGGAGAACCCGTGAATAAGTGGCGGCGGTTGCTGCCGCAGAACAGCCATCCCAGTCGCCGCCTCGTCTCCTTCAGGGGG GGCGGGGGCACGATGAAGGATGGATGAAAACTCAAACCGGCGCAGCTCCGCGCCAAGGGTATGTAGAGACGCGAGCCCTG CAACGGGTTCAGTGGCGTGGAGTGCTGTCGCACACCATGTGGATTATAACACGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCT CGCATCGATGAAGAGCGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGCGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA AGTTGCGCCCGAGGCCAACCGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCAAGCGTTGCGTCGCTCCGTGCCGACTCCGTCCC ACAAACGCGTGCGCCGGCGTCGGCTCGGACGTGAAGAGTGGCTCGTCGTGCCCATCGGTGCGGCGGGCTCAAGAGCGGGT TATCGTCTCGTCGGCCGGCAACAACAAGGGGTGGATGAAAGCTGTGAGCAGAAAGCCTGCGTTGTTTCTTGCTCGGCCCG AGGAAAGATTACATATTTCAAGGTGATCCCAGCCCATGCGCCGATCCACAGGCGGCGGCTTGGAATGCGACCCCAGGATG GGCGAGGCCACCCGCCGAGTTTAAGCATATCAATA |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有228人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 我有很多测序的结果，请问怎么建树？？
已经有7人回复
- 关于3' RACE 测序结果分析。
已经有4人回复
- PCR测序结果分析
已经有8人回复
- 测序结果中出现一个Gap怎么办
已经有6人回复
- 紧急求助5‘RACE（测序结果问题）
已经有10人回复
- 基因测序结果比对
已经有5人回复
- 测序得到的结果不对，不知道是比对错误，还是其他什么问题？？？
已经有3人回复
- 大片段DNA测序的问题
已经有7人回复
- 目的蛋白序列连接pet15b测序结果正确为何不表达
已经有7人回复
- 请教一个关于测序结果的问题
已经有19人回复
- 克隆过程出现的问题
已经有7人回复
- 测序结果比对问题
已经有16人回复
- 测序结果怪异
已经有10人回复
- 帮忙分析下测序结果，谢谢阿
已经有5人回复
- 克隆测序的问题
已经有3人回复
- 请教一个关于测序峰图的问题
已经有5人回复
- 測序結果不理想 求教版主
已经有7人回复
- 测序结果的疑问
已经有7人回复
- 16S rDNA测序问题
已经有3人回复
- 关于乳酸菌16srRNA测序的问题
已经有11人回复
- 可以推荐关于测序图怎么读，测序结果怎么分析的书籍么
已经有5人回复
- 【求助/交流】克隆-定量-测序，结果怪异
已经有8人回复
- 【求助/交流】基因测序结果分析问题
已经有9人回复
- 【求助/交流】测序结果的疑议
已经有19人回复
yang0071
木虫 (职业作家)
- 应助: 207 (大学生)
- 金币: 1573.4
- 散金: 9319
- 红花: 21
- 帖子: 4041
- 在线: 647.7小时
- 虫号: 50941
- 注册: 2004-07-15
- 性别: GG
- 专业: 生物化学
2楼2013-11-05 11:29:32
沙门小rna
金虫 (正式写手)
- MolEPI: 1
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 1117.7
- 散金: 5
- 红花: 6
- 沙发: 6
- 帖子: 644
- 在线: 76.7小时
- 虫号: 2012528
- 注册: 2012-09-19
- 专业: 病原细菌、细菌感染与宿主
3楼2013-11-05 12:29:07
4楼2013-11-06 08:36:35
5楼2013-11-06 08:37:14
gyesang
荣誉版主 (著名写手)
-
专家经验: +24 - MolEPI: 31
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 2.689
- 金币: 24334.9
- 散金: 1088
- 红花: 88
- 沙发: 2
- 帖子: 2327
- 在线: 623.1小时
- 虫号: 849017
- 注册: 2009-09-16
- 性别: GG
- 专业: 细胞信号转导
- 管辖: 分子生物
6楼2013-11-06 10:23:45
7楼2013-11-07 08:38:59
8楼2013-11-07 08:49:11
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+10, 鼓励交流！ 2013-11-07 15:54:01
gyesang: 回帖置顶 2013-11-07 15:54:12
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+10, 鼓励交流！ 2013-11-07 15:54:01
gyesang: 回帖置顶 2013-11-07 15:54:12
| PCR测序拼接结果里面是没有引物序列的，用PCR引物作为测序引物进行测序时，所测序列是从引物3’末端后第一个碱基开始的，所以自然就找不到您的引物序列了。有两种方法可以得到您的引物序列。对于较短PC产物（<800bp），可以用另一端的引物进行测序，从另一端测序可以一直测到序列的末端，就可以在序列的末端得到您的引物的反向互补序列。对于较长的序列，一个测序反应测不到头，因此就只能将您的PCR产物片 段克隆到适当的载体中，用载体上的通用引物进行测序。由于载体上的通用引物与您的插入序列之间还有一段距离，因此就可以得到您的完整的引物序列。由于在测序的起始端总会有一些碱基无法准确读出，因此您如果想得到您PCR产物的完整序列，最好克隆后进行测序。 |
9楼2013-11-07 10:57:40
gyesang
荣誉版主 (著名写手)
-
专家经验: +24 - MolEPI: 31
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 2.689
- 金币: 24334.9
- 散金: 1088
- 红花: 88
- 沙发: 2
- 帖子: 2327
- 在线: 623.1小时
- 虫号: 849017
- 注册: 2009-09-16
- 性别: GG
- 专业: 细胞信号转导
- 管辖: 分子生物
10楼2013-11-07 15:53:43
20