24小时热门版块排行榜    

查看: 2674  |  回复: 4

fengyunqb

新虫 (小有名气)

[求助] 关于3' RACE 测序结果分析。

我做的3'RACE 2nd PCR只出现一个片段,并且特别亮,(其实这个片段比比预期的小点)于是乎将他那去测序,得到结果。但我不能确定是否走到头了,我在NCBI里面BLAST发现3'端比同源的基因短。我在测序结果3'端发现有AATAAA这个所谓的POLYA。求指点,如何确定这个3'端是否完整,有经验的老师指点一下。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengyunqb

新虫 (小有名气)

AATAAATATTTATTGTTTGAGCACAAAAAAA
这是测序结尾。
2楼2012-12-22 10:37:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jk_xdx

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
fengyunqb: 金币+4, ★★★很有帮助 2012-12-25 17:01:22
fengyunqb: 金币+6, ★★★★★最佳答案 2013-03-12 08:41:38
看测序波形图,如果poly A 部分是单峰,应该是到头了,如果是套峰,很可能没到头,在靠近3'端的位置再设计引物继续做.(我说的"polyA "不是指"AATAAATA",而是你后面那个"AAAAAAA"
3楼2012-12-25 15:50:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fengyunqb

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jk_xdx at 2012-12-25 15:50:03
看测序波形图,如果poly A 部分是单峰,应该是到头了,如果是套峰,很可能没到头,在靠近3'端的位置再设计引物继续做.(我说的"polyA "不是指"AATAAATA",而是你后面那个"AAAAAAA"

被你说中了,是套峰,其实我也知道这次测序有问题,我是直接PCR产物测序的,就是懒,不想做了。我在想不影响后面的表达的话就这样算了。想做5'RACE了。
4楼2012-12-25 17:01:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王萌萌1992

新虫 (初入文坛)

请问你后来做出来了吗?怎么做出来的?我现在是跟你一样的情况
5楼2015-06-23 17:53:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 fengyunqb 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +4 简单化xn 2026-08-22 8/400 2026-08-23 07:20 by ilovexiaobin
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 11/550 2026-08-23 02:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 zjuhero 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[教师之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 4/200 2026-08-22 16:52 by sunzitan
[基金申请] 人气不行了 +8 fansofjerry 2026-08-21 8/400 2026-08-22 16:30 by zyqchem
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +16 kkkl_v 2026-08-19 17/850 2026-08-22 16:12 by 阿布Abu
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见