24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1361  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

onizukacus

金虫 (初入文坛)

[求助] 测序结果的问题

我做了一批PCR的样品进行测序,用的引物是ITS1Pl        (TCCGTAGGTGAACCTGCGGA)ITS1P2(GCTGCGTTCTTCATCGATGC),ITS2P1(GCATCGATGAAGAACGCAGC),ITS2P2(TCCTCCGCTTATTGATATGC),等测序结果出来后,测序方返回给我的是拼接结果,可我怎么都不能在结果中找到我的引物序列,然后我电话咨询后说的是拼接结果无引物序列,求助各位高手啊,那我怎么在一段拼接序列中分辨出哪一段是ITS1Pl和ITS1P2,哪一段是ITS2P1和ITS2P2还有5末端的基因序列啊



求助啊啊啊


这是我的一个拼接结果
TGGTAAGTAAAAATCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAGACCGAAAATATCGAGCGAT
TCGGAGAACCCGTGAATAAGTGGCGGCGGTTGCTGCCGCAGAACAGCCATCCCAGTCGCCGCCTCGTCTCCTTCAGGGGG
GGCGGGGGCACGATGAAGGATGGATGAAAACTCAAACCGGCGCAGCTCCGCGCCAAGGGTATGTAGAGACGCGAGCCCTG
CAACGGGTTCAGTGGCGTGGAGTGCTGTCGCACACCATGTGGATTATAACACGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCT
CGCATCGATGAAGAGCGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGCGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA
AGTTGCGCCCGAGGCCAACCGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCAAGCGTTGCGTCGCTCCGTGCCGACTCCGTCCC
ACAAACGCGTGCGCCGGCGTCGGCTCGGACGTGAAGAGTGGCTCGTCGTGCCCATCGGTGCGGCGGGCTCAAGAGCGGGT
TATCGTCTCGTCGGCCGGCAACAACAAGGGGTGGATGAAAGCTGTGAGCAGAAAGCCTGCGTTGTTTCTTGCTCGGCCCG
AGGAAAGATTACATATTTCAAGGTGATCCCAGCCCATGCGCCGATCCACAGGCGGCGGCTTGGAATGCGACCCCAGGATG
GGCGAGGCCACCCGCCGAGTTTAAGCATATCAATA
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-05 12:29:07
直接把你pcr的序列和测序回来的结果放到blast 里面。两两比对。3秒钟解决测序比对~

你好,我不加进去ID是99%,我加进去了还是99%。。这什么情况啊请问。还有事随便插入吗
4楼2013-11-06 08:36:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yang0071 at 2013-11-05 11:29:32
你先把pcr产物连接到载体上
要求公司整个样品测通
让公司把原始序列和拼接序列发给你再比对

我打过电话了,他们说就这有这个,,那我该怎么办啊?
5楼2013-11-06 08:37:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-06 10:23:45
对测序缺乏基本了解,一般测序时,引物及引物后面的50个碱基都是不准的,你用PCR时的引物测序,在测序结果中当然是找不到引物序列的

2楼正解!

我是做植化的,突然被抽来做DNA,头大啊,我已经打过电话了,测序方说没有那怎么办啦
7楼2013-11-07 08:38:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-06 10:23:45
对测序缺乏基本了解,一般测序时,引物及引物后面的50个碱基都是不准的,你用PCR时的引物测序,在测序结果中当然是找不到引物序列的

2楼正解!

请问下,我这测序结果不是应该有3段吗,1Pl段,1P2段,5末端段,请问下这怎么区分,我查了文献后都没找到
8楼2013-11-07 08:49:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 onizukacus 的主题更新
信息提示
请填处理意见