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onizukacus

金虫 (初入文坛)

[求助] 测序结果的问题

我做了一批PCR的样品进行测序,用的引物是ITS1Pl        (TCCGTAGGTGAACCTGCGGA)ITS1P2(GCTGCGTTCTTCATCGATGC),ITS2P1(GCATCGATGAAGAACGCAGC),ITS2P2(TCCTCCGCTTATTGATATGC),等测序结果出来后,测序方返回给我的是拼接结果,可我怎么都不能在结果中找到我的引物序列,然后我电话咨询后说的是拼接结果无引物序列,求助各位高手啊,那我怎么在一段拼接序列中分辨出哪一段是ITS1Pl和ITS1P2,哪一段是ITS2P1和ITS2P2还有5末端的基因序列啊



求助啊啊啊


这是我的一个拼接结果
TGGTAAGTAAAAATCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAGACCGAAAATATCGAGCGAT
TCGGAGAACCCGTGAATAAGTGGCGGCGGTTGCTGCCGCAGAACAGCCATCCCAGTCGCCGCCTCGTCTCCTTCAGGGGG
GGCGGGGGCACGATGAAGGATGGATGAAAACTCAAACCGGCGCAGCTCCGCGCCAAGGGTATGTAGAGACGCGAGCCCTG
CAACGGGTTCAGTGGCGTGGAGTGCTGTCGCACACCATGTGGATTATAACACGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCT
CGCATCGATGAAGAGCGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGCGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA
AGTTGCGCCCGAGGCCAACCGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCAAGCGTTGCGTCGCTCCGTGCCGACTCCGTCCC
ACAAACGCGTGCGCCGGCGTCGGCTCGGACGTGAAGAGTGGCTCGTCGTGCCCATCGGTGCGGCGGGCTCAAGAGCGGGT
TATCGTCTCGTCGGCCGGCAACAACAAGGGGTGGATGAAAGCTGTGAGCAGAAAGCCTGCGTTGTTTCTTGCTCGGCCCG
AGGAAAGATTACATATTTCAAGGTGATCCCAGCCCATGCGCCGATCCACAGGCGGCGGCTTGGAATGCGACCCCAGGATG
GGCGAGGCCACCCGCCGAGTTTAAGCATATCAATA
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沙门小rna

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
直接把你pcr的序列和测序回来的结果放到blast 里面。两两比对。3秒钟解决测序比对~
应助之星就是我~没错。你没有看错~
3楼2013-11-05 12:29:07
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yang0071

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰,手有余香。分子生物期待你更多精彩 。 2013-11-05 11:33:44
你先把pcr产物连接到载体上
要求公司整个样品测通
让公司把原始序列和拼接序列发给你再比对
2楼2013-11-05 11:29:32
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onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 沙门小rna at 2013-11-05 12:29:07
直接把你pcr的序列和测序回来的结果放到blast 里面。两两比对。3秒钟解决测序比对~

你好,我不加进去ID是99%,我加进去了还是99%。。这什么情况啊请问。还有事随便插入吗
4楼2013-11-06 08:36:35
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onizukacus

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yang0071 at 2013-11-05 11:29:32
你先把pcr产物连接到载体上
要求公司整个样品测通
让公司把原始序列和拼接序列发给你再比对

我打过电话了,他们说就这有这个,,那我该怎么办啊?
5楼2013-11-06 08:37:14
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