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onizukacus

金虫 (初入文坛)

[求助] 测序结果的问题

我做了一批PCR的样品进行测序,用的引物是ITS1Pl        (TCCGTAGGTGAACCTGCGGA)ITS1P2(GCTGCGTTCTTCATCGATGC),ITS2P1(GCATCGATGAAGAACGCAGC),ITS2P2(TCCTCCGCTTATTGATATGC),等测序结果出来后,测序方返回给我的是拼接结果,可我怎么都不能在结果中找到我的引物序列,然后我电话咨询后说的是拼接结果无引物序列,求助各位高手啊,那我怎么在一段拼接序列中分辨出哪一段是ITS1Pl和ITS1P2,哪一段是ITS2P1和ITS2P2还有5末端的基因序列啊



求助啊啊啊


这是我的一个拼接结果
TGGTAAGTAAAAATCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTGTCGAGACCGAAAATATCGAGCGAT
TCGGAGAACCCGTGAATAAGTGGCGGCGGTTGCTGCCGCAGAACAGCCATCCCAGTCGCCGCCTCGTCTCCTTCAGGGGG
GGCGGGGGCACGATGAAGGATGGATGAAAACTCAAACCGGCGCAGCTCCGCGCCAAGGGTATGTAGAGACGCGAGCCCTG
CAACGGGTTCAGTGGCGTGGAGTGCTGTCGCACACCATGTGGATTATAACACGACTCTCGGCAATGGATATCTCGGCTCT
CGCATCGATGAAGAGCGCAGCGAAATGCGATACGTGGTGCGAATTGCAGAATCCCGCGAACCATCGAGTCTTTGAACGCA
AGTTGCGCCCGAGGCCAACCGGCCAAGGGCACGTCTGCCTGGGCGTCAAGCGTTGCGTCGCTCCGTGCCGACTCCGTCCC
ACAAACGCGTGCGCCGGCGTCGGCTCGGACGTGAAGAGTGGCTCGTCGTGCCCATCGGTGCGGCGGGCTCAAGAGCGGGT
TATCGTCTCGTCGGCCGGCAACAACAAGGGGTGGATGAAAGCTGTGAGCAGAAAGCCTGCGTTGTTTCTTGCTCGGCCCG
AGGAAAGATTACATATTTCAAGGTGATCCCAGCCCATGCGCCGATCCACAGGCGGCGGCTTGGAATGCGACCCCAGGATG
GGCGAGGCCACCCGCCGAGTTTAAGCATATCAATA
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gyesang

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对测序缺乏基本了解,一般测序时,引物及引物后面的50个碱基都是不准的,你用PCR时的引物测序,在测序结果中当然是找不到引物序列的

2楼正解!
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2013-11-06 10:23:45
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gyesang

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引用回帖:
8楼: Originally posted by onizukacus at 2013-11-07 08:49:11
请问下,我这测序结果不是应该有3段吗,1Pl段,1P2段,5末端段,请问下这怎么区分,我查了文献后都没找到...

不明白你讲的这些啊
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
10楼2013-11-07 15:53:43
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