24小时热门版块排行榜    

查看: 1356  |  回复: 7

山水88

木虫 (正式写手)

[求助] PCR片段量少求教

由于要做重组,所以引物设计比较长,50bp同源序列加上20bp PCR引物,但是PCR片段量一直特别少,试了不同的恒定温度或者每循环降0.5度的方法,体系中也加了DMSO,结果都不理想,如图是8个不同的恒定温度结果,中上部亮度渐弱为目的片段,下面就是引物二聚体了,目前体系是2XTaq酶 10ul,质粒2ul,引物1ulX2,DMSO 1ul,ddH2O 5ul.求教各位大侠还有什么可以改进的地方呢?还望不吝赐教,鄙人感激不尽!!!!
PCR片段量少求教
1.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励应助! 2013-10-12 01:32:57
山水88: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-12 17:40:05
模板用量太大,PCR产物里都隐约看到质粒的带了。质粒模板用pg级别就可以了,把模板稀释100-1000倍使用。
2楼2013-10-11 23:58:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-10-11 23:58:31
模板用量太大,PCR产物里都隐约看到质粒的带了。质粒模板用pg级别就可以了,把模板稀释100-1000倍使用。

我一直都是这个体系的,以前结果都非常好呀,不过还是听你的建议做个验证,还有什么其它需要注意的么
3楼2013-10-12 10:01:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyongliangx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
山水88: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-10-12 17:39:48
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-10-14 14:26:51
山水88: 金币+20, ★★★很有帮助 2013-10-28 22:18:54
首先第一点:你用的是20ul体系,我记得TAQ 酶的说明书上建议的50ul体系是 25ul mix ,1ul引物(20uM),模板(0.1ng-10ng)/ul 加入1ul 。所以从你可以按着标准体系再重新配制一下。
第二,你的引物是长引物,在PCR的最初的循环中 ,只有与模板互补的那20bp 需要进行退火。所以如果你的退火温度是按着整个引物去设计,那是不合理的。
第三,不同的酶扩增的效率也不一样。

我给你的建议是 1.重新调整体系。2. PCR先进行6个低温的循环,温度按照那20碱基去计算。3. 可以换其他的酶 ,比如KOD系列的
4楼2013-10-12 16:13:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liyongliangx at 2013-10-12 16:13:47
首先第一点:你用的是20ul体系,我记得TAQ 酶的说明书上建议的50ul体系是 25ul mix ,1ul引物(20uM),模板(0.1ng-10ng)/ul 加入1ul 。所以从你可以按着标准体系再重新配制一下。
第二,你的引物是长引物,在PCR的 ...

非常感谢,我会尝试的,先谢谢了
5楼2013-10-12 17:08:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by liyongliangx at 2013-10-12 16:13:47
首先第一点:你用的是20ul体系,我记得TAQ 酶的说明书上建议的50ul体系是 25ul mix ,1ul引物(20uM),模板(0.1ng-10ng)/ul 加入1ul 。所以从你可以按着标准体系再重新配制一下。
第二,你的引物是长引物,在PCR的 ...

这两天又遇到情况了,2ul验证还能看到条带,跑回收胶就看不见清晰条带了,胶是一块制的,应该不是胶的问题,这是怎么回事呢???
6楼2013-10-14 13:57:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyongliangx

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

胶回收的上样孔会比较大,所以如果你本身的浓度不多,跑大孔条会变弱是属于正常现象。
是不是胶的问题,你看下你的MARKER,如果MARKER 没有问题那就不是胶的问题,如果MARKER都看不清,那你就只能重新配胶了。
如果你上面两个情况都不属于,那就只能说明你的PCR 是失败的
7楼2013-10-14 17:55:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

山水88

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by liyongliangx at 2013-10-14 17:55:48
胶回收的上样孔会比较大,所以如果你本身的浓度不多,跑大孔条会变弱是属于正常现象。
是不是胶的问题,你看下你的MARKER,如果MARKER 没有问题那就不是胶的问题,如果MARKER都看不清,那你就只能重新配胶了。
如 ...

硬着头皮回收了,结果还真有,又学习了。分子真是看不见摸不着,只能慢慢做了
8楼2013-10-14 19:00:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 山水88 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学工程321分求调剂 +10 大米饭! 2026-03-15 13/650 2026-03-17 06:57 by laoshidan
[考研] 0703化学336分求调剂 +3 zbzihdhd 2026-03-15 4/200 2026-03-16 23:52 by zbzihdhd
[基金申请] 国自科面上基金字体 +6 iwuli 2026-03-12 7/350 2026-03-16 21:18 by sculhf
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 机械专硕325,寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[基金申请] NSFC申报书里申请人简历中代表性论著还需要在申报书最后的附件里面再上传一遍吗 20+5 NSFC2026我来了 2026-03-10 14/700 2026-03-15 23:53 by 不负韶华的虎
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 0805,333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 0703,333分求调剂 一志愿郑州大学-物理化学 +3 李魔女斗篷 2026-03-11 3/150 2026-03-13 22:24 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 土木第一志愿276求调剂,科研和技能十分丰富,求新兴方向的导师收留 +3 土木小天才 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:01 by JourneyLucky
[考研] 328化工专硕求调剂 +4 。,。,。,。i 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:44 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 283求调剂,材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
信息提示
请填处理意见