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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » SYBR 荧光定量PCR 阴性对照问题
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冯可

新虫 (初入文坛)

[交流] SYBR 荧光定量PCR 阴性对照问题

反应条件：
98℃ 2min
40循环
98℃ 30s
53.6℃ 30s
72℃ 30s
72℃  7min
反应体系：
MightAmp mix （takara ） 10μL
引物（2μM）             1μL
引物（2μM）             1μL
模板                     2μL
水                       6μL
                                          20μL体系
问题：
1.前辈们看看 我这个图，无模板对照和阴性对照都出现扩增是不是不行啊？怎么去除呢？引物浓度调节我试过了，降低引物浓度是，阴性对照也会随之消失，但是却应先检出限。 将循环数减少至30个循环，阴性扩增会消失，但是不知道可不可性，同时还是影响检出限。 我在考虑增大退火温度是否可行呢？
求大家指点。郁闷啊 ~~~ 小弟刚入手。

图标说明结果说明：
孔        荧光基团        样本类型                   Cq        解链温度 1
A01-Ch5        SYBR        阳性对照          13.04        80.19
A02-Ch5        SYBR        阳性对照           13.17        80.13
A03-Ch5        SYBR        阳性对照           12.92        79.97
A04-Ch5        SYBR        阳性对照                 17.81        80
C03-Ch5        SYBR        阳性对照                 18.05        80.01
C01-Ch5        SYBR        无模板对照        32.32        80.17
C02-Ch5        SYBR        无模板对照        32.37        80.04
C05-Ch5        SYBR        阴性对照                 32.68        79.93
C06-Ch5        SYBR        阴性对照                  33.09        79.86
SYBR 荧光定量PCR 阴性对照问题
1.png


SYBR 荧光定量PCR 阴性对照问题-1
2.png
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1楼 2013-09-12 21:05:16
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sfj311

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
我做的也是这样，阴性很不稳定，至今还没找到答案
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5楼2014-09-15 10:56:34
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86964109

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-09-13 17:14:19
你这个是不是存在气溶胶污染啊
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2楼2013-09-13 08:16:53
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shwjs88

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
以前碰到过，跑到别的楼上借了点水，高压后再用，解决了。就是污染

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
3楼2013-09-14 13:34:20
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cxfans

铁杆木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
不用担心 我用的引物一直都有这样的问题。理论上说ct在33以上算是超出检测灵敏度范围的不可信数据。而且我每次ntc都有这样的现象，很难做到不出扩增的阴性对照。有说法是在加模板时换到另外一个房间（有条件的可以单批出一个房间做定量），但我没试过
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2013-09-15 10:26:35
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