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将军的石头

新虫 (初入文坛)

[求助] t载体酶切问题

各位好,我的一个基因连到了t载体上,基因大小为1500左右,想用c l a 1和xho1双切,这个基因上没有两个点,但是过夜酶切后跑胶后只有一条带,大小倒是4200左右,酶都没有问题,怎么回事呢,万分感谢
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将军的石头(myprayer代发): 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-04-29 15:35:12
ClaI的酶切识别序列是AT^CGAT,对dam甲基化敏感,dam甲基化序列是GATC,看看你加的ClaI酶切位点前的碱基是不是G,如果是G的话,这个酶切位点就被甲基化了,从普通大肠杆菌菌株中提取的质粒,用ClaI是切不开的,我觉得你切不开的原因在此,希望反馈的信息

[ Last edited by gyesang on 2013-4-27 at 13:51 ]
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2楼2013-04-27 13:45:23
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引用回帖:
5楼: Originally posted by 将军的石头 at 2013-04-28 23:57:56
我今天试了试分开切的,cla1切不开,不知道为什么...

我给你回了,让你看看ClaI是不是处在甲基化位点内,ClaI是不是被甲基化了,能把那一段序列发上来看看吗?

[ Last edited by gyesang on 2013-4-29 at 00:02 ]
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7楼2013-04-29 00:00:12
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引用回帖:
6楼: Originally posted by 将军的石头 at 2013-04-28 23:58:53
我问师姐也有这么说的,我回头查一查,谢谢,这个建议很重要,但是有解决的办法吗...

有,需要用到Dam-的菌株,比如JM110,把质粒转到这个菌里面,再抽质粒,就可以酶切开了
或者你重新设计引物啊,重新扩啊,很简单的事
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9楼2013-04-29 00:02:10
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11楼: Originally posted by 将军的石头 at 2013-04-29 00:07:21
atgctgctccaaggtctggtcgtggctggaggagccagctacgtccttcaaaagaaagcaccacactactcactcggcttttggacaactgcattcgctttcctcttcatttacttcaccatcgcccagacatggcgcatcattgtctacccacgcttcttcagtcctcttcggcacttgccgcgccctggcggtgga ...

你这个序列发的不对,我要的是,你设计引物合成的那个引物序列,这个发给我没用

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13楼2013-04-29 13:58:46
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12楼: Originally posted by 将军的石头 at 2013-04-29 00:10:03
jm109行吗,我们实验室没有jm110...

jm109是不行的,你可以去查查大肠杆菌的基因型,找dam-的菌株都可以,你可以重新设计引物,重新扩啊
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14楼2013-04-29 14:00:06
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