24小时热门版块排行榜    

查看: 1259  |  回复: 7
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

twisty

木虫 (正式写手)

newer

[求助] 系统发育树的建立

用phylipwx软件包中的neighbor建树,如何产生进化距离(节点处的数字)?

[ 来自科研家族 Natural Products家族 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

兼并碱基M=A/CR=A/GW=A/TS=G/CY=C/TK=G/TV=A/G/C&n...
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyasong

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by twisty at 2012-12-24 17:15:54
我的咸基为567bp,看文献也有人说删除的,但我不太具体的删除原则。是自己的序列保持不变,删除其他物种的序列么?首先感谢您如此认真的回复。...

按老师的说法,应该是这个意思。
7楼2012-12-24 19:10:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用MEGA不是更简单吗?我没有用过phylip,建议你用MEGA试试,网上也有很多教程,比较方便
2楼2012-12-19 12:36:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyasong

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
twisty: 金币+20, ★★★很有帮助, 希望能再详细些,让我们这些菜鸟也明白是究竞怎么回事,近乎满意,奖您金币,如能再详细些,必将再谢。 2012-12-20 09:33:24
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 欢迎提供资料,鼓励应助 2012-12-20 11:39:31
这个是MEG的构建进化树的方法,看看有没有帮助!
MEGA软件——系统发育树构建方法.docx(1.45MB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DYHiS4XRUAQA96c?p=130497
3楼2012-12-19 17:14:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

twisty

木虫 (正式写手)

newer

引用回帖:
3楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-19 17:14:32
这个是MEG的构建进化树的方法,看看有没有帮助!
MEGA软件——系统发育树构建方法.docx(1.45MB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DYHiS4XRUAQA96c?p=130497

我看了你给的文档,应该算是较的详细的了,但里边有个问题我不明白想追问您一下,那就是“比对完成后删除序列两端不能完全对齐的碱基。”这句话,请问这样做对结果没有影响么?这样做有什么依据吗?如果比对后有各别列只有一两个碱基,而其他处都是空的,是否也要删去?还有就是在比对的末尾处有很多参差不齐处,是否也要都删去?期待您的回复,谢谢!
兼并碱基M=A/CR=A/GW=A/TS=G/CY=C/TK=G/TV=A/G/C&n...
4楼2012-12-19 21:31:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 15/750 2026-03-02 18:47 by caszguilin
[考研] 289求调剂 +7 yang婷 2026-03-02 8/400 2026-03-02 18:44 by caszguilin
[考研] 275求调剂 +6 明远求学 2026-03-01 6/300 2026-03-02 18:40 by caszguilin
[考研] 化学,材料,环境类求调剂 +6 考研版棒棒 2026-03-02 6/300 2026-03-02 18:33 by caszguilin
[考研] 0703 总分319求调剂 +3 Xinyuu 2026-03-02 3/150 2026-03-02 17:20 by houyaoxu
[考研] 求调剂 +9 yunziaaaaa 2026-03-01 10/500 2026-03-02 15:18 by 半截的诗0927
[考研] 江苏省农科院招调剂1名 +4 Qwertyuop 2026-03-01 4/200 2026-03-02 14:27 by 升格阿达
[考研] 材料学硕318求调剂 +9 February_Feb 2026-03-01 9/450 2026-03-02 13:31 by njzyff
[考研] 338求调剂 +3 18162027187 2026-03-02 3/150 2026-03-02 13:12 by houyaoxu
[考研] 化工270求调剂 +8 什么名字qwq 2026-03-02 8/400 2026-03-02 13:03 by houyaoxu
[考研] 322求调剂 +3 熊境喆 2026-03-01 3/150 2026-03-02 08:44 by houyaoxu
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[基金申请] 刚录用,没有期刊号,但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 311求调剂 +6 亭亭亭01 2026-03-01 6/300 2026-03-01 15:41 by 324616
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 调剂 +3 简木ChuFront 2026-02-28 3/150 2026-03-01 11:46 by 王伟要上岸啊
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:19 by 馥安馥安
[硕博家园] 2025届双非化工硕士毕业,申博 +3 更多的是 2026-02-27 4/200 2026-03-01 10:04 by ztg729
[论文投稿] Optics letters投稿被拒求助 30+3 luckyry 2026-02-26 4/200 2026-03-01 09:06 by babero
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
请填处理意见