| 查看: 1955 | 回复: 7 | |||
[交流]
关于341F和534R引物的
|
|
这个问题一直都没有搞明白。 我的试验主要研究高氯酸盐还原混合菌。富集驯化的原泥来自于一般污水处理厂二沉池回流污泥。我做PCR-DGGE后，切胶，纯化，克隆，测序，建树。这套方法是沿用原先我们组有人用341F和534R来解析堆肥过程中微生物群落的变化。所以，测序结果基因片段长度都在180bp左右。用测序结果和NCBI中进行比对，几乎最大的MAX Ident的纯菌都是不可培养的，所以无法建立系统发育树，并且NCBI中高氯酸盐还原菌的片段在很长。看了大量关于高氯酸盐还原菌的文章，目前，没有用这套引物做这种菌的。文献中主要分为两类引物：一类是通用引物，27F和1429R，PCR后纯化，做克隆，建立文库，送出测序。一类是用功能性酶基因来设计引物。实在搞不明白，为啥没有人用341F和534R引物来做高氯酸盐还原菌？选择引物时，怎样根据自己研究的具体微生物来选择？是否要参考以上传到NCBI中纯菌的片段的大小来选择自己引物？ |
回复此楼» 猜你喜欢
小木虫没落了，除了祈祷帖子，几乎看不到有价值的帖子
已经有7人回复
-
国自然面上D口祈祷
已经有3人回复
-
内心匮乏
已经有12人回复
-
没收到消息，再次陪跑
已经有3人回复
-
E口会评
已经有10人回复
-
跨出版社商投稿
已经有3人回复
-
不要再数国自然申请书的 filecode 的分隔符个数了
已经有20人回复
-
明天E口面上会评
已经有9人回复
-
MSER送审了还被拒稿
已经有6人回复
-
祈祷青基必中
已经有16人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教关于画误差线的问题（误差线不显示）
已经有10人回复
- 关于《INTERNATIONAL JOURNAL OF ADVANCED ROBOTIC SYSTEMS》杂志的版面费问题
已经有36人回复
- 兼并引物 里边有多个兼并碱基好吗？
已经有24人回复
- 问问pet-28a克隆构建引物的问题
已经有12人回复
- 关于自谱和互谱计算
已经有5人回复
- 通过RT-PCR 获得了一段保守序列 接着如何设计RACE引物
已经有21人回复
- 急！关于nsfc申请代码的问题
已经有6人回复
- 嵌套PCR引物如何设计？目的片段434bp
已经有6人回复
- 引物加保护碱基
已经有7人回复
- 求助：PCR扩增片段测序结果引物中间多出150bp的片段
已经有5人回复
- 关于光导体和光致发光
已经有4人回复
- 关于离子液体的谱图解析
已经有9人回复
- 【求助/交流】关于DGGE，求助
已经有9人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
🙏 🙏 🙏
+5/628
-
重磅分享｜全链路AI材料研发闭环平台PULSE即将发布，重构新材料研发范式
+2/140
-
中南大学材料科学与工程学院招收2027年博士研究生（1-2名）
+1/127
-
中山大学医学院（深圳）招聘科研助理（生物信息学方向）
+1/80
-
祈福，求顺利！
+1/51
-
2027君科院博士研究生招生欢迎报考
+2/26
-
基金申请
+1/26
-
北京理工大学-集成电路与电子学院杰青团队-招博士后
+1/13
-
7月15日-21日暨南大学2027年研究生招生线上宣讲会直播重磅开启！
+1/11
-
中山大学孙逸仙纪念医院招收科研博士后
+1/10
-
干细胞毒理学研究组招收2027年硕博
+1/9
-
出国留学的目的是什么？
+1/4
-
PLA 技术：解锁空间蛋白互作，原位解析生命调控的分子密码
+1/4
-
nature子刊投稿状态求助：Editor Decision Started
+1/3
-
对-[(4,6-二氯-1,3,5-三嗪-2-基)氨基]苯磺酸钠
+1/3
-
【调研交流】氢燃料电池系统绿色设计评价标准——前期调研，想听真实需求
+1/2
-
评职称 / 毕业赶进度，期刊发表选刊、审稿节奏问题可交流答疑
+1/1
-
信息工程大学教授团队推免入伍研究生直招
+1/1
-
白细胞介素家族的结构多样性与免疫调控功能
+1/1
-
文献里的标杆，不一定接你的活儿——HUVEC转染的真实排坑复盘
+1/1
2楼2011-09-07 13:22:10
3楼2011-09-07 15:54:02
★ ★ ★
vs570588(金币+1):谢谢参与
adslye(金币+2): 鼓励新虫讨论，以后是不是可以说多点，把一句话说完（你最后是逗号哦~） 2011-09-07 20:38:53
vs570588(金币+1):谢谢参与
adslye(金币+2): 鼓励新虫讨论，以后是不是可以说多点，把一句话说完（你最后是逗号哦~） 2011-09-07 20:38:53
|
本帖内容被屏蔽 |
4楼2011-09-07 19:17:41
5楼2011-09-08 10:09:32
6楼2011-09-08 17:36:08
7楼2011-09-08 18:45:45
8楼2011-09-09 19:23:57