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ppx523

新虫 (初入文坛)

[求助] 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的 已有1人参与

各位学长学姐大家好:
       我最近正在学习构建系统发育树,就是用NCB1上BLAST之后就是,用clustalx1.8对比之后,用MEGA5.0构树。可是构建出来,怎么是这个样子的,大家帮我解释一下,真的十分感谢!
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你需要将在ncbi BLAST上最同源的菌株所位于的属的标准菌株,以及相近属的标准菌株,在找距离很远的属的一条标准菌株序列作为外源序列。具体的你可以再ncbi上搜一下你那个菌虽在属的新菌鉴定的文章。
希望有所帮助
12楼2012-02-28 10:12:30
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moqiyilei

金虫 (小有名气)

可能是你找的序列信息除CTE432-D-1外同源性都太高,导致无法形成理想的进化树,建议同源基因最多两个,多放一些其他物种的相关基因。

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2楼2012-02-22 08:32:47
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普通回帖

ppx523

新虫 (初入文坛)

送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by moqiyilei at 2012-02-22 08:32:47:
可能是你找的序列信息除CTE432-D-1外同源性都太高,导致无法形成理想的进化树,建议同源基因最多两个,多放一些其他物种的相关基因。

我又做了一下,觉得怪怪的,也不会分析,请大家帮我解释,谢谢!
3楼2012-02-24 00:58:16
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ppx523

新虫 (初入文坛)

又一次构建

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  • 附件 1 : 建树.emf
  • 2012-02-24 01:00:34, 18 K
4楼2012-02-24 01:00:40
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ppx523

新虫 (初入文坛)

又一次建树图


5楼2012-02-24 01:04:26
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ppx523

新虫 (初入文坛)

谁能帮帮我啊,重谢
6楼2012-02-24 01:28:48
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ppx523

新虫 (初入文坛)

怎么没人回啊,呜呜呜,实在着急啊,必有重谢啊
7楼2012-02-24 20:06:36
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ppx523

新虫 (初入文坛)

怎么没人回啊,呜呜呜,
8楼2012-02-25 11:20:36
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ppx523

新虫 (初入文坛)

9楼2012-02-26 18:26:44
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
构建进化树,你需要标准菌株序列,和一条外源基因序列

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

10楼2012-02-27 10:51:48
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