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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的
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ppx523

新虫 (初入文坛)

[求助] 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的 已有1人参与

各位学长学姐大家好：
       我最近正在学习构建系统发育树，就是用NCB1上BLAST之后就是，用clustalx1.8对比之后，用MEGA5.0构树。可是构建出来，怎么是这个样子的，大家帮我解释一下，真的十分感谢！
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1楼 2012-02-21 21:48:45
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你需要将在ncbi BLAST上最同源的菌株所位于的属的标准菌株，以及相近属的标准菌株，在找距离很远的属的一条标准菌株序列作为外源序列。具体的你可以再ncbi上搜一下你那个菌虽在属的新菌鉴定的文章。
希望有所帮助
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12楼2012-02-28 10:12:30
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moqiyilei

金虫 (小有名气)
可能是你找的序列信息除CTE432-D-1外同源性都太高，导致无法形成理想的进化树，建议同源基因最多两个，多放一些其他物种的相关基因。
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ppx523
2楼2012-02-22 08:32:47
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普通回帖

ppx523

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by moqiyilei at 2012-02-22 08:32:47:
可能是你找的序列信息除CTE432-D-1外同源性都太高，导致无法形成理想的进化树，建议同源基因最多两个，多放一些其他物种的相关基因。

我又做了一下，觉得怪怪的，也不会分析，请大家帮我解释，谢谢！
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3楼2012-02-24 00:58:16
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ppx523

新虫 (初入文坛)
又一次构建
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    • 2012-02-24 01:00:34, 18 K
4楼2012-02-24 01:00:40
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ppx523

新虫 (初入文坛)
又一次建树图
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5楼2012-02-24 01:04:26
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ppx523

新虫 (初入文坛)
谁能帮帮我啊，重谢
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6楼2012-02-24 01:28:48
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ppx523

新虫 (初入文坛)
怎么没人回啊，呜呜呜，实在着急啊，必有重谢啊
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7楼2012-02-24 20:06:36
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ppx523

新虫 (初入文坛)
怎么没人回啊，呜呜呜，
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8楼2012-02-25 11:20:36
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ppx523

新虫 (初入文坛)
9楼2012-02-26 18:26:44
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
构建进化树，你需要标准菌株序列，和一条外源基因序列
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ppx523
10楼2012-02-27 10:51:48
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