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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 菜鸟求助——我系统发育树构建不出来——构建出来的怎么是这样的
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ppx523

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
楼: Originally posted by yuanbo934 at 2012-02-27 10:51:48:
构建进化树，你需要标准菌株序列，和一条外源基因序列

您好！标准菌株序列，和外源基因序列怎么找呢，我是初学，我没有老师和学长请教，真的是外行，这几天还急着用，请您指点，十分感谢
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11楼2012-02-27 13:57:59
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yuanbo934

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

你需要将在ncbi BLAST上最同源的菌株所位于的属的标准菌株，以及相近属的标准菌株，在找距离很远的属的一条标准菌株序列作为外源序列。具体的你可以再ncbi上搜一下你那个菌虽在属的新菌鉴定的文章。
希望有所帮助
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12楼2012-02-28 10:12:30
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

看来没人懂了，还是我来教你吧，进行clustal同源性分析后，保存→有个序列范围看到没？你要选择一下，因为你的序列一般不太可能与其他所有序列都是接近的，既然我们要判断这个序列与其他的同源关系，目的序列的长度就是根据，所以你看下面的标尺，把目的序列的左端与右端的数值填到那里，保存，出来的就对了哈。
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
13楼2012-06-14 10:14:31
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王娟20101169

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你好，我想问一下什么时候需要外源基因系列，我按着步骤通过ClustalX和MEGA两个软件建发育树，怎么没看到用外源基因这一步呢？但我看文献上建的树都引入外源基因了。谢谢
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14楼2012-10-25 20:26:29
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yang_jj1028

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ppx523 at 2012-02-24 01:04:26
又一次建树图

同学，，我现在建的树跟你出现的问题有点像哦，出现好多分支，节点是0，不知你后来是怎么弄好的？我现在也好着急啊，希望能得到你的帮助，十分感谢！
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15楼2013-10-23 21:57:23
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wangxihui

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

楼主怎么解决这个问题的呀，我现在建进化树时也遇到了这一问题，求指教啊
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16楼2014-07-22 22:11:42
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