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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 真菌种属鉴定 系统发育树构建
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冰鱼儿

金虫 (正式写手)

[求助] 真菌种属鉴定 系统发育树构建

系统发育树哪些用于比对的序列是怎么选择的，从NCBI数据库直接复制下来的吗，选择原则是什么，是全基因序列吗？谢谢！
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1楼 2011-04-19 22:23:18
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madengyu

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
2楼2011-08-03 17:20:06
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by madengyu at 2011-08-03 17:20:06:
请问你问题解决了嘛？我也有一株真菌要鉴定一下是那个种，能赐教一下吗。谢谢！

真菌的鉴定依据如下：
1）形态学特征：菌丝的形态（有无隔膜）、分生孢子和分生孢子梗的形态、是否产色素等。
2）生理生化试验：常规的生理生化试验，可以参考相关的实验手册；
3）分子生物学鉴定，真菌一般扩增保守的ITS序列，测序以后在NCBI中进行序列同源性比对，也可以通过软件构件系统进化树，进一步确定真菌的分类地位。

只有通过以上几个方面的结合，才能把一株真菌鉴定到种。
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jinzhi2010
3楼2011-08-03 17:39:11
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)
系统树的构建，可以参考我刚刚回复的帖子！

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3454662&fpage=1
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4楼2011-08-03 17:41:02
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jinzhi2010

银虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jinkui960 at 2011-08-03 10:39:11
真菌的鉴定依据如下：
1）形态学特征：菌丝的形态（有无隔膜）、分生孢子和分生孢子梗的形态、是否产色素等。
2）生理生化试验：常规的生理生化试验，可以参考相关的实验手册；
3）分子生物学鉴定，真菌一般扩增 ...

请问我们自己可以把真菌鉴定到种吗？还是只能鉴定到属，怎样鉴定自己拿到的是不是一个新的菌种呢？
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有所突破~~
5楼2014-09-02 21:19:59
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cindy1217

银虫 (初入文坛)
要看你的目的了，物种的系统发育树是全基因组的，先分析单拷贝直系同源基因，再比对了建树
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6楼2019-05-06 18:37:53
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