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zhang860215金虫 (正式写手)
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[求助]
系统发育树构建
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各位高人： 本人鉴定出一株菌构建出的发育树想当不理想，不知是什么原因，能有那位高人帮我构建一下，主要是急需，来不急一点点找原因，先把结果弄好，我后面再学习，有能构建的我发相关序列给你，谢谢了！ |
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 土壤真菌 | 微生物多样性 |
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zhang860215: 金币+60, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:58:38
zhang860215: 金币+60, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:58:38
| 我是做多样性分析的，以下是我的个人建议，首先你要选择外群，这个外群你可以参考别人相似研究中的菌株，二 构建发育树的时候，所有序列方向要一致，就是你的序列和NCBI序列BLAST的时候，你看具体比对结果 QUery 和Subject 的碱基都是对应的从1 方向开始，如果1对应1000多的碱基位置，那么你得序列方向就反了。如果方向反了，用mega打开那个序列，点击序列名称 然后右键 reverse completment,然后输出就可以了。 |
10楼2013-01-05 19:05:27