| 查看: 2800 | 回复: 31 | ||||
zhang860215金虫 (正式写手)
|
[求助]
系统发育树构建
|
|
各位高人： 本人鉴定出一株菌构建出的发育树想当不理想，不知是什么原因，能有那位高人帮我构建一下，主要是急需，来不急一点点找原因，先把结果弄好，我后面再学习，有能构建的我发相关序列给你，谢谢了！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 土壤真菌 | 微生物多样性 |
» 猜你喜欢
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有84人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
-
氢氧化钾活化操作
已经有18人回复
-
散金
已经有68人回复
-
生物质超级电容器
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 系统树如何分析
已经有9人回复
- 不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？
已经有9人回复
- 构建系统发育树出现的问题
已经有6人回复
- 如何通过序列确定一个菌是否是新种，并blast分析构建系统发育树
已经有6人回复
- 有关构建细菌发育树的序列问题
已经有8人回复
- 26s rDNA系统发育树的构建
已经有7人回复
- 系统发育树的建立和分析
已经有15人回复
- 建立系统发育树
已经有10人回复
- 系统发育树求教，不知道自己做的这个树有没有什么问题
已经有13人回复
- 构建系统发育树时，最后发表使用哪棵树？如何使用结果
已经有5人回复
- 系统发育树中的bootstrap怎么调整？
已经有7人回复
- 系统发育树如何分析，得出结论？
已经有13人回复
- 基于氨基酸的系统发育树的构建
已经有6人回复
- 系统发育树的节点与亲缘关系问题求助
已经有7人回复
- 真菌种属鉴定 系统发育树构建
已经有5人回复
- 【原创】原创之七：【图文】系统进化树的构建及编辑【已搜索无重复】
已经有377人回复
- 【求助/交流】如何构建系统更发育树
已经有16人回复
- 【求助/交流】关于系统发育树，如何鉴定菌种
已经有12人回复
- 请教：系统发育树怎么做？
已经有14人回复
cqlsf
至尊木虫 (职业作家)
- MolEPI: 1
- 应助: 20 (小学生)
- 金币: 15168.6
- 散金: 193
- 红花: 4
- 沙发: 7
- 帖子: 3161
- 在线: 264.3小时
- 虫号: 2216575
- 注册: 2013-01-01
- 专业: 微生物生理与生物化学
2楼2013-01-04 20:25:24
3楼2013-01-04 20:52:51
zhang860215
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1469.8
- 散金: 49
- 红花: 7
- 帖子: 388
- 在线: 407.4小时
- 虫号: 1212656
- 注册: 2011-02-25
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
4楼2013-01-05 09:47:18
zhang860215
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1469.8
- 散金: 49
- 红花: 7
- 帖子: 388
- 在线: 407.4小时
- 虫号: 1212656
- 注册: 2011-02-25
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
5楼2013-01-05 09:48:01
6楼2013-01-05 12:11:42
luck_cc
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1136.1
- 红花: 1
- 帖子: 340
- 在线: 195.4小时
- 虫号: 2196366
- 注册: 2012-12-19
- 专业: 计算机软件
7楼2013-01-05 15:10:24
elbo
金虫 (小有名气)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 1003.7
- 散金: 468
- 红花: 2
- 帖子: 231
- 在线: 119.9小时
- 虫号: 954540
- 注册: 2010-02-10
- 性别: GG
- 专业: 微生物生态学
8楼2013-01-05 16:15:41
zhang860215
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1469.8
- 散金: 49
- 红花: 7
- 帖子: 388
- 在线: 407.4小时
- 虫号: 1212656
- 注册: 2011-02-25
- 性别: MM
- 专业: 环境微生物学
|
我自己构建的发育树.docx(22.46KB) http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQ-L9u-nUAQA4bb?p=130497 我自己构建的发育树.docx(22.46KB) http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQ-L9u-nUAQA4bb?p=130497 |
9楼2013-01-05 17:19:28
elbo
金虫 (小有名气)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 1003.7
- 散金: 468
- 红花: 2
- 帖子: 231
- 在线: 119.9小时
- 虫号: 954540
- 注册: 2010-02-10
- 性别: GG
- 专业: 微生物生态学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zhang860215: 金币+60, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:58:38
zhang860215: 金币+60, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:58:38
| 我是做多样性分析的，以下是我的个人建议，首先你要选择外群，这个外群你可以参考别人相似研究中的菌株，二 构建发育树的时候，所有序列方向要一致，就是你的序列和NCBI序列BLAST的时候，你看具体比对结果 QUery 和Subject 的碱基都是对应的从1 方向开始，如果1对应1000多的碱基位置，那么你得序列方向就反了。如果方向反了，用mega打开那个序列，点击序列名称 然后右键 reverse completment,然后输出就可以了。 |
10楼2013-01-05 19:05:27
