24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1469.8
散金: 49
红花: 7
帖子: 388
在线: 407.4小时
虫号: 1212656
注册: 2011-02-25
性别: MM
专业: 环境微生物学

[求助] 系统发育树构建

各位高人：
本人鉴定出一株菌构建出的发育树想当不理想，不知是什么原因，能有那位高人帮我构建一下，主要是急需，来不急一点点找原因，先把结果弄好，我后面再学习，有能构建的我发相关序列给你，谢谢了！

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

土壤真菌

微生物多样性

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

系统树如何分析已经有9人回复
不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？已经有9人回复
构建系统发育树出现的问题已经有6人回复
如何通过序列确定一个菌是否是新种，并blast分析构建系统发育树已经有6人回复
有关构建细菌发育树的序列问题已经有8人回复
26s rDNA系统发育树的构建已经有7人回复
系统发育树的建立和分析已经有15人回复
建立系统发育树已经有10人回复
系统发育树求教，不知道自己做的这个树有没有什么问题已经有13人回复
构建系统发育树时，最后发表使用哪棵树？如何使用结果已经有5人回复
系统发育树中的bootstrap怎么调整？已经有7人回复
系统发育树如何分析，得出结论？已经有13人回复
基于氨基酸的系统发育树的构建已经有6人回复
系统发育树的节点与亲缘关系问题求助已经有7人回复
真菌种属鉴定系统发育树构建已经有5人回复
【原创】原创之七：【图文】系统进化树的构建及编辑【已搜索无重复】已经有377人回复
【求助/交流】如何构建系统更发育树已经有16人回复
【求助/交流】关于系统发育树，如何鉴定菌种已经有12人回复
请教：系统发育树怎么做？已经有14人回复

幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。

1楼 2013-01-04 19:51:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

elbo

金虫 (小有名气)

应助: 18 (小学生)
金币: 1003.7
散金: 468
红花: 2
帖子: 231
在线: 119.9小时
虫号: 954540
注册: 2010-02-10
性别: GG
专业: 微生物生态学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zhang860215: 金币+60, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:58:38

我是做多样性分析的，以下是我的个人建议，首先你要选择外群，这个外群你可以参考别人相似研究中的菌株，二构建发育树的时候，所有序列方向要一致，就是你的序列和NCBI序列BLAST的时候，你看具体比对结果 QUery 和Subject 的碱基都是对应的从1 方向开始，如果1对应1000多的碱基位置，那么你得序列方向就反了。如果方向反了，用mega打开那个序列，点击序列名称然后右键 reverse completment,然后输出就可以了。