应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 系统发育树构建
323/4返回列表上一页1234下一页
查看: 2496  |  回复: 31
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by jiangronglu at 2013-01-05 23:59:13
什么情况？可能是你选用的其他序列不一定相似对差，可以直接在NCBI上操作。如果想保密自己的序列，你可以下载一个MEGA 5.0就可以了。楼主你选用的其他比对的序列不对，应该选择不同种属的，要有差异，这样看起来比较 ...

就是我比对出来的所有菌株都是哪一个属的，没有不同种属的
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
21楼2013-01-06 13:25:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by xj8442cn at 2013-01-06 13:04:56
能在详细些么？大概多少条？发下序列吧

我自己构建的发育树.doc(47.5KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQzWMgvpUAQA6e8?p=130497
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
22楼2013-01-06 13:27:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

elbo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

当然需要BLAST比对出来相似性比较高的序列，还要有差异比较大的序列。要多看几篇类似的文章，看人家是怎么选择的序列。
赞一下 回复此楼
23楼2013-01-06 13:49:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by zhang860215 at 2013-01-06 13:19:31
那比对出来就是所有的都是大肠杆菌的了，不知道是不是这个原因做出的树不是很美观，可以在修改的美观点吗，因为自己不是很懂所以请教一下...

因为你选择的都是最近源的大肠杆菌，他们的亲缘关系很近，所以建的树就是这样的。

选择序列的话，我认为，下载的序列最好是已经发表过文章的，从文章里面去找这个序列具体是什么。另外，要想所谓的“图漂亮”，我想需要找一些亲缘关系远一点的物种，这样可能会好一些。
赞一下 回复此楼
24楼2013-01-06 14:33:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xj8442cn

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
22楼: Originally posted by zhang860215 at 2013-01-06 13:27:27
我自己构建的发育树.doc(47.5KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQzWMgvpUAQA6e8?p=130497...

多选些序列吧，近缘太多了，要做什么呢？鉴定还是进化？
赞一下 回复此楼
25楼2013-01-06 15:26:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
25楼: Originally posted by xj8442cn at 2013-01-06 15:26:27
多选些序列吧，近缘太多了，要做什么呢？鉴定还是进化？...

比对出来的所有菌都是那个属的，所以进化树就不太正常，还有可能调整的更美观点吗
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
26楼2013-01-06 17:18:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
24楼: Originally posted by joy_zuer at 2013-01-06 14:33:04
因为你选择的都是最近源的大肠杆菌，他们的亲缘关系很近，所以建的树就是这样的。

选择序列的话，我认为，下载的序列最好是已经发表过文章的，从文章里面去找这个序列具体是什么。另外，要想所谓的“图漂亮”， ...

那我比对出来的都是大肠杆菌的，还可以选不是比对出来的菌株吗？
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
27楼2013-01-06 17:20:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
27楼: Originally posted by zhang860215 at 2013-01-06 17:20:11
那我比对出来的都是大肠杆菌的，还可以选不是比对出来的菌株吗？...

当然可以。你可以查一下参考文献，看看别人用的哪些种建树的
赞一下 回复此楼
28楼2013-01-06 17:33:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

给你一篇文献，你看看，你是不是想建类似里面的那种图？
赞一下 回复此楼
29楼2013-01-06 17:49:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zhang860215: 金币+150, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:56:26
给你一篇文献，你看看，你是不是想建类似里面的那种图？
PNAS-2012-Kitahara-19220-5.pdf(930.55KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DZPazkjpUAQA7cc?p=130497
赞一下 回复此楼
30楼2013-01-06 17:51:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhang860215 的主题更新
323/4返回列表上一页1234下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自科面上基金字体 +5 iwuli 2026-03-12 6/300 2026-03-16 13:13 by Kamiu_MK
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
[基金申请] 有必要更换申报口吗 20+3 fannyamoy 2026-03-11 3/150 2026-03-14 00:52 by zhanghaozhu
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 0805，333求调剂 +3 112253525 2026-03-10 3/150 2026-03-13 23:42 by JourneyLucky
[考研] 工科，求调剂 +3 我887 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:39 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 7/350 2026-03-13 16:06 by ruiyingmiao
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-12 10/500 2026-03-13 15:42 by ms629
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂0856材料化工 +12 z2839474511 2026-03-11 13/650 2026-03-13 10:39 by peike
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 一志愿河海大学085900土木水利专硕279求调剂不挑专业 +4 SunWwWwWw 2026-03-10 8/400 2026-03-13 02:23 by SunWwWwWw
[考研] 研究生招生 +3 徐海涛11 2026-03-10 7/350 2026-03-12 14:26 by 徐海涛11
[考研] 294 英二数二物化 求调剂 +6 米饭团不好吃 2026-03-09 6/300 2026-03-09 23:55 by barlinike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭