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zhang860215

金虫 (正式写手)

[求助] 系统发育树构建

各位高人:
     本人鉴定出一株菌构建出的发育树想当不理想,不知是什么原因,能有那位高人帮我构建一下,主要是急需,来不急一点点找原因,先把结果弄好,我后面再学习,有能构建的我发相关序列给你,谢谢了!
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幸福,就是找一个温暖的人过一辈子。
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joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by zhang860215 at 2013-01-06 13:19:31
那比对出来就是所有的都是大肠杆菌的了,不知道是不是这个原因做出的树不是很美观,可以在修改的美观点吗,因为自己不是很懂所以请教一下...

因为你选择的都是最近源的大肠杆菌,他们的亲缘关系很近,所以建的树就是这样的。

选择序列的话,我认为,下载的序列最好是已经发表过文章的,从文章里面去找这个序列具体是什么。另外,要想所谓的“图漂亮”,我想需要找一些亲缘关系远一点的物种,这样可能会好一些。
24楼2013-01-06 14:33:04
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cqlsf

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
现有的序列i是段 16s,还是什么?  考虑DNAMAN,ClustalX 试试
老顽虫是大酱油滴:知新,行知,业精于勤。。。木虫的闺蜜叫木马。。
2楼2013-01-04 20:25:24
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joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你需要用什么方法或软件构建?mega行不行?
3楼2013-01-04 20:52:51
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zhang860215

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by joy_zuer at 2013-01-04 20:52:51
你需要用什么方法或软件构建?mega行不行?

当然可以,我用的就是这个软件,希望您能帮到我
幸福,就是找一个温暖的人过一辈子。
4楼2013-01-05 09:47:18
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