应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 系统发育树构建
322/4返回列表上一页1234下一页
查看: 2805  |  回复: 31
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

cqlsf

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zhang860215: 金币+100, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:57:18
引用回帖:
2楼: Originally posted by cqlsf at 2013-01-04 20:25:24
现有的序列i是段 16s，还是什么？  考虑DNAMAN，ClustalX 试试

需要知道大概的种属分类地位，然后找到其他菌株的相关序列。

ty1--Phylogenetic_Tree.gif
赞一下 回复此楼
老顽虫是大酱油滴：知新，行知，业精于勤。。。木虫的闺蜜叫木马。。
11楼2013-01-05 20:12:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vgyhn

木虫 (职业作家)
顶起！
回复此楼
12楼2013-01-05 20:55:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangronglu

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhang860215: 金币+50, ★★★很有帮助 2013-01-06 18:57:39
什么情况？可能是你选用的其他序列不一定相似对差，可以直接在NCBI上操作。如果想保密自己的序列，你可以下载一个MEGA 5.0就可以了。楼主你选用的其他比对的序列不对，应该选择不同种属的，要有差异，这样看起来比较好的
赞一下 回复此楼
努力就有收获，人人都能成功
13楼2013-01-05 23:59:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by jiangronglu at 2013-01-05 23:59:13
什么情况？可能是你选用的其他序列不一定相似对差，可以直接在NCBI上操作。如果想保密自己的序列，你可以下载一个MEGA 5.0就可以了。楼主你选用的其他比对的序列不对，应该选择不同种属的，要有差异，这样看起来比较 ...

就是在NCBI上比对出来除了大肠杆菌属就是两个不确定的属，相似度很高，做出来的图就这样了，所以我想是不是我自己图没做好的原因，请教一下
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
14楼2013-01-06 09:22:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

大肠杆菌就是种吧？只不过是不同的strain菌株。
赞一下 回复此楼
15楼2013-01-06 11:05:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你要说明你做这个图是干什么用的，要求是什么？需要达到什么目的？
赞一下 回复此楼
16楼2013-01-06 11:08:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

joy_zuer

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by zhang860215 at 2013-01-05 17:19:28
我自己构建的发育树.docx(22.46KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQ-L9u-nUAQA4bb?p=130497
我自己构建的发育树.docx(22.46KB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DQ-L9u-nUAQA4bb?p=130497...

uncultured organism说的是不能体外培养的生物。这种菌一般是在其他生物体内共生的共生细菌。应该也是属于大肠杆菌的一种。
赞一下 回复此楼
17楼2013-01-06 11:11:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xj8442cn

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
能在详细些么？大概多少条？发下序列吧
赞一下 回复此楼
18楼2013-01-06 13:04:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by joy_zuer at 2013-01-06 11:11:46
uncultured organism说的是不能体外培养的生物。这种菌一般是在其他生物体内共生的共生细菌。应该也是属于大肠杆菌的一种。...

那比对出来就是所有的都是大肠杆菌的了，不知道是不是这个原因做出的树不是很美观，可以在修改的美观点吗，因为自己不是很懂所以请教一下
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
19楼2013-01-06 13:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang860215

金虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by elbo at 2013-01-05 19:05:27
我是做多样性分析的，以下是我的个人建议，首先你要选择外群，这个外群你可以参考别人相似研究中的菌株，二 构建发育树的时候，所有序列方向要一致，就是你的序列和NCBI序列BLAST的时候，你看具体比对结果 QUery 和 ...

您说的是我选用的菌株可以不是BLAST比对列表出来的对吗？主要是自己对这方面不是很懂
赞一下 回复此楼
幸福，就是找一个温暖的人过一辈子。
20楼2013-01-06 13:24:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhang860215 的主题更新
322/4返回列表上一页1234下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 3/150 2026-08-25 01:47 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 明天应该可查了！？ +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +7 图啦图啦 2026-08-24 8/400 2026-08-24 22:00 by maomao_da
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 21/1050 2026-08-24 14:21 by refreshing11
[基金申请] 估计是周四 +4 archvillain 2026-08-18 4/200 2026-08-24 13:53 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 朋友圈看到的 +7 wangzilk 2026-08-18 9/450 2026-08-24 10:50 by cmrandy
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 什么时候开奖？ +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭