应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 关于怎样建立基因文库，并通过文库建系统发育树
101/1返回列表
查看: 2428  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

vs570588

木虫 (正式写手)

[求助] 关于怎样建立基因文库，并通过文库建系统发育树

我的问题，用污泥驯化富集可以降解某种特定污染物的混合菌，现在要分析微生物菌落结构。想通过建立基因文库。来建立系统发育树。原来的方法是做DGGE,再进行克隆，测序。发现大量外文文献里，很少做DGGE,普遍方法是，做完PCR后，就纯化，克隆，测序，不过测序量十分大。我是个初学者，希望大家能提供详细的过程。另外大家能评价下，DGGE后的克隆测序做系统发育树和直接PCR后克隆测序用啥区别？当然引物用一样的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-06-10 16:17:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vs570588

木虫 (正式写手)
顶顶把
回复此楼
2楼2011-06-11 13:40:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wozha

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

同问，利用
RFLP是否更好些
赞一下 回复此楼
3楼2011-06-13 15:35:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vs570588

木虫 (正式写手)
我在顶顶。
回复此楼
4楼2011-06-13 20:35:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amq7392

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

vs570588(金币+2): 谢谢你 2011-06-14 22:13:44
vs570588(金币+1): 谢谢你了 2011-06-21 16:00:56
vs570588(金币+2): 2011-08-19 21:16:59
简单地说，DGGE灵敏度比较低，只能检测到群落中占优势的菌群，克隆建库灵敏度相对较高，打个比方，你用DGGE仅检测到10种菌，而克隆建库可能检测到100种菌.克隆建库的具体方法，你可以下载几篇做微生物群落结构和多样性的毕业论文看看，不再详述。
赞一下 回复此楼
5楼2011-06-14 20:51:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木木木虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我也想做这方面的内容
赞一下 回复此楼
6楼2011-06-14 23:48:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木木木虫

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-12-02 10:10:59
引用回帖:
Originally posted by 小木木木虫 at 2011-06-14 23:48:55:
我也想做这方面的内容

刚才点错键直接发送了
但我做的是DGGE
想问下LZ为什么不用DGGE了呢
难道有什么缺陷吗
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2011-06-14 23:49:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vs570588

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 小木木木虫 at 2011-06-14 23:49:48:
刚才点错键直接发送了
但我做的是DGGE
想问下LZ为什么不用DGGE了呢
难道有什么缺陷吗

DGGE可以观察到微生物群落多样性，以及演变过程。当然，这种演变也就是群落中里的优势菌。并且片段长度只能为500bp之下。假如我的目的是要建立系统发育树的话，有时候短片段的就没有办法在GENBANK中找到相似度很高的已知菌。这只是我的拙见。
赞一下 回复此楼
8楼2011-06-15 12:36:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

aquamarineqp

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★
zhang8826857(金币+5): 鼓励新虫，加油哦 2011-12-02 10:11:14
我也做这方面的。自己的理解是：真接用pcr产物构建克隆文库，需要大量随机挑取单克隆，至少50个。DGGE当目的基因500以上分离较果就很不好了。但如果用DGGE分好条带后再建克隆文库，可以节省一些工作量？RFLP没作过，如果原理是和T-RFLP相同，那么大概不能在GENEBANK中检索相近序列吧。新手拙见，请批评指正。
赞一下(1人) 回复此楼
要学会生物统计
9楼2011-12-02 00:09:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangjingwjs

新虫 (小有名气)
请问楼主，我已经提取了土壤微生物组织的ＤＮＡ，如何构建文库呢？
赞一下 回复此楼
10楼2015-11-02 22:57:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 学员BmWXvC 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 17/850 2026-08-04 09:46 by archvillain
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 f1dmPx051StA 2026-08-03 7/350 2026-08-04 09:31 by v1TJC4qJauAB
[博后之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 5/250 2026-08-04 09:27 by v1TJC4qJauAB
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 10/500 2026-08-04 09:26 by v1TJC4qJauAB
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 09:17 by v1TJC4qJauAB
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 10/500 2026-08-04 09:15 by v1TJC4qJauAB
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备？ 50+3 kf2781974 2026-07-31 10/500 2026-08-04 08:05 by 88817753
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 07:37 by k7OM8YghWbkC
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 13/650 2026-08-04 07:30 by k7OM8YghWbkC
[教师之家] 基础研究怎么拉横向，学校到款任务越来越多，难以完成 拉横向，都有哪些途径啊 +9 锦衣卫寒战 2026-07-28 13/650 2026-08-04 07:21 by Ermito
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 6/300 2026-08-04 06:10 by k7OM8YghWbkC
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 6/300 2026-08-04 04:47 by k7OM8YghWbkC
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 8/400 2026-08-04 03:21 by k7OM8YghWbkC
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
[基金申请] 面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！ +19 低垂的野花 2026-07-31 25/1250 2026-08-03 09:25 by gy116024
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +16 布布和一二 2026-07-30 22/1100 2026-08-03 09:20 by gy116024
[基金申请] 微信指数没变化，科研之友没阅读 +15 wangze12014 2026-07-28 19/950 2026-08-02 20:05 by 蔡棒棒菂
[考博] 2027年申博 50+3 射雕英雄胜 2026-07-30 3/150 2026-08-02 09:36 by lfy8008
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液，是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭