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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】鉴定出细菌的16SrDNA，请问如何构建系统发育树？
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刁蛮

[交流] 【求助/交流】鉴定出细菌的16SrDNA，请问如何构建系统发育树？ 已有4人参与

RT，该用什么方法，什么软件？看文献说Applied biosystem 公司的MicroSeq Microbial Identification System software这个软件分析，但是下载不到这个软件。。。谁有相关经验分享下啦。。。。不胜感激~
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1楼 2010-02-28 22:20:30
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段家一凡

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
可以用Mega4，然后下载和该16srDNA序列同源性高的细菌的16srDNA序列，根据软件要求建树
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2楼2010-03-01 00:56:16
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刁蛮

Mega4 这个软件用的多吗？
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3楼2010-03-02 21:38:48
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feiying9862

金虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
内容已删除
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来不及了
4楼2010-07-14 14:22:26
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
mega 4.1   用的挺多的
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5楼2010-07-14 15:29:56
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srzh1221

铜虫 (正式写手)
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引用回帖:
18655410楼: Originally posted by 段家一凡 at 2010-03-01 00:56:16
可以用Mega4，然后下载和该16srDNA序列同源性高的细菌的16srDNA序列，根据软件要求建树

你好，我在blast找到和我的细菌的同源性高的有很多，怎么选择呀，还有同源性高的细菌的序列怎么下载呢？期待你的回音，非常感谢。
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6楼2012-11-27 22:07:06
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andyleier

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
在NCBI上blast找到以后，同源性数字后面一行就是菌株名称，点击右键打开最后面的菌株名称，打开它就可以看到所有信息，找到细菌的序列了。

[ Last edited by andyleier on 2013-3-29 at 09:46 ]
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7楼2013-03-29 09:33:58
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