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大家帮看看我做这个系统发育树是否可用，做法是否正确，谢谢了~~
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本人小硕一枚，分子生物学这方面完全就是菜鸟的级别。现在面临菌种的鉴定，已经给上海生工做了16s rDNA，得到了菌株的序列，也列出了DNA序列与之相近的几种菌。后面的做法是不是跟踪NCBI网站上所列出的菌的详细消息，复制ORIGIN后面的序列，做出TXT文档？我把我的未知菌的序列同样做了TXT文档，并且每个菌的序列单独做个文档，这样是正确的吧？后面是依照好心的虫友们提供的办法，用MEGA5.0建了发育树，现在就不知道这个发育树建得正不正确，该怎样分析？ PS:是不是那个99后的菌就是和我的菌最相同的啊？ |
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2012-10-11 20:17:06, 27.5 K
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【答案】应助回帖
| 可以去模式菌株数据库（http://147.47.212.35:8080/index.jsp）比对一下看看结果，或者到RDP数据库比对也可以。单凭16S序列测定是不能鉴定细菌到种的。如果你只是想要个系统发育树，也要找模式菌株构建，如果是想做菌株鉴定，还需要辅以大量的生理生化试验 |
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