| 查看: 2208 | 回复: 16 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
大家帮看看我做这个系统发育树是否可用，做法是否正确，谢谢了~~
|
|||
|
本人小硕一枚，分子生物学这方面完全就是菜鸟的级别。现在面临菌种的鉴定，已经给上海生工做了16s rDNA，得到了菌株的序列，也列出了DNA序列与之相近的几种菌。后面的做法是不是跟踪NCBI网站上所列出的菌的详细消息，复制ORIGIN后面的序列，做出TXT文档？我把我的未知菌的序列同样做了TXT文档，并且每个菌的序列单独做个文档，这样是正确的吧？后面是依照好心的虫友们提供的办法，用MEGA5.0建了发育树，现在就不知道这个发育树建得正不正确，该怎样分析？ PS:是不是那个99后的菌就是和我的菌最相同的啊？ |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : 菌种确定分析.doc
2012-10-11 20:17:06, 27.5 K
» 猜你喜欢
国自然评审意见
已经有12人回复
-
国自然面上复盘~欢迎讨论
已经有14人回复
-
系统查不到
已经有11人回复
-
有多少人是今天查系统知道结果的？
已经有18人回复
-
为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难
已经有12人回复
-
有没有仍没收到信息的
已经有3人回复
-
导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！
已经有8人回复
-
基金不中，共勉
已经有11人回复
-
麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上）
已经有9人回复
-
2026年叶企孙基金
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
mirror3895
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 24 (小学生)
- 金币: 5173.8
- 散金: 123
- 红花: 14
- 帖子: 860
- 在线: 258.6小时
- 虫号: 621408
- 注册: 2008-10-09
- 专业: 动物病理学
【答案】应助回帖
| 可以去模式菌株数据库（http://147.47.212.35:8080/index.jsp）比对一下看看结果，或者到RDP数据库比对也可以。单凭16S序列测定是不能鉴定细菌到种的。如果你只是想要个系统发育树，也要找模式菌株构建，如果是想做菌株鉴定，还需要辅以大量的生理生化试验 |
7楼2012-10-14 21:06:30
2楼2012-10-13 18:29:23
allencindy
铁虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 210.3
- 红花: 1
- 帖子: 56
- 在线: 34.1小时
- 虫号: 725506
- 注册: 2009-03-18
- 专业: 环境微生物学
3楼2012-10-14 00:31:57
allencindy
铁虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 210.3
- 红花: 1
- 帖子: 56
- 在线: 34.1小时
- 虫号: 725506
- 注册: 2009-03-18
- 专业: 环境微生物学
4楼2012-10-14 00:34:33
投票:
10