应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 系统发育树的建立
51/1返回列表
查看: 1499  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

twisty

木虫 (正式写手)

newer

[求助] 系统发育树的建立

用phylipwx软件包中的neighbor建树,如何产生进化距离（节点处的数字）？

[ 来自科研家族 Natural Products家族 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
兼并碱基M=A/CR=A/GW=A/TS=G/CY=C/TK=G/TV=A/G/C&n...
1楼 2012-12-18 05:25:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyasong

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
twisty: 金币+20, ★★★很有帮助, 希望能再详细些，让我们这些菜鸟也明白是究竞怎么回事，近乎满意，奖您金币，如能再详细些，必将再谢。 2012-12-20 09:33:24
小丹木木: 金币+3, MolEPI+1, 欢迎提供资料，鼓励应助 2012-12-20 11:39:31
这个是MEG的构建进化树的方法，看看有没有帮助！
MEGA软件——系统发育树构建方法.docx(1.45MB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DYHiS4XRUAQA96c?p=130497
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2012-12-19 17:14:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

mirror3895

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用MEGA不是更简单吗？我没有用过phylip，建议你用MEGA试试，网上也有很多教程，比较方便
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-19 12:36:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

twisty

木虫 (正式写手)

newer
引用回帖:
3楼: Originally posted by weiyasong at 2012-12-19 17:14:32
这个是MEG的构建进化树的方法，看看有没有帮助！
MEGA软件——系统发育树构建方法.docx(1.45MB)
http://kuai.xunlei.com/d/LnU4DYHiS4XRUAQA96c?p=130497

我看了你给的文档，应该算是较的详细的了，但里边有个问题我不明白想追问您一下，那就是“比对完成后删除序列两端不能完全对齐的碱基。”这句话，请问这样做对结果没有影响么？这样做有什么依据吗？如果比对后有各别列只有一两个碱基，而其他处都是空的，是否也要删去？还有就是在比对的末尾处有很多参差不齐处，是否也要都删去？期待您的回复，谢谢！
赞一下 回复此楼
兼并碱基M=A/CR=A/GW=A/TS=G/CY=C/TK=G/TV=A/G/C&n...
4楼2012-12-19 21:31:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weiyasong

木虫 (著名写手)
★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-12-24 19:11:16
引用回帖:
4楼: Originally posted by twisty at 2012-12-19 21:31:06
我看了你给的文档，应该算是较的详细的了，但里边有个问题我不明白想追问您一下，那就是“比对完成后删除序列两端不能完全对齐的碱基。”这句话，请问这样做对结果没有影响么？这样做有什么依据吗？如果比对后有各 ...

您好，这句话本来我也不明白，但请教了我们这研究分子生物学软件的老师，她说对于碱基数大于1000bp的序列比对完成后不用删除（删除与不删除影响不大），但对于碱基数在100-1000bp之间的，由于碱基数较少，为了保证碱基数的一致，需要做删除操作。不知道这么回答是不是您所想知道的。
赞一下 回复此楼
5楼2012-12-24 10:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +16 木水思豆 2026-08-25 19/950 2026-08-25 23:56 by dragonxp
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 3/150 2026-08-25 23:20 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 19/950 2026-08-25 17:57 by chick875
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 科研孤儿太难了 +18 我4大白菜 2026-08-20 19/950 2026-08-24 09:47 by 凯恩广盛催化分�
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭