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襄阳蓉儿

新虫 (小有名气)


[交流] 求助,巢式PCR,出了点儿问题,!

第一步pcr都是25微升的体系,12.5微升的premix,上下游引物都是0.5微升,模版是2微升。。。
第二步50微升体系premix,上下游引物1微升,模版2微升
哪里出问题了,难道是我的操作?
师兄做的p出来的条带很亮很好,应该不是引物设计问题吧。
为什么我做的阳性对照有条带而且非常的弱,我的样品啥都没有,郁闷啊!!!图片中阳性对照跑出来两个条带,一条亮的是我的目的条带,目的条带是592bp,弱的不知道是什么。。。


[ Last edited by 襄阳蓉儿 on 2012-7-16 at 20:30 ]
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jqzhu1998

铁虫 (小有名气)


★ ★ ★
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amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-15 19:46:10
是不是写错了??12.5ul的酶??
第二步的体系可以放大,做75或100
慢慢来,多看看师兄做的,自己再多琢磨琢磨,细心一点,肯定能做出来的。
2楼2012-07-15 16:24:17
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jl860822

金虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我以前也做过巢式PCR,一般很容易出结果的,你肯定是中间出了问题,我建议,你第一步先跑胶看一下,如果第1步啥都没有,那第2步就不好说
3楼2012-07-16 08:43:51
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jl860822

金虫 (正式写手)


妹子长的不错嘛
4楼2012-07-16 08:44:54
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襄阳蓉儿

新虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-16 08:43:51
我以前也做过巢式PCR,一般很容易出结果的,你肯定是中间出了问题,我建议,你第一步先跑胶看一下,如果第1步啥都没有,那第2步就不好说

我问了师兄也自己查了相关资料,第一步没有条带是正常的吧?
5楼2012-07-16 09:15:37
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倾听世界0721

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
第二次可以做到50ul,把引物、dNTP的量增加一倍。
6楼2012-07-16 10:20:10
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chan_6217911

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有可能是第二步PCR的模板量(你用的是2ul)太多了,你可以用0.5ul或者稀释一定倍数。
7楼2012-07-16 12:10:33
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xudabin98

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
额滴神啊,你是用的什么酶啊?要用那么大的量,P不出来应该是正常的.第一步PCR结果电泳也看不出啥来.你对招标准PROTOCOL多看看.
8楼2012-07-16 12:39:36
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襄阳蓉儿

新虫 (小有名气)


引用回帖:
8楼: Originally posted by xudabin98 at 2012-07-16 12:39:36
额滴神啊,你是用的什么酶啊?要用那么大的量,P不出来应该是正常的.第一步PCR结果电泳也看不出啥来.你对招标准PROTOCOL多看看.

说错了,那个是Premix
9楼2012-07-16 15:41:53
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襄阳蓉儿

新虫 (小有名气)


襄阳蓉儿: 回帖置顶 2012-07-16 20:14:55
阳性对照跑出来两个条带,一条亮的是我的目的条带,弱的不知道是什么。。。啥玩意儿啊
10楼2012-07-16 20:13:53
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jl860822

金虫 (正式写手)



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引用回帖:
5楼: Originally posted by 襄阳蓉儿 at 2012-07-16 09:15:37
我问了师兄也自己查了相关资料,第一步没有条带是正常的吧?...

我觉得不太正常,以前我做的时候,第1次一般都会有些弥散带,所以我觉得你第1轮是不是就没扩增好,或者你第1轮的PCR降低一下退火温度,第2轮再提高一下退火温度试试
11楼2012-07-16 21:28:23
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ljx2ljx

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-16 08:43:51
我以前也做过巢式PCR,一般很容易出结果的,你肯定是中间出了问题,我建议,你第一步先跑胶看一下,如果第1步啥都没有,那第2步就不好说

您好,我做巢式PCR做了一周多了,用特异性引物和此模板可以扩增出来,第一轮一直没有东西,第二轮也没有东西。退火温度和模板梯度都做了,但是还是不行。可能原因有哪些呢?
12楼2013-05-16 21:56:35
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ljx2ljx

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by xudabin98 at 2012-07-16 12:39:36
额滴神啊,你是用的什么酶啊?要用那么大的量,P不出来应该是正常的.第一步PCR结果电泳也看不出啥来.你对招标准PROTOCOL多看看.

您好,我做巢式PCR做了一周多了,用特异性引物和此模板可以扩增出来,第一轮一直没有东西,第二轮也没有东西。退火温度和模板梯度都做了,但是还是不行。可能原因有哪些呢?
13楼2013-05-16 22:04:44
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ljx2ljx

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
11楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-16 21:28:23
我觉得不太正常,以前我做的时候,第1次一般都会有些弥散带,所以我觉得你第1轮是不是就没扩增好,或者你第1轮的PCR降低一下退火温度,第2轮再提高一下退火温度试试...

您好,我做巢式PCR做了一周多了,用特异性引物和此模板可以扩增出来,第一轮一直没有东西,第二轮也没有东西。退火温度和模板梯度都做了,但是还是不行。可能原因有哪些呢?
14楼2013-05-16 22:06:03
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