24小时热门版块排行榜    

查看: 3765  |  回复: 1

sta27

金虫 (正式写手)

[求助] 点突变pcr后跑琼脂糖凝胶电泳发现条带不对,请高手指点!!!

本人想把一个质粒(7.8kbp)中的一个氨基酸变成另一个氨基酸,因此有连续三个点要突变。

选择使用的方法是合成两个反向互补的包含突变位点的引物,GC%=60% Tm=86.8如下:
F: CACAGTCTGGGGCATCGATCAGCTCCAGGCAAGAG
R:CTCTTGCCTGGAGCTGATCGATGCCCCAGACTGTG

用Fermentas的Premix PrimeSTAR 进行PCR 98℃ 1min 1cycle;98℃ 10sec, 55℃ 5sec,72℃ 8min 24cycle;72℃ 10min 1cycle

PCR后进行电泳 第一泳道为maker 第二泳道为不加引物做的PCR 最后一个泳道为模板质粒 中间的都是不同浓度的模板和引物做的PCR产物 可见PCR产物最亮的条带与模板质粒位置相差很大



将PCR产物用DpnI酶切后 模板切掉;再进行转化,发现LB平板上有两种克隆,一种是很大很亮的单克隆,但在它们旁边还有许多星星点点的小克隆

求助!求高手!请问这是怎么回事? 出现什么问题了吗?

之前实验室有人用相同方法做不同的质粒是可以成功的
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

todouhy

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你好,我也是做突变的,用的酶也是prime STAR酶,你跑胶的质粒是超螺旋的,而pcr产物是线性的,这个不好对照。按照这个酶推荐的程序,我会这样设计:98℃ 3min 1cycle;98℃ 10sec, 60-68℃10sec,72℃ 8min 30cycles;72℃ 10min 1cycle,引物设计的话你们实验室也做了估计不会错的,有经验了嘛,针对这个“将PCR产物用DpnI酶切后 模板切掉;再进行转化,发现LB平板上有两种克隆,一种是很大很亮的单克隆,但在它们旁边还有许多星星点点的小克隆”,首先消化一定要完全,不然原始质粒会影响实验结果,还有就是转化后培养时间是不是超过16小时,这样会长出卫星菌落。如果长出来的菌很大很大喝以前转化不同的话估计就是感受态染菌了。
2楼2012-02-18 21:20:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sta27 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境学硕288求调剂 +5 皮皮皮123456 2026-03-22 5/250 2026-03-22 15:27 by 无懈可击111
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +5 生物工程调剂 2026-03-17 9/450 2026-03-21 23:32 by zhujy1982
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考! +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 280求调剂 +11 咕噜晓晓 2026-03-18 12/600 2026-03-21 22:40 by ACS Nano——
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 工科0856求调剂 +3 沐析汀汀 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:30 by 学员8dgXkO
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 余意卿 2026-03-18 3/150 2026-03-21 17:31 by ColorlessPI
[考研] 302求调剂 +12 呼呼呼。。。。 2026-03-17 12/600 2026-03-21 17:29 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 .m.. 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:25 by barlinike
[考研] 一志愿中国石油大学(华东) 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 319求调剂 +3 小力气珂珂 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:47 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂,一志愿华南理工大学071005 +5 ioodiiij 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:22 by zcl123
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
信息提示
请填处理意见