24小时热门版块排行榜    

查看: 3289  |  回复: 11

xixi61887

金虫 (小有名气)

[求助] 请教基因载体跑琼脂糖凝胶电泳的结果无条带问题

各位虫友,我做的是聚合物/DNA的纳米粒子凝胶电泳。聚合物/DNA溶液含1微克DNA,总体积为80微升。上样时取10微升溶液,与2微升loading buffer混合。电压100V,跑30min。EB 0.5微克/ml 染色1h,脱色0.5h。问题出现了,由于凝胶成像仪坏了,我用实验室254nm的普通紫外分析仪照了一下,什么东西都没有!
(我做的东西不需要将条带分开,每个孔对应一个带即可,我是通过带的位置判断带正电聚合物能不能跟负电DNA完全结合,如果不能完全结合,会往阳极移动,否则会留在上样孔内。)
我从小木虫以前的帖子中查找了一下,可能的原因:1、DNA上样量少。我计算了一下,每孔中加入的液体总DNA含量约100ng,有帖子说1-10ngDNA都能分析出来,不知道我加的量是不是太少?2、波长问题。我查到的可以用254nm紫外光,是实验室普通仪器太简陋还是别的原因?3、由于本人新手,可能上样时移液器枪头扎破了样品槽底部,但15个槽不可能都破,跑的时候我侧面观察有1-2个样品槽可能漏了,但大部分槽是好的。4、不存在DNA跑出胶的情况,但脱色时由于仪器故障脱色了4个h,拿出来以后胶上面没有上样buffer的蓝色痕迹(刚跑完会有两种蓝色的痕迹),这是说明我染色时间过长所以EB染色不好吗?这会导致最终看不出条带吗?5、凝胶成像仪器坏了有没有较好的替代方案?254nm紫外灯是不是根本不可行?

我是生物实验新手,遇到这种问题很着急,如果有了解原因或者做过相关实验的虫友,请不吝赐教!谢谢
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

实验技术自我提高

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

你跑marker了吗?EB后染一般30分钟足够,不用脱色直接观测。脱色可以降低背景。直接观测没有成像仪灵敏,一般需要上样量较大才看得清楚,很可能是你的上样量少了。不知道你的DNA条带应该多大,EB染色的亮度也和分子大小相关。我觉得应该可以用紫外灯照。
2楼2013-04-16 07:03:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xixi61887

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-04-16 07:03:02
你跑marker了吗?EB后染一般30分钟足够,不用脱色直接观测。脱色可以降低背景。直接观测没有成像仪灵敏,一般需要上样量较大才看得清楚,很可能是你的上样量少了。不知道你的DNA条带应该多大,EB染色的亮度也和分子 ...

谢谢您的回答!我不需要跑marker,对照组是裸DNA,样品组是聚合物DNA纳米粒子。染色及脱色步骤是师兄毕业论文中的。我把放了3天的胶找其他凝胶仪器照了一下,有条带出现,是365nm,所以可能254nm紫外不可用。不知道您用琼脂糖时每孔加入多少质量的DNA?谢谢!
3楼2013-04-16 11:18:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xixi61887 at 2013-04-16 11:18:04
谢谢您的回答!我不需要跑marker,对照组是裸DNA,样品组是聚合物DNA纳米粒子。染色及脱色步骤是师兄毕业论文中的。我把放了3天的胶找其他凝胶仪器照了一下,有条带出现,是365nm,所以可能254nm紫外不可用。不知道 ...

上样量要看目标分子量大小。一般几kb的上100ng左右,几十kb的上1μg左右。
4楼2013-04-16 13:07:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xixi61887

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-04-16 13:07:58
上样量要看目标分子量大小。一般几kb的上100ng左右,几十kb的上1μg左右。...

您好!我用的是大约5千个碱基对的DNA,每孔上100ng,又做了一次,脱色完立马照相,条带都有,但不是很亮,而且有的上样孔处的DNA亮度特别低,基本都看不清,请问您了解这种现象的原因吗?是脱色及染色时,DNA溶在水中流失了吗?谢谢!
5楼2013-04-17 21:27:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

内容已删除
6楼2013-04-18 00:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xixi61887

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-04-18 00:30:12
问一下为什么上样孔处会亮呢?一般点样孔应该不亮,只有目标条带发亮才对。脱色一般不会造成DNA流失。对于DNA这样的大分子扩散是很慢的,不会轻易从胶中溶出来。后染法不影响DNA的迁移率,如果你不是很在乎这个,可 ...

您好!DNA与正电聚合物结合后,如果聚合物比例高,会留在孔内,所以孔内也会发光。我希望它留在孔内并发亮,但是实际做的时候用的8齿的梳子,不知道是不是孔太大了,照的时候看不出来?谢谢!
7楼2013-04-18 17:14:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by xixi61887 at 2013-04-18 17:14:52
您好!DNA与正电聚合物结合后,如果聚合物比例高,会留在孔内,所以孔内也会发光。我希望它留在孔内并发亮,但是实际做的时候用的8齿的梳子,不知道是不是孔太大了,照的时候看不出来?谢谢!...

明白了。所以你用后染,不希望EB的电性影响迁移吧。不过,我觉得你可以尝试直接在胶里加EB。
8楼2013-04-19 00:50:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xixi61887

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-04-19 00:50:44
明白了。所以你用后染,不希望EB的电性影响迁移吧。不过,我觉得你可以尝试直接在胶里加EB。...

谢谢!我再尝试一下。
9楼2013-04-19 14:18:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bambooliang

新虫 (初入文坛)

请问楼主,我也是一名电泳新手,做的也是聚合物/DNA的纳米粒子凝胶电泳,遇到与楼主相似的问题,我的是裸DNA有带,最高比例在上样孔有强烈荧光,但是低中比例什么都没有,楼主你的问题我想已经解决了吧,能指教一下吗?
10楼2015-06-16 10:18:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xixi61887 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 焦虑 +7 水冰月月野兔 2026-03-13 9/450 2026-03-16 10:00 by Quakerbird
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 东南大学364求调剂 +4 JasonYuiui 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:36 by Linda Hu
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考博] 欢迎申博同学联系 +3 天道酬勤2026686 2026-03-10 7/350 2026-03-15 19:03 by 天道酬勤2026686
[考研] 274求调剂 +4 时间点 2026-03-13 4/200 2026-03-15 15:29 by Rambo13
[考研] 070305求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-14 4/200 2026-03-15 11:04 by peike
[考研] 复试调剂 +3 呼呼?~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 【0703化学调剂】-一志愿华中师范大学-六级475 +5 Becho359 2026-03-11 5/250 2026-03-14 11:35 by 哦哦123
[考研] 一志愿天津大学,英一数二305分求调剂,四六级已过 +8 小小番的茄 2026-03-09 8/400 2026-03-14 01:53 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿安徽大学材料工程专硕313分,求调剂的学校 +8 Yu先生 2026-03-10 10/500 2026-03-14 01:04 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +8 zchqwer 2026-03-10 8/400 2026-03-14 00:01 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工304求B区调剂 +5 邱gl 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:37 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中师范071000,325求调剂 +5 RuitingC 2026-03-12 5/250 2026-03-13 10:43 by hyswxzs
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
信息提示
请填处理意见