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基因组文库构建时DNA酶切片段用胶回收吗?
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youngsun50
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[交流]
基因组文库构建时DNA酶切片段用胶回收吗?
RT,我构建的是细菌的基因组文库,基因组DNA BamHI酶切后显示大多在3K-7K,少数<3K,请问
1)我还用选择性的胶回收某个范围大小的片段吗,因为我也不知道我要的基因在多大片段上?
2)如果不回收的话怎么处理酶切后产物进行连接反应(用pUC19载体),我看有65度5min灭活限制酶的,可行吗?
谢谢,请大侠指点
[
Last edited by youngsun50 on 2012-1-2 at 10:18
]
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2012-01-01 17:25:09
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西瓜(金币+2): 鼓励应助!欢迎常来哦~ 2012-01-04 12:11:28
可以直接连接试试 效果不好的话 用PCR产物纯化试剂盒直接纯化就可以了(qiagen有一个 50次 1000 挺不错) 回收大于100bp的片段
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2012-01-04 00:18:12
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brightfuture01
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youngsun50(金币+1): 2012-01-02 21:08:08
西瓜(金币+1): 老专家,常来啊~ 2012-01-03 08:33:49
文库构建时尽量用较大的片段,切胶回收没商量。
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2012-01-02 18:54:44
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西瓜(金币+1): 欢迎常来~ 2012-01-03 08:32:48
你要先调查一下你的基因组中一般情况下基因的大小;一般都要用胶回收!
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3楼
2012-01-02 20:10:23
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youngsun50
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brightfuture01
at 2012-01-02 18:54:44:
文库构建时尽量用较大的片段,切胶回收没商量。
但我怕漏掉小片段啊,能用PCR回收试剂盒把所有的片段都回收做连接吗,小片段对连接没影响吧?
另,pUC载体最大能插入多大的片段啊?谢谢
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4楼
2012-01-02 20:57:01
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