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Gromacs
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求助NAMD相关问题
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化学化工系
2013-02-26
2013-03-03 14:14:35
by
化学化工系
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专家会诊
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用什么方法预测核苷类化合物与天然碱基形成氢键能力额强弱呢?
(0/346)
惟精惟一
2013-03-03
2013-03-03 13:34:18
by
惟精惟一
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其他
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[已完结]
win7(32位)Materials Studio5.5安装步骤有一步真心过不去了
(6/1937)
nsqhmily
2013-02-28
2013-03-03 07:14:10
by
lucaca
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MS
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[已完结]
materials studio 基组选择问题
(2/1280)
jini1989
2012-12-19
2013-03-02 12:41:16
by
jini1989
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其他
]
[已完结]
HOMO能量对药物分子的设计有哪些方面的指导?
(0/231)
邓芳
2013-03-02
2013-03-02 11:28:47
by
邓芳
[
MS
]
[已完结]
求测甲基蓝分子的尺寸大小
(2/1506)
nano刘霞
2013-03-01
2013-03-01 22:54:32
by
chembetsey
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其他
]
[已完结]
求教AutoDock里的inhib_constant是什么常数?
(4/3085)
河外生命
2013-02-27
2013-03-01 17:57:45
by
longlongdlut
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LAMMPS/
]
[已完结]
冲击结果异常
(
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2
)
(11/1866)
lchunmei001
2013-01-16
2013-03-01 17:26:22
by
lchunmei001
[
Gromacs
]
[已完结]
分子与界面夹角
(7/1576)
memgr
2012-03-25
2013-03-01 14:47:34
by
jiaoyixiong
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
小分子配体结构多活性影响问题
(2/554)
高興丶
2013-03-01
2013-03-01 14:36:14
by
126406380
[
Gromacs
]
[已完结]
editconf 和pdb2gmx坐标转换错误
(2/1012)
zxy964777869
2013-02-28
2013-03-01 13:59:59
by
zxy964777869
[
LAMMPS/
]
[已完结]
q求Lj势函数
(
1
2
)
(12/1510)
yangwenbin99
2012-12-18
2013-03-01 13:13:50
by
yangwenbin99
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
TopomerComfa问题 真心求帮助
(0/450)
高興丶
2013-03-01
2013-03-01 13:05:42
by
高興丶
[
MS
]
[已完结]
各种金属的表面构建!
(2/618)
kaku2010
2013-01-15
2013-03-01 11:18:03
by
kaku2010
[
LAMMPS/
]
[已完结]
石墨烯nano-patterning
(1/743)
muguawl
2013-02-28
2013-03-01 10:25:07
by
ddll_slsl
[
Gromacs
]
[已完结]
现有的NAMD 可以用的parameter file里面有没有环氧基团的参数?
(
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2
)
(10/1226)
xiaosaizhao
2013-02-28
2013-03-01 09:45:09
by
xiaosaizhao
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS中无法复制和粘贴
(0/543)
古小青
2013-02-28
2013-02-28 22:21:15
by
古小青
[
MS
]
[已完结]
在PXRD谱图指标化时提示目录名无效应该怎么办!!!!
(2/262)
孙小夏
2013-02-28
2013-02-28 21:19:01
by
孙小夏
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DS/Syby
]
[已完结]
求QSAR指导
(0/275)
蓝洛水seven
2013-02-28
2013-02-28 17:10:08
by
蓝洛水seven
[
其他
]
[已完结]
请问哪位能帮忙计算下甲基汞的分子直径
(0/375)
jiasirui
2013-02-28
2013-02-28 15:51:42
by
jiasirui
[
DS/Syby
]
DS做药效团的结果中的config值是什么意思?为什么我的一直降不到17?
(0/459)
xxwn
2013-02-28
2013-02-28 15:47:27
by
xxwn
[
Gromacs
]
[已完结]
无限体系构建,化学键怎么处理
(6/693)
saabx
2013-02-25
2013-02-28 15:22:08
by
saabx
[
DS/Syby
]
[已完结]
求中药单体分子与靶点蛋白的docking处理
(5/1577)
doctor88
2013-01-30
2013-02-28 13:44:42
by
装水的水杯
[
MS
]
[已完结]
lammps 求解
(0/1245)
mingmbm
2013-02-28
2013-02-28 11:25:06
by
mingmbm
[
MS
]
[已完结]
MS UFF立场
(2/471)
hplc303
2013-02-25
2013-02-28 10:06:38
by
hplc303
[
MS
]
[已完结]
跪求Oxidation reactions of H2O and N2O with Si clusters文献
(0/207)
Lzp425496024
2013-02-27
2013-02-27 18:56:43
by
Lzp425496024
[
DS/Syby
]
[关贴]
DS2.5.5 Hiphop遇到的产生多构象的问题
(0/272)
yinwzi
2013-02-27
2013-02-27 15:34:18
by
yinwzi
[
DS/Syby
]
【求助】如何利用DS获得已知配基ligand的SD files文件?
(8/2109)
xppcomeon
2009-12-07
2013-02-27 12:54:06
by
yinwzi
[
Gromacs
]
[已完结]
蛋白质与不规则基底间的contact area
(0/328)
little_lion
2013-02-27
2013-02-27 10:31:49
by
little_lion
[
DS/Syby
]
【求助】基于药效团的分子叠合
(17/3292)
sijifengsd
2010-12-17
2013-02-27 09:48:36
by
高興丶
[
Gromacs
]
[已完结]
gmx安装fftw时出现could not find mpi library for --enable-mpi
(5/5547)
little_lion
2012-08-27
2013-02-27 06:47:37
by
yaozhq
[
专家会诊
]
[已完结]
请问,蛋白质分子在不同温度下的构象能否模拟出来?
(8/1494)
kzyl
2012-06-12
2013-02-26 22:18:36
by
zh1987hs
[
Gromacs
]
【求助】求一个gromacs的中文教程,包括安装的部分,小弟新手,从零学起
(8/3842)
wdali
2010-10-25
2013-02-26 19:41:51
by
joy11
[
其他
]
[已完结]
chembiodraw的spectrum-structure assignment功能用不了,怎么办?
(0/460)
csuflyingfish
2013-02-26
2013-02-26 14:38:03
by
csuflyingfish
[
DS/Syby
]
[已完结]
分子对接什么时候去水,什么时候不去水?
(
1
2
)
(15/4149)
lily_llf
2011-06-13
2013-02-25 14:24:48
by
joy11
[
MS
]
[已完结]
在MS中怎样画一个圆形的石墨烯片
(3/1254)
雷风雨
2013-02-22
2013-02-25 10:31:01
by
xieluxielu
[
专家会诊
]
[已完结]
系综平均
(5/654)
fcg200808
2013-02-22
2013-02-23 23:55:06
by
fhh2626
[
MS
]
[已完结]
MS中dmol3模块计算完后,outmol文件中有没有每个原子的受力情况
(2/588)
xx4751
2013-02-23
2013-02-23 21:10:22
by
xx4751
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求 TiAl合金的MEAM势文件
(1/632)
tfl03
2013-02-23
2013-02-23 20:42:51
by
tfl03
[
其他
]
[已完结]
有没有根据pdb结构计算酶的活性空腔体积的软件
(2/506)
qbin1304
2013-02-20
2013-02-23 19:46:02
by
zh1987hs
[
MS
]
大家学习MS都看过哪些文献啊~求推荐
(1/422)
448112596
2012-11-08
2013-02-23 15:24:45
by
17火耳17
[
MS
]
[已完结]
用MS中dmol3模块计算,outmol文件中DERIVATIVES代表什么意思
(0/439)
xx4751
2013-02-23
2013-02-23 15:06:27
by
xx4751
[
DS/Syby
]
[已完结]
在DS中建立化合物库遇到问题
(1/551)
pengroc03
2013-02-22
2013-02-23 09:27:27
by
pengroc03
[
MS
]
[已完结]
无机物的rietveld的精修问题
(0/313)
17火耳17
2013-02-23
2013-02-23 08:12:06
by
17火耳17
[
DS/Syby
]
[已完结]
求帮忙转为供分子对接的mol2格式
(2/830)
tanguangguo
2013-02-22
2013-02-22 22:44:37
by
tanguangguo
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
关于ligandfit的一个问题
(0/448)
pengroc03
2013-02-21
2013-02-21 16:34:55
by
pengroc03
[
资源
]
[已完结]
HSA的PDB ID号
(2/1223)
zhangjuling
2013-02-20
2013-02-21 12:12:41
by
lilin_sensor
[
CPMD/CP
]
[已完结]
cp2k用多少核并行效果好?
(6/2580)
jfx9902
2013-02-18
2013-02-19 21:01:03
by
ddll_slsl
[
LAMMPS/
]
[已完结]
关于lampps中Fe的F -S 势
(2/1020)
上官七七
2013-02-01
2013-02-19 07:37:59
by
上官七七
[
MS
]
[已完结]
Pd结构几何优化问题
(3/556)
17火耳17
2013-02-16
2013-02-18 22:37:05
by
hakuna
[
DS/Syby
]
[已完结]
做CoMSIA的时候一计算疏水键(hydrophobic bond)软件就重启
(1/436)
YILUK
2013-01-21
2013-02-18 16:12:03
by
joy11
[
其他
]
[已完结]
化学反应速率常数
(模拟EPI+1)
(3/2251)
2009010884
2011-07-04
2013-02-17 16:04:55
by
wangeinstein
[
LAMMPS/
]
[已完结]
VMD怎么看
(6/1413)
水影恋镜
2012-05-23
2013-02-17 11:18:14
by
我爱罗_沙
[
LAMMPS/
]
[已完结]
请教如何判断体系里的空位?
(5/1198)
hongyesies
2012-02-16
2013-02-17 11:15:21
by
我爱罗_沙
[
MS
]
[已完结]
请问用deepview怎样表示蛋白表面的电势?
(0/339)
changjiao
2013-02-16
2013-02-16 10:46:51
by
changjiao
[
LAMMPS/
]
[已完结]
用VMD导入lammpstrj,可是不可用,显示有错
(8/2548)
自由黑黑
2013-02-06
2013-02-15 18:02:32
by
帅帅@
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
关于模拟离子液体力场的选择(opls-aa)
(9/4927)
wup123
2013-01-27
2013-02-15 10:53:51
by
wup123
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
关于斜晶胞建模及导出用于lammps计算问题
(1/2337)
忽忽apple
2013-01-28
2013-02-15 09:04:54
by
ddll_slsl
[
Gromacs
]
[已完结]
[关贴]
How to open AMBER and MARDIGRAS in RedHat
(3/494)
peier
2013-02-09
2013-02-14 11:38:20
by
welles.fong
[
MS
]
[已完结]
一些常用分子的生成热大家都是从哪里获得的?
(3/592)
invincibly
2011-04-25
2013-02-13 19:01:46
by
yanhualu15
[
其他
]
春节快乐
(0/396)
meixinqing
2013-02-13
2013-02-13 14:00:34
by
meixinqing
[
DS/Syby
]
[已完结]
怎样通过DS重叠目的蛋白和模板蛋白,求解!!!
(2/465)
sootiey
2013-02-05
2013-02-08 16:20:28
by
snow1580
[
MS
]
[已完结]
谁能帮我分子对接一个化合物啊,不胜感激
(7/1257)
luchenshu
2013-02-04
2013-02-08 10:40:43
by
客舟听雨
[
MS
]
[已完结]
MS晶体建模
(2/573)
waneli
2013-02-07
2013-02-08 01:48:08
by
waneli
[
MS
]
[已完结]
自扩散系数 和 扩散距离(或自由程)之间的关系
(0/4289)
cmwangdft
2013-02-07
2013-02-07 21:55:48
by
cmwangdft
[
其他
]
[已完结]
高斯中计算电荷时,Mg的电荷一直是0.5左右
(0/426)
liaoliao0510
2013-02-07
2013-02-07 19:26:27
by
liaoliao0510
[
专家会诊
]
[已完结]
想模拟原子在电场下的运动 能垒 什么软件比较合适
(0/257)
xiaoboy185
2013-02-07
2013-02-07 11:00:05
by
xiaoboy185
[
其他
]
[已完结]
DPPC模拟问题
(0/284)
suny2005
2013-02-06
2013-02-06 17:22:43
by
suny2005
[
MS
]
[已完结]
请问MS动力学的步骤···
(4/1072)
seven23
2013-02-05
2013-02-06 13:12:40
by
ddll_slsl
[
专家会诊
]
[已完结]
多糖的动力学模拟
(1/703)
miaoqiao
2013-02-02
2013-02-05 18:10:35
by
sqfn
[
DS/Syby
]
[已完结]
DS做CDOCKER问题请教
(5/2335)
yu15742837
2012-03-24
2013-02-04 10:42:06
by
gg05
[
Gromacs
]
[已完结]
关于Implicit ligand sampling的问题!求助!
(0/273)
rainson1988
2013-02-01
2013-02-01 20:14:14
by
rainson1988
[
MS
]
分子动力学里的RMSD值在什么范围内说明对接结果是稳定的?
(2/4764)
lirenshi
2013-02-01
2013-02-01 11:54:33
by
月雨风扬
[
MS
]
同一个蛋白质不同的人和期刊报道的PDB编号都不一样,用哪个好呢?
(4/1794)
a-jiao
2013-01-31
2013-02-01 08:49:22
by
a-jiao
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
autogird之后不能生产—rigid.HD.map文件 求教
(0/377)
dapaodiao
2013-02-01
2013-02-01 00:16:30
by
dapaodiao
[
MS
]
[已完结]
采用全部顺式构象并垂直于x和y轴组成的平面,在MS中怎么实现的?
(2/352)
zhaopinhui08
2013-01-31
2013-01-31 22:35:08
by
zhaopinhui08
[
CPMD/CP
]
[已完结]
速度自相关函数的计算
(0/1703)
z6242948
2013-01-31
2013-01-31 16:35:17
by
z6242948
[
专家会诊
]
请问大神们,分子离子的电荷局域化的物理本质是什么?
(0/938)
zhangpengju
2013-01-31
2013-01-31 12:07:38
by
zhangpengju
[
DS/Syby
]
Sybyl中,可不可以将分子随意放到蛋白质某个氨基酸残基附近?
(6/1443)
lixin240
2013-01-23
2013-01-31 09:41:05
by
qustwq
[
DS/Syby
]
Make the molecular spreadsheet from all steroids in the database???问题急求
(2/474)
a-jiao
2012-07-05
2013-01-31 09:00:31
by
a-jiao
[
专家会诊
]
[已完结]
material studio 进行轨道计算时为什么不能显示HOMO,LUMO图?
(1/3147)
609013615
2013-01-24
2013-01-30 21:51:15
by
OLED哥
[
MS
]
GCMC模拟气体吸附时各种吸附量该怎么求?
(5/4056)
clwl
2013-01-28
2013-01-30 20:49:44
by
原来是梦8804
[
Monte C
]
[已完结]
mc模拟蛋白和聚合物膜间的吸附初始构象
(1/436)
little_lion
2012-12-27
2013-01-30 15:50:39
by
明月照清渠
[
MS
]
[已完结]
Pymol分析对接后的pdb文件
(6/4215)
962162633
2013-01-28
2013-01-30 15:36:45
by
qdbh0806
[
ME/Gulp
]
计算声子谱 求Ge Sb Te的势函数
(2/762)
pengyu_long
2011-04-05
2013-01-30 12:45:59
by
2235803
[
ME/Gulp
]
[已完结]
势函数截断距离如何取?
(
1
2
)
(11/2977)
舞昂琦VoVo
2012-05-29
2013-01-30 12:33:32
by
2235803
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
atomeye后处理问题
(0/383)
differe
2013-01-30
2013-01-30 11:44:32
by
differe
[
MS
]
[已完结]
请问做原子模拟或者分子模拟时势函数的选取
(6/1622)
xuzhousnwj
2013-01-28
2013-01-30 10:42:28
by
chaizhm
[
MS
]
polymer和polymer之间相互作用的计算用什么软件?
(2/664)
grexx213
2013-01-29
2013-01-29 23:01:05
by
grexx213
[
专家会诊
]
[已完结]
木材细胞结构可以建立分子模型吗?
(0/403)
yy5393
2013-01-29
2013-01-29 18:10:38
by
yy5393
[
DS/Syby
]
[已完结]
[关贴]
sybyl下如何实现命令行叠合大分子?
(2/432)
ValYu
2013-01-24
2013-01-29 16:10:19
by
jiaoyixiong
[
MS
]
[已完结]
纯水, F-, Cl-, Br-, I-, SCN-, ClO4- 溶液的极性大小?
(1/1207)
mengsk
2013-01-29
2013-01-29 09:52:26
by
zhoupeng87
[
Gromacs
]
[已完结]
求用到AMBER force field的开源软件
(
1
2
)
(10/2204)
暖水袋
2013-01-16
2013-01-29 09:16:50
by
暖水袋
[
其他
]
[已完结]
为什么一个原子可以和周围五六个原子有作用?
(7/2019)
河外生命
2013-01-27
2013-01-29 02:01:19
by
songyunlong
[
MS
]
[已完结]
MS4.4 安装出现关于active x不能创建对象,希望大家解我燃眉之急,定当重谢
(1/481)
gx730
2013-01-25
2013-01-28 21:55:07
by
zhaopinhui08
[
LAMMPS/
]
[已完结]
求VMD显示动态成键问题。
(0/1634)
herarysara
2013-01-28
2013-01-28 17:42:18
by
herarysara
[
CPMD/CP
]
[已完结]
[关贴]
求cp2k中MD计算,怎样加快scf收敛?
(2/2136)
herarysara
2013-01-11
2013-01-28 15:27:34
by
fuyuhaoy
[
Gromacs
]
[已完结]
关于能垒讨论
(0/340)
mengsk
2013-01-28
2013-01-28 09:03:28
by
mengsk
[
其他
]
大家用过Stella这个软件吗?
(3/913)
jaychenyl
2012-08-02
2013-01-28 07:52:32
by
songyunlong
[
专家会诊
]
[已完结]
BSA与小分子结合参数及热力学计算的问题
(0/827)
haofangsdu
2013-01-27
2013-01-27 14:58:27
by
haofangsdu
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