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962162633

金虫 (小有名气)

[求助] Pymol分析对接后的pdb文件

使用Pymol分析蛋白质与蛋白质相互作用位置,显示出相互作用的残基、以及氢键作用等,图片效果在附件中。用Pymol能做出附件所示图片吗?之前没有做过,敬请各位大虾指点!!!谢谢!
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李蓝莓

金虫 (小有名气)

我也很想知道怎么做的 ,你知道吗?可不可以教教我
2楼2013-01-28 22:46:58
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qdbh0806

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-29 16:08:07
962162633: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-30 12:24:46
文字可以保存图片之后再加上。至于图嘛,先按照在显示界面右侧对应的object的A-preset-publication,显示界面右下角有个S可以把序列调出来,按照你需要的选择序列,显示界面对应的object旁边C可以改变颜色,S显示不同的模式,你选择好要显示成surface的部分序列后按照S-surface,再在控制界面中Setting-transparency-surface-20%就好了。
至于距离可以在控制界面wizard-measurement中,量出来就好了。
如果需要还可以设置一下光线让图片更好看些。
3楼2013-01-29 11:40:55
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962162633

金虫 (小有名气)

作用界面完全是黑色的,根本改变不了颜色。您之前有没有用Pymol处理过类似的图片?给我一个实例吧!
4楼2013-01-29 15:44:09
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
建议楼主好好学习一下pymol软件,论坛里有相关的教程。
从小到大就没清闲过,要不就是穷,穷的活着没意思,要不就是累,累得活着没意思,现在是又穷又累了
5楼2013-01-30 09:41:40
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962162633

金虫 (小有名气)

那是一定的,谢谢你的提议
6楼2013-01-30 12:26:29
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qdbh0806

银虫 (小有名气)

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2013-01-30 22:00:49
http://good.gd/2416359.htm给你做了几张简单截图,你试试吧,再不行只能看看教程了,这个教程里都有。
7楼2013-01-30 15:36:45
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