应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Pymol分析对接后的pdb文件
51/1返回列表
查看: 4144  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

962162633

金虫 (小有名气)

[求助] Pymol分析对接后的pdb文件

使用Pymol分析蛋白质与蛋白质相互作用位置，显示出相互作用的残基、以及氢键作用等，图片效果在附件中。用Pymol能做出附件所示图片吗？之前没有做过，敬请各位大虾指点！！！谢谢！
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 未命名.jpg
    • 2013-01-28 21:04:55, 1.13 M
  • 附件 2 : 未命名1.jpg
    • 2013-01-28 21:04:56, 1.13 M
  • 附件 3 : 未命名2.jpg
    • 2013-01-28 21:04:59, 1.13 M
  • 附件 4 : 未命名3.jpg
    • 2013-01-28 21:05:01, 1.13 M

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VMD 软件 分子模拟要术 pymol/VMD/Origin

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-01-28 21:08:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qdbh0806

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+3, 鼓励交流 2013-01-29 16:08:07
962162633: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-01-30 12:24:46
文字可以保存图片之后再加上。至于图嘛，先按照在显示界面右侧对应的object的A-preset-publication，显示界面右下角有个S可以把序列调出来，按照你需要的选择序列，显示界面对应的object旁边C可以改变颜色，S显示不同的模式，你选择好要显示成surface的部分序列后按照S-surface，再在控制界面中Setting-transparency-surface-20%就好了。
至于距离可以在控制界面wizard-measurement中，量出来就好了。
如果需要还可以设置一下光线让图片更好看些。
赞一下 回复此楼
3楼2013-01-29 11:40:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

李蓝莓

金虫 (小有名气)
我也很想知道怎么做的 ，你知道吗？可不可以教教我
赞一下 回复此楼
2楼2013-01-28 22:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

962162633

金虫 (小有名气)
作用界面完全是黑色的，根本改变不了颜色。您之前有没有用Pymol处理过类似的图片？给我一个实例吧！
赞一下 回复此楼
4楼2013-01-29 15:44:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议楼主好好学习一下pymol软件，论坛里有相关的教程。
赞一下 回复此楼
从小到大就没清闲过，要不就是穷，穷的活着没意思，要不就是累，累得活着没意思，现在是又穷又累了
5楼2013-01-30 09:41:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +7 zjl的号 2026-03-16 12/600 2026-03-17 18:22 by 重科小霸王
[考研] 302求调剂 +9 负心者当诛 2026-03-11 9/450 2026-03-17 17:13 by ruiyingmiao
[考研] 332求调剂 +6 Zz版 2026-03-13 6/300 2026-03-17 17:03 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 085600材料与化工 +4 安全上岸！ 2026-03-16 4/200 2026-03-17 14:02 by 勇敢太监王公公
[考研] 一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 机械专硕325，寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +5 Liwangman 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:10 by 我的船我的海
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 085600材料与化工 求调剂 +13 enenenhui 2026-03-13 14/700 2026-03-16 15:19 by 了了了了。。
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生，2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭