| 查看: 7151 | 回复: 4 | |||
PSA专家顾问 (著名写手)
|
[求助]
用pymol显示氢键的问题，在线等，急需解决，谢谢！
|
|
对接后的PDB文件用pymol显示不出ligplus能显示出来的那个氢键（ALA173），而pymol显示出了ligplus不显示的氢键（TYR179）。我想要蛋白的二级结构那样子的图，所以想用pymol作图，另外我用MVD，ds也显示了结果和pymol一样。我需要用ALA173这个来说明问题，我猜有可能是氢键的距离问题，这个键长是3.26，我可以通过什么设置来改变pymol的cutoff吗？请大家指导 我现在把PDB文件传上来，希望能够得到你们的帮助，谢谢！ 顺祝中秋快乐 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 pymol/VMD/Origin |
» 猜你喜欢
自荐读博
已经有8人回复
-
投稿Elsevier的杂志（返修），总是在选择OA和subscription界面被踢皮球
已经有8人回复
-
自然科学基金委宣布启动申请书“瘦身提质”行动
已经有4人回复
-
求个博导看看
已经有18人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 网申时参与过的科研项目问题
已经有11人回复
- gaussian09 linux安装问题
已经有5人回复
- 甲醛分子之间能不能产生氢键？
已经有3人回复
- Diamond 画氢键问题
已经有7人回复
- 新手无脑问题，希望有人解答~谢谢！（句法错误）
已经有6人回复
- 求教过柱子的问题，谢谢
已经有15人回复
- 大侠们：多肽修饰壳聚糖的分离问题 谢谢？
已经有5人回复
- 公派出国出国系统不能完全显示问题
已经有7人回复
- 紧急求助各位童鞋，关于四溴双酚A溶解问题，谢谢大家！！
已经有7人回复
- 报考华科营养与食品卫生专业，可能无缘复试，求支招~谢谢！
已经有3人回复
- 帮忙查一下几个药物的溶解度，每个5BB，谢谢！
已经有6人回复
- 求药学专业调剂信息 急需 最好是药分或药剂 谢谢啦
已经有6人回复
- 请教关于转子流量计与压强相关的问题，请大家帮帮忙，谢谢
已经有3人回复
- 显示器屏幕显示变小了，如何调回全屏！急求！！！
已经有10人回复
- 请高手指导，我的pymol为何不显示氢键
已经有4人回复
2楼2011-09-09 01:21:17
PSA
专家顾问 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 41 (小学生)
- 贵宾: 0.287
- 金币: 6557.6
- 散金: 1295
- 红花: 10
- 沙发: 2
- 帖子: 1157
- 在线: 392.7小时
- 虫号: 685572
- 注册: 2008-12-31
- 专业: 药物化学
- 管辖: 生物医药区
3楼2011-09-09 08:37:34
flyingkid
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 413.2
- 帖子: 156
- 在线: 25.4小时
- 虫号: 1244934
- 注册: 2011-03-25
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
4楼2011-09-17 19:12:57
PSA
专家顾问 (著名写手)
- 模拟EPI: 1
- 应助: 41 (小学生)
- 贵宾: 0.287
- 金币: 6557.6
- 散金: 1295
- 红花: 10
- 沙发: 2
- 帖子: 1157
- 在线: 392.7小时
- 虫号: 685572
- 注册: 2008-12-31
- 专业: 药物化学
- 管辖: 生物医药区
5楼2011-09-17 20:08:17