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用pymol显示氢键的问题,在线等,急需解决,谢谢!
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对接后的PDB文件用pymol显示不出ligplus能显示出来的那个氢键(ALA173),而pymol显示出了ligplus不显示的氢键(TYR179)。我想要蛋白的二级结构那样子的图,所以想用pymol作图,另外我用MVD,ds也显示了结果和pymol一样。我需要用ALA173这个来说明问题,我猜有可能是氢键的距离问题,这个键长是3.26,我可以通过什么设置来改变pymol的cutoff吗?请大家指导 我现在把PDB文件传上来,希望能够得到你们的帮助,谢谢! 顺祝中秋快乐 |
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pymol/VMD/Origin |
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3楼2011-09-09 08:37:34
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