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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » How to open AMBER and MARDIGRAS in RedHat
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peier

银虫 (初入文坛)

[求助] How to open AMBER and MARDIGRAS in RedHat

I'm new in operating AMBER and MARDIGRAS. I meet a problem when I want to open AMBER and MARDIGRAS.
My system is RedHat. The AMBER and MARDIGRAS is positioned under usr/local/AMBER9 and usr/local/mardigras. I usually use terminal to open softwares like sybyl. But I don't know the command of opening AMBER and MARDIGRAS. So I would like to ask if any one knows the command.
Thanks very much!!!
Ergent!!!
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简单就快乐！
1楼 2013-02-09 10:57:44
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sqfn

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-02-19 19:59:58
amber与sybyl不一样。她不是图形界面操作的，除了ambertools里面的xleap工具，用来构建模拟体系。amber主要以命令操作为主。具体可见去看amber官方网站上的教程。
至于mardigars，我没用过，不知道。
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2楼2013-02-09 21:53:15
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welles.fong

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sqfn at 2013-02-09 21:53:15
amber与sybyl不一样。她不是图形界面操作的，除了ambertools里面的xleap工具，用来构建模拟体系。amber主要以命令操作为主。具体可见去看amber官方网站上的教程。
至于mardigars，我没用过，不知道。

呃，我是lz的同學，此貼是我借她帳號發的。現在補充一下。
我是不知道進入AMBER和MARDIGRAS的命令。例如sybyl，我知道在終端機中輸入“sybyl7.3”就可以進入sybyl7.3版。但對於前兩者，我不知道要輸入什麽命令才可以打開這兩個程序。
希望這個補充說明會清楚些，謝謝！
赞一下 回复此楼
3楼2013-02-14 09:52:06
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welles.fong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

再看了一次manual，大概知道怎麼回事了。原因應該是這樣：AMBER不像sybyl那樣一個命令打開軟件，而是用不同命令打開不同模塊。
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4楼2013-02-14 11:38:20
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