应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » How to open AMBER and MARDIGRAS in RedHat
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 463  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

peier

银虫 (初入文坛)

[求助] How to open AMBER and MARDIGRAS in RedHat

I'm new in operating AMBER and MARDIGRAS. I meet a problem when I want to open AMBER and MARDIGRAS.
My system is RedHat. The AMBER and MARDIGRAS is positioned under usr/local/AMBER9 and usr/local/mardigras. I usually use terminal to open softwares like sybyl. But I don't know the command of opening AMBER and MARDIGRAS. So I would like to ask if any one knows the command.
Thanks very much!!!
Ergent!!!
回复此楼

» 猜你喜欢
简单就快乐！
1楼 2013-02-09 10:57:44
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

welles.fong

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

再看了一次manual，大概知道怎麼回事了。原因應該是這樣：AMBER不像sybyl那樣一個命令打開軟件，而是用不同命令打開不同模塊。
赞一下 回复此楼
4楼2013-02-14 11:38:20
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

sqfn

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-02-19 19:59:58
amber与sybyl不一样。她不是图形界面操作的，除了ambertools里面的xleap工具，用来构建模拟体系。amber主要以命令操作为主。具体可见去看amber官方网站上的教程。
至于mardigars，我没用过，不知道。
赞一下 回复此楼
2楼2013-02-09 21:53:15
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

welles.fong

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sqfn at 2013-02-09 21:53:15
amber与sybyl不一样。她不是图形界面操作的，除了ambertools里面的xleap工具，用来构建模拟体系。amber主要以命令操作为主。具体可见去看amber官方网站上的教程。
至于mardigars，我没用过，不知道。

呃，我是lz的同學，此貼是我借她帳號發的。現在補充一下。
我是不知道進入AMBER和MARDIGRAS的命令。例如sybyl，我知道在終端機中輸入“sybyl7.3”就可以進入sybyl7.3版。但對於前兩者，我不知道要輸入什麽命令才可以打開這兩個程序。
希望這個補充說明會清楚些，謝謝！
赞一下 回复此楼
3楼2013-02-14 09:52:06
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +8 熊二想上岸 2026-04-04 8/400 2026-04-05 05:27 by houyaoxu
[考研] 278求调剂 +14 范婷娜 2026-04-04 15/750 2026-04-04 22:15 by lqwchd
[考研] 材料调剂 +10 懒羊羊轻置玉臀 2026-04-02 11/550 2026-04-04 21:56 by laoshidan
[考研] 085400电子信息319求调剂（接受跨专业调剂） +5 星星不眨眼喽 2026-04-03 6/300 2026-04-04 21:50 by hemengdong
[考研] 考研求调剂 +3 木心想继续深造 2026-04-03 3/150 2026-04-03 21:56 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358 +4 cs0106 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:41 by 百灵童888
[考研] 调剂 +3 osbbx 2026-04-02 3/150 2026-04-03 07:47 by cc8418
[考研] 材料0856 英一数二 323 求调剂 +10 袁sy 2026-04-01 10/500 2026-04-02 19:52 by xingsh
[考研] 一志愿北京科技大学085601材料工程英一数二初试总分335求调剂 +8 双马尾痞老板2 2026-04-02 9/450 2026-04-02 14:45 by 5896
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[考研] 286分调剂 +20 Faune 2026-03-30 22/1100 2026-04-02 13:24 by clyblh
[考研] 一志愿9初试366 本双非求调剂 +4 运气来得若有似� 2026-04-02 4/200 2026-04-02 09:56 by guanxin1001
[考研] 377求调剂 +3 RASKIN 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:45 by zzchen2000
[考研] 302求调剂一志愿北航070300，本科郑大化学 +8 圣日耳曼条 2026-04-01 11/550 2026-04-02 07:40 by chemdavid
[考研] 材料专业调剂 +5 啦啦啦哭 2026-03-31 6/300 2026-04-01 16:48 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +7 @taotao 2026-03-30 7/350 2026-04-01 14:30 by chenqifeng666
[考研] 求调剂，一志愿北林食品与营养095500，301分，已过六级，有科研经历 +4 快乐储蓄罐 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:26 by JourneyLucky
[考研] 318求调剂 +10 陈晨79 2026-03-30 10/500 2026-03-31 17:37 by 544594351
[考研] 一志愿中海洋320化学工程与技术学硕求调剂 +8 披星河 2026-03-30 8/400 2026-03-31 08:53 by lbsjt
[考研] 哈尔滨工业大学材料与化工专硕378求调剂 +3 塔比乌斯 2026-03-30 3/150 2026-03-30 22:55 by 无际的草原
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭