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amber MD过程中出现的问题 求各位大神解答
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Gromacs
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[已完结]
求质心,粗粒化后的参数获取
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Leliel
2013-07-30
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by
guyun007
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DS/Syby
]
[已完结]
薛定谔glide板块中对于配体的优化
(0/878)
脱掉的夏
2015-01-22
2015-01-22 10:53:12
by
脱掉的夏
[
MS
]
[已完结]
二氧化硅晶体cleave plane问题
(
1
2
)
(评阅+1)
(17/3167)
吉米爱多
2015-01-20
2015-01-22 09:02:21
by
吉米爱多
[
专家会诊
]
[已完结]
[关贴]
求教 对solid state 的能量最小化,structure relaxation
(评阅+1)
(0/345)
xujun16
2015-01-22
2015-01-22 00:45:54
by
xujun16
[
MS
]
[已完结]
奇怪!win7下MS7.0闭后就无法重连linux计算服务器了
(1/464)
sandf
2015-01-21
2015-01-21 19:01:15
by
sandf
[
MS
]
[已完结]
求助 MS中discover模块中建模的问题
(
1
2
)
(12/2301)
dolphin_star
2012-12-13
2015-01-21 17:30:46
by
czj1019
[
LAMMPS/
]
[已完结]
pair_coeff中的截断半径问题求助,
(0/999)
数峰青820
2015-01-21
2015-01-21 17:25:25
by
数峰青820
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
MS提交过渡态搜索时提示“Please ensure that a trajectory document is active”
(评阅+1)
(5/1236)
hongsemenghuan
2015-01-16
2015-01-21 15:38:33
by
hongsemenghuan
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
产物与反应物建立过渡态结构的问题
(评阅+1)
(2/1084)
飞的genggao
2015-01-18
2015-01-21 15:15:13
by
飞的genggao
[
MS
]
[已完结]
MS算氢键以后怎么算能量
(2/1415)
huoqilin01
2014-09-15
2015-01-21 13:34:10
by
小双423
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
求graphene indentation的in文件,重金悬赏
(评阅+1)
(0/275)
学员C3FP9l
2015-01-21
2015-01-21 13:04:27
by
卫兵gwb
[
MS
]
[已完结]
服务器提交MS作业,为什么得不到能量图(SimulationEnergies.xcd )?
(6/1317)
voleyes
2011-12-13
2015-01-21 13:03:56
by
yuyanpiaoxue
[
MS
]
[已完结]
forcite 进行径向分布函数分析
(4/2529)
haiyuntianya
2015-01-19
2015-01-21 11:25:58
by
congtaiupc
[
MS
]
[已完结]
分子孔道大小对气体自扩散系数有什么影响?
(评阅+1)
(0/531)
aa2349439
2015-01-21
2015-01-21 10:53:38
by
aa2349439
[
MS
]
MS中的高斯板块怎么画HOMO图?
(0/938)
nana5281
2015-01-21
2015-01-21 10:20:06
by
nana5281
[
LAMMPS/
]
【讨论】求教:data和input文件都能含有的输入内容
(4/1367)
boowood
2010-03-05
2015-01-21 09:28:43
by
bmnce
[
MS
]
[已完结]
【作图】 分子筛主要孔道走向图的画法
(评阅+1)
(3/2254)
lusostty
2015-01-19
2015-01-21 08:27:24
by
lusostty
[
MS
]
[已完结]
模拟后蛋白分析问题
(评阅+6)
(1/393)
小丫丫———
2014-03-09
2015-01-21 07:40:42
by
229231168
[
DS/Syby
]
[已完结]
GLOD分子模拟结果分析和参数设置
(0/549)
lyxdjdj
2015-01-20
2015-01-20 23:02:48
by
lyxdjdj
[
Gromacs
]
[已完结]
Gromacs 做教程1 水中溶菌酶时,npt压力不是1个大气压。
(2/1314)
guoxinw
2015-01-02
2015-01-20 15:11:53
by
awaken2013
[
MS
]
[已完结]
求助找一篇文献:Algorithms for brownian dynamics
(2/435)
fannieyang
2015-01-20
2015-01-20 09:02:47
by
liaobuqi138
[
资源
]
[已完结]
求多肽同源建模的相关文献 多肽能不能像蛋白质一样同源建模呢
(评阅+1)
(1/1013)
cheor3war
2015-01-19
2015-01-20 00:23:38
by
awaken2013
[
LAMMPS/
]
[已完结]
分子
(评阅+1)
(0/260)
zdyhbz
2015-01-19
2015-01-19 14:10:03
by
zdyhbz
[
MS
]
[已完结]
【求助】重装ms后依然有这个问题,求虫友们友情帮忙~
(3/493)
809011916
2014-12-15
2015-01-19 13:43:21
by
809011916
[
DS/Syby
]
[已完结]
求问几个autodock的问题,蛋白质和小分子的对接
(评阅+1)
(7/3288)
空的天
2015-01-16
2015-01-19 12:05:11
by
晔?�
[
MS
]
[已完结]
求助:计算MM_PBSA的问题
(评阅+1)
(0/308)
anran19888
2015-01-19
2015-01-19 11:09:24
by
anran19888
[
MS
]
[已完结]
如何判断一个化学键是否穿过一个苯环或者原子形成的其他环
(评阅+1)
(5/1995)
winnds
2015-01-17
2015-01-19 09:14:02
by
pigrass
[
Gromacs
]
[已完结]
VMD 统计某个分子周围水分子数目随时间的变化
(9/4718)
xiaoyingw
2011-10-18
2015-01-19 08:13:35
by
xwwjd
[
专家会诊
]
[已完结]
稀薄气体及其与液面相互作用问题-那款MD软件好?
(1/561)
stones_me
2012-12-05
2015-01-19 08:07:45
by
nmzld
[
其他
]
[已完结]
去哪可以查到分子的范德华直径?
(评阅+1)
(2/1856)
1028942887
2015-01-18
2015-01-18 16:21:04
by
1028942887
[
Gromacs
]
[已完结]
有关计算MMPBSA的问题
(评阅+1)
(0/603)
anran19888
2015-01-18
2015-01-18 16:12:33
by
anran19888
[
LAMMPS/
]
[已完结]
NPT动力学之后出现负压
(评阅+1)
(2/1362)
Materialman
2015-01-12
2015-01-18 06:36:31
by
abinitio
[
Gromacs
]
[已完结]
请问做胶束分子模拟的时候,那些立场参数都是从哪里得来的呢?
(1/312)
白玉浴血
2014-12-18
2015-01-17 22:20:28
by
231645
[
其他
]
[已完结]
分子模拟基础学习方法
(评阅+1)
(3/861)
小蜜蜂会叮人
2014-11-28
2015-01-17 22:10:23
by
231645
[
MS
]
[已完结]
morphology模块
(评阅+1)
(2/860)
董倩倩
2015-01-17
2015-01-17 15:02:01
by
董倩倩
[
Gromacs
]
分子模拟时间越长越好吗?
(评阅+1)
(模拟EPI+9)
(44/18752)
奋斗1s
2011-06-30
2015-01-17 06:27:24
by
背包旅客
[
LAMMPS/
]
新手请问下图代表什么意思
(评阅+1)
(0/353)
bmnce
2015-01-16
2015-01-16 18:52:53
by
bmnce
[
MS
]
[已完结]
怎样得到吸附结构的分子密度分布曲线
(评阅+1)
(9/3226)
wangfei天空
2015-01-15
2015-01-16 16:23:32
by
pigrass
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
建模的时候如何删除,重叠的多余原子
(评阅+1)
(1/2319)
山谷幽壑
2015-01-16
2015-01-16 14:49:17
by
zsjan
[
LAMMPS/
]
弛豫中的运动
(3/676)
ysshj
2014-09-15
2015-01-16 13:51:10
by
ysshj
[
Gromacs
]
【求助】怎样才能使整个盒子充满水,用gromacs
(6/3614)
patent
2011-03-09
2015-01-16 12:33:20
by
背包旅客
[
MS
]
[已完结]
高斯画出的构型能用MS优化吗?
(评阅+1)
(0/728)
徐建昌老二
2015-01-16
2015-01-16 11:34:37
by
徐建昌老二
[
MS
]
请问怎么用MS构建不同湿度的聚乙烯醇模型?
(2/995)
世媛ROSE
2015-01-15
2015-01-16 09:14:02
by
赵红霞
[
LAMMPS/
]
[已完结]
用Lammps模拟HAP(hydroxyapatite)晶体
(2/916)
kimi838
2013-08-22
2015-01-16 08:14:03
by
嗜竹情深
[
Gromacs
]
[已完结]
分子动力学模拟“边界问题”含义
(
1
2
)
(评阅+1)
(10/3849)
lmyiop
2014-03-01
2015-01-16 08:11:02
by
菜菜瓜瓜虫虫
[
其他
]
[已完结]
pymol6-芳环质心距离的画法,请求详细介绍步骤方法
(评阅+1)
(0/1759)
tianpingpe
2015-01-16
2015-01-16 00:54:52
by
tianpingpe
[
MS
]
[已完结]
如何在MS的三维界面上画出一个圆柱形状的区域啊?
(评阅+1)
(4/1721)
长大小慧慧
2014-12-15
2015-01-15 17:12:44
by
upc穆宁
[
资源
]
量子化学研究网站
(评阅+1)
(0/513)
miaoskypop
2015-01-15
2015-01-15 14:53:41
by
miaoskypop
[
MS
]
[已完结]
求助NaA(4A)和CaA(5A)分子筛的晶胞结构
(评阅+1)
(3/1513)
故事是这样的
2015-01-14
2015-01-15 09:10:55
by
故事是这样的
[
LAMMPS/
]
lammps新手如何看手册的
(评阅+1)
(0/861)
bmnce
2015-01-14
2015-01-14 17:55:45
by
bmnce
[
Gromacs
]
[已完结]
gromacs pull的问题!10金币
(评阅+6)
(7/1911)
3115321
2013-12-11
2015-01-14 12:06:55
by
wpl324
[
MS
]
[已完结]
高分子聚二乙烯苯建模
(评阅+1)
(7/1581)
iljosie
2015-01-12
2015-01-14 11:17:26
by
iljosie
[
其他
]
[已完结]
amber分子动力学模拟
(评阅+1)
(0/768)
菲同寻常
2015-01-14
2015-01-14 09:53:53
by
菲同寻常
[
其他
]
【求助】全交联(非线型交联)高分子链如何模拟?
(1/643)
lifenliu
2010-05-06
2015-01-14 07:31:08
by
iljosie
[
MS
]
[已完结]
Materials Studio 7.0 计算PGA(一种高分子)密度,最终目的期望得到好的PGA分子结构
(评阅+1)
(2/1930)
oudegeshen
2015-01-09
2015-01-14 00:53:48
by
xuyihan
[
LAMMPS/
]
[已完结]
石墨烯纳米带只有一层原子,该如何定义其抗弯强度或拉伸强度?
(评阅+1)
(1/906)
fqwacf
2015-01-06
2015-01-13 22:26:56
by
luzihen
[
MS
]
[已完结]
请教采用forcite模块优化晶胞参数后,与实验值相比相差太大(偏差超过5%),怎么办!
(评阅+1)
(2/1620)
痴迷书童
2015-01-10
2015-01-13 22:24:25
by
luzihen
[
其他
]
[已完结]
[关贴]
求助 VMware-workstation-full-10.0.1-1379776的序列码。
(评阅+1)
(3/1055)
992648352
2014-07-19
2015-01-13 20:40:24
by
992648352
[
Monte C
]
[已完结]
[关贴]
music计算pmap出问题
(4/1036)
willowei
2013-08-03
2015-01-13 17:58:17
by
laufe
[
Gromacs
]
[已完结]
关于MS和GROMACS文件转换的问题
(评阅+1)
(8/2664)
孜孜--
2014-09-15
2015-01-13 16:39:40
by
georgexuz
[
MS
]
[已完结]
MS软件对水分子氢键数目的模拟用哪个模块
(评阅+5)
(2/1021)
wwwxhr
2013-11-04
2015-01-13 15:28:11
by
wangjing1083
[
MS
]
模拟载荷作用下晶体材料晶粒受载变化的仿真软件,请大家推荐下,谢谢
(评阅+1)
(0/374)
sohu820528
2015-01-13
2015-01-13 14:49:19
by
sohu820528
[
MS
]
Materials.Studio.v6.0使用,谢谢了,谢谢,,
(
1
2
)
(评阅+1)
(10/2620)
笑miA
2015-01-12
2015-01-13 14:06:56
by
笑miA
[
MS
]
有没有安装过MS7.0的,MS7.0能加外界压力吗?急求助。
(评阅+1)
(1/766)
laiyangcc
2015-01-13
2015-01-13 12:29:59
by
njuedu007
[
MS
]
[已完结]
谁会做分子动力学模拟?
(评阅+1)
(2/964)
zhjgl1980
2015-01-12
2015-01-13 11:18:32
by
chuntao118
[
专家会诊
]
[已完结]
求教回转半径和末端距的模拟细节
(评阅+1)
(6/1847)
diaobk
2015-01-12
2015-01-13 11:16:49
by
chuntao118
[
MS
]
[已完结]
[关贴]
运用蒙托卡罗方法计算吸附时,如何设置单原子模型,求指教
(评阅+1)
(0/416)
382124153
2015-01-13
2015-01-13 09:05:37
by
382124153
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps如何计算transverse current correlation function
(评阅+1)
(1/857)
JackieXiao
2015-01-12
2015-01-13 07:48:07
by
abinitio
[
MS
]
[已完结]
amber 中QM/MM模块的处理
(评阅+1)
(0/520)
tanshepei
2015-01-12
2015-01-12 17:30:51
by
tanshepei
[
LAMMPS/
]
[已完结]
lammps内部建模金属晶体,导入vmd中为什么没有金属键
(评阅+1)
(1/1381)
fei5122917
2014-12-29
2015-01-12 16:01:35
by
宝儿fan
[
MS
]
[已完结]
散尽金币!跪求MS建立水分子晶胞的详细过程!
(评阅+1)
(6/2257)
蔡元浩
2014-09-16
2015-01-12 11:51:36
by
georgexuz
[
MS
]
[已完结]
MS 64位运算
(评阅+1)
(5/1151)
dreamfly_ykf
2015-01-09
2015-01-12 11:47:59
by
njuedu007
[
Monte C
]
[已完结]
MUSIC痕量水怎么处理
(评阅+1)
(1/630)
xu0993
2015-01-09
2015-01-12 09:21:20
by
xu0993
[
LAMMPS/
]
[已完结]
[关贴]
求indent例子的原文件
(评阅+1)
(1/1085)
学员C3FP9l
2015-01-10
2015-01-12 08:27:08
by
abinitio
[
MS
]
[已完结]
分子筛晶胞和原包之间的转换
(1/502)
premonkey
2012-03-15
2015-01-12 08:24:50
by
石勤
[
MS
]
[已完结]
DPD粗粒化模型构建
(评阅+1)
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lrlws
2015-01-10
2015-01-10 22:13:38
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lrlws
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DS/Syby
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模拟化合物分子与金属离子螯合作用
(评阅+1)
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jhonsmith001
2015-01-10
2015-01-10 20:44:58
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jhonsmith001
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LAMMPS/
]
[已完结]
怎样去计算两个group里 任意两个原子之间的作用力吗
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z654023015
2014-12-12
2015-01-10 20:39:02
by
onion2440
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Gromacs
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[已完结]
求助gromacs高手~~~急!Orz~
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笨笨猫123
2015-01-07
2015-01-10 13:19:46
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awaken2013
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Monte C
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[已完结]
蛋白质分子体积的计算
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caizhongyu
2015-01-10
2015-01-10 11:27:22
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caizhongyu
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MS
]
[已完结]
MS软件打开过程中自动关闭
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芝麻小迪
2015-01-09
2015-01-09 23:00:47
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芝麻小迪
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DS/Syby
]
[已完结]
DS2.5安装求助
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well9103
2015-01-09
2015-01-09 16:40:44
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well9103
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专家会诊
]
[已完结]
为什么compassII力场没有铝离子
(评阅+1)
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15216105346
2015-01-09
2015-01-09 13:20:09
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15216105346
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ME/Gulp
]
[已完结]
gulp拟合分子力场,怎样确定力场参数
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vicky21as
2015-01-09
2015-01-09 11:44:10
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vicky21as
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MS
]
均方位移求扩散系数
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世媛ROSE
2015-01-05
2015-01-09 10:45:03
by
月只蓝
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Gromacs
]
Ubuntu 下自动安装gromacs
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奋斗1s
2011-05-30
2015-01-09 10:25:42
by
刚果红
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专家会诊
]
[已完结]
这怎么和常识有冲突?(Gaussian算出来的和常识有差别)
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淼淼逆天
2015-01-07
2015-01-09 10:02:32
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淼淼逆天
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MS
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构造聚合物
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世外人yww
2014-10-23
2015-01-09 08:11:28
by
呀呀杨会苗
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LAMMPS/
]
[已完结]
用Lammps模拟计算水的密度
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huachao90
2014-08-20
2015-01-09 07:06:24
by
alwynwen
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MS
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MS7.0并行效率很低如何处理
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youyno
2015-01-08
2015-01-09 04:07:58
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smutao
[
MS
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[已完结]
交联聚合物构建cell时总是提示带电超过默认的0.1
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xyujn
2015-01-08
2015-01-08 22:26:21
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xyujn
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Monte C
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[已完结]
作MOF的蒙特卡罗模拟吸附小分子时CIF文件有无序结构时如何处理
(评阅+1)
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youyno
2015-01-08
2015-01-08 22:02:39
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382124153
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DS/Syby
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[已完结]
Discovery studio怎么安装
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well9103
2015-01-08
2015-01-08 16:32:23
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well9103
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MS
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[已完结]
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ms添加静电场单位
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xb490284223
2015-01-08
2015-01-08 16:00:12
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xb490284223
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Gromacs
]
amber计算中,对对象做SMD以后,如何表示配体周围的水密度变化
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白云鹤TJY
2013-08-23
2015-01-08 12:57:44
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keke_1210
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其他
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[关贴]
求四水碳酸镧的cif晶体结构
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chinaworm
2014-05-25
2015-01-08 11:35:52
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娜写年华1089
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MS
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求解释
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799778539
2015-01-08
2015-01-08 09:25:29
by
799778539
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