24小时热门版块排行榜    

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 订阅

管理团队 (金币库 69431.9 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成
20954113/210首页上一页111112113114115116下一页
全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
[热点] 不知道还有没有招博士的学校了 冻雨天 2026-06-10 刚刚
[MS] [已完结]Discover 结构优化失败，求指点 (1/575) SunnyRain0.0 2013-07-23 2015-01-06 06:55:26 by 呀呀杨会苗
[MS] [已完结]环氧树脂E03分子模拟步骤 (0/1162) 空隙0701 2015-01-05 2015-01-05 17:00:13 by 空隙0701
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]基于voronoi（泰森多边形）的开裂数值模拟 (0/719) hnsgg 2015-01-05 2015-01-05 13:42:44 by hnsgg
[Gromacs ] [已完结]求助：gromacs怎样进行REMD的计算？ (评阅+1) (4/2585) moye1991 2014-05-29 2015-01-05 12:01:34 by 小小刘亚男
[其他] [已完结]分子动力学模拟 (0/429) 王俊洋95 2015-01-05 2015-01-05 11:44:41 by 王俊洋95
[其他] [已完结]批量提交作业 (评阅+1) (7/956) 菲同寻常 2015-01-02 2015-01-05 09:38:17 by fmying
[MS] [已完结]最小化时出现问题    ( 1 2 ) (10/2234) 说好de 2015-01-02 2015-01-04 20:32:49 by 说好de
[DS/Syby ] [已完结]ds中药效团模型预测分子显示 no map found是什么意思啊？ (1/507) wuzhufeng 2014-11-17 2015-01-04 17:50:44 by LALAQXL
[LAMMPS/ ] [已完结]Fe—Fe 势函数求助 (0/1015) wangyulinup 2015-01-04 2015-01-04 17:12:38 by wangyulinup
[已完结]MS模拟橡胶老化 (2/797) tqyene 2015-01-02 2015-01-04 14:45:36 by 赵红霞
[Gromacs ] [已完结][关贴]在求AMBER14 (4/983) atmdd 2014-12-29 2015-01-04 11:19:23 by smutao
[MS] [已完结]MS用那个系统运行比较好 (评阅+1) (2/770) whqs8426212 2015-01-01 2015-01-04 00:48:13 by whqs8426212
[LAMMPS/ ] [已完结]如何输出裂纹随时间变化的长度 (4/1528) 525850367 2014-10-29 2015-01-03 23:44:10 by kervinzhao
[MS] [已完结]炭分子筛在MS里如何建模 (评阅+1) (4/834) threelipeggy 2014-12-28 2015-01-03 16:16:48 by 心如止水dc
[资源] [已完结]求Windows版charmm软件 (评阅+1) (1/884) ckch2005 2015-01-03 2015-01-03 13:19:04 by qchem
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps中如何删除已经已经离开基体的原子 (0/1485) digghost 2015-01-03 2015-01-03 11:24:08 by digghost
[MS] [已完结]分子模型构建 (0/1568) 说好de 2015-01-02 2015-01-02 10:41:02 by 说好de
[其他] [已完结][关贴]求基于配体的设计的新近案例 (0/221) 331268942 2015-01-01 2015-01-01 21:47:20 by 331268942
[MS] [已完结]用shiftx软件计算化学位移 (0/239) 菲同寻常 2015-01-01 2015-01-01 16:53:23 by 菲同寻常
[MS] [已完结]在用demol跑分子动力学后，怎么提取出原子的运动轨迹，例如每一步的能量和坐标？ (1/1314) hxxywwp 2014-12-29 2015-01-01 10:29:01 by njuedu007
[MS] [已完结]关于超晶胞计算后如何验算模型是否合理？ (0/494) qquu4274 2014-12-31 2014-12-31 23:52:05 by qquu4274
[Gromacs ] [已完结]求助，gromacs跑nve能量为神马不恒定？ (2/720) 明月照清渠 2014-12-29 2014-12-31 19:40:35 by 明月照清渠
[LAMMPS/ ] [已完结]LAMMPS运行时奇怪的异常情况，求解释 (0/1642) gulubaozi 2014-12-31 2014-12-31 18:03:15 by gulubaozi
[其他] [已完结]氧化石墨烯这种类型的三维模拟图用什么软件绘制？？ (7/2400) nishuowodong 2014-12-29 2014-12-31 15:44:47 by nishuowodong
[资源] [已完结]计算化学杂志推荐 (0/1136) 凌风阁少阁主 2014-12-31 2014-12-31 15:12:46 by 凌风阁少阁主
[其他] [已完结]T-S随温度变化图线，想外推到2000K (评阅+1) (6/1223) liuxiaodang 2014-12-28 2014-12-31 12:37:13 by pigrass
[Gromacs ] [已完结]有没有办法使用 Packmol 取代Material Studio来缩盒子？(NAMD前处理用) (4/1707) gn02530640 2014-12-30 2014-12-31 12:01:23 by gn02530640
[MS] [已完结]跪求空间群为P21/n 的HNIW的CIF文件 (评阅+1) (5/1165) 王小福吼吼 2014-12-29 2014-12-31 09:04:24 by pigrass
[Gromacs ] [已完结]antechamber 小分子力场 加氢的问题 (0/1466) efeyer 2014-12-30 2014-12-30 21:25:18 by efeyer
[MS] [已完结][关贴]如何建立MOF模型？CO2、N2等气体模型如何建立？ (评阅+5) (6/3786) 学员gUvS0g 2013-11-07 2014-12-30 14:17:18 by 说好de
[MS] [已完结]用MS计算结合能得到的结果是kcal/mol,这个单位的意思是1mol什么东西的能量啊？ (评阅+1) (4/4362) 长大小慧慧 2014-12-29 2014-12-30 09:08:05 by 月只蓝
[MS] [已完结][关贴]MS怎样构建团簇模型 (评阅+1) (0/1310) hongsemenghuan 2014-12-30 2014-12-30 08:58:43 by hongsemenghuan
[MS] [已完结]VMD 软件中 怎么把粒子设置成透明的？ (评阅+1) (0/636) congamen 2014-12-30 2014-12-30 08:46:21 by congamen
[MS] [已完结]有机物数据库有哪几个 (2/956) mzlwait 2014-12-29 2014-12-30 07:02:50 by qchem
[MS] [已完结]为什么我对晶胞内分子进行优化不收敛呢？？？？ (0/639) qianshuiyuan 2014-12-30 2014-12-30 06:33:27 by qianshuiyuan
[其他] [已完结]求推荐杂志 (评阅+1) (2/480) yylcx 2014-12-29 2014-12-29 18:06:29 by yylcx
[MS] [已完结]共晶分子模拟 (评阅+1) (4/1767) leonjay1989 2014-12-27 2014-12-29 11:14:33 by leonjay1989
[MS] [已完结]ms运行错误，jod has failed (3/963) qianyuxin 2014-12-25 2014-12-29 10:26:28 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]lammps如何将固壁一类的原子排除出计算范围？ (0/550) hnsgg 2014-12-29 2014-12-29 09:49:39 by hnsgg
[MS] [已完结]碳氮键拉长 (0/370) 916756502 2014-12-29 2014-12-29 09:39:14 by 916756502
[Gromacs ] [已完结]求助mmpbsa的问题，最后没有输出文件。 (3/1133) lingogo 2013-12-24 2014-12-29 07:42:56 by 上官若轩
[LAMMPS/ ] [已完结]LAMMPS中建模的周期性问题 (评阅+1) (0/664) gulubaozi 2014-12-28 2014-12-28 18:04:03 by gulubaozi
[MS] [关贴]Dmol3模拟怎么调收敛性？ (1/1089) ONGIONG 2014-12-25 2014-12-27 14:38:49 by Ivy286
[LAMMPS/ ] 寻找小伙伴，有人用lammps 做渗吸以及油水驱替吗？？ (0/437) 小八PS 2014-12-27 2014-12-27 10:26:57 by 小八PS
[其他] [已完结]Audock问题    ( 1 2 ) (评阅+1) (16/1560) 毕红娜 2014-12-20 2014-12-27 09:12:42 by wbf3ng
[MS] [已完结]materials studio 坐标轴方向改变 (评阅+1) (2/11625) yiha 2014-12-26 2014-12-27 08:46:01 by 月只蓝
[其他] [已完结]黏土矿物，晶胞常数 (评阅+1) (1/426) xj200920075 2014-12-26 2014-12-26 17:01:22 by 但丁
[MS] [已完结]计算机辅助药物设计中各种方法的适用范围 (4/1173) 纸灰机 2014-12-23 2014-12-26 16:38:45 by 纸灰机
[DS/Syby ] [已完结]用ds2.5算结合能总是出来奇葩数值，求大神指点 (2/972) 娃娃和淡蓝色 2014-12-05 2014-12-26 14:52:19 by ~小绿~
[DS/Syby ] [已完结]求助DS中怎么使用MMPBSA模块啊 (0/492) ~小绿~ 2014-12-26 2014-12-26 14:50:19 by ~小绿~
[MS] [已完结]“慢”扩散的模拟计算？？？ (评阅+1) (8/1367) 故事是这样的 2014-12-22 2014-12-26 10:07:46 by 故事是这样的
[Gromacs ] 用什么软件处理namd跑出来的dcd文件 (9/2038) 476992939 2012-03-13 2014-12-25 22:25:33 by zhaoshuxin12
[DS/Syby ] [已完结]寻求分子模拟机构，急急急 (评阅+1) (5/1084) yxqfzc 2014-12-23 2014-12-25 20:53:15 by 南海猪
[DS/Syby ] [已完结]请问一下DS做分子对接的步骤？    ( 1 2 ) (10/7904) 京人会 2011-04-19 2014-12-25 19:59:02 by huangfengwen
[LAMMPS/ ] 问大家一个简单的问题 (0/334) 牧灵圣经 2014-12-25 2014-12-25 19:07:37 by 牧灵圣经
[MS] [已完结]生物计算机模拟 (4/1030) crystal柳 2014-12-22 2014-12-25 17:44:53 by houxuben
[MS] [已完结]活化熵、活化焓 (0/774) 虫虫小小小 2014-12-25 2014-12-25 15:54:50 by 虫虫小小小
[专家会诊] [已完结]关于高斯跑氨基酸稳定态的问题 (0/505) 学员eg7K6U 2014-12-25 2014-12-25 15:26:43 by q272174478
[DS/Syby ] 听说cost analysis是药效团模型评价的重要指标！ (评阅+1) (5/717) wuvictor 2014-12-17 2014-12-25 13:47:59 by wuvictor
[其他] 【求助】小分子库中为什么10mg，20mg，50mg含义是什么？ (3/797) fanc232 2011-01-19 2014-12-25 11:51:50 by fanc232
[MS] [已完结]求分子动力学模拟软件Mdynamix及其使用说明，谢谢！ (评阅+1) (1/1013) wufu88 2014-12-24 2014-12-25 11:07:41 by pigrass
[Gromacs ] top文件里的cgnr必须按顺序吗？ (2/1087) 吉米爱多 2014-11-21 2014-12-25 10:52:07 by 吉米爱多
[专家会诊] [已完结]蛋白质pdb文件剪断以后C末端和N末端的处理 (0/423) 贝北2014 2014-12-25 2014-12-25 09:29:24 by 贝北2014
[Gromacs ] [已完结]有没有做胶体分子动力学的？可否赐教一下itp文件要怎么生成的？ (0/469) 白玉浴血 2014-12-25 2014-12-25 08:33:57 by 白玉浴血
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps中的bond键拉到应变0.15就拉不动了,怎么回事？ (评阅+1) (1/543) 舒心惠 2014-12-25 2014-12-25 07:41:44 by abinitio
[Gromacs ] [已完结]真是跪求了，AmberTools里的MCPB (评阅+1) (1/853) 面条向上 2014-12-23 2014-12-24 21:49:44 by 面条向上
[专家会诊] [已完结]偶氮苯分子横向尺寸可以计算吗 (评阅+1) (2/970) 苏打红绿茶 2014-12-24 2014-12-24 18:08:32 by wbf3ng
[其他] 【讨论】计算机辅助药物设计 要学编程语言 哪种更好一些！ (9/3698) chzhbin 2010-09-29 2014-12-24 06:33:22 by fanc232
[LAMMPS/ ] 【讨论】lammps 用sw势计算硅的熔点怎么这么高（2400k),附in文件    ( 1 2 ) (评阅+1) (13/4381) cxz314 2010-09-10 2014-12-23 13:42:31 by 牛排小黑娇
[MS] [已完结]MS 7中内聚能密度在哪个模块可以计算 (2/1862) xyujn 2014-12-23 2014-12-23 13:37:01 by 赵红霞
[MS] [已完结][关贴]Forcite吸附结构优化 (评阅+1) (4/2699) xb490284223 2014-12-22 2014-12-23 12:56:46 by xb490284223
[MS] [已完结]如何用MS计算溶液中离子的配位数 (评阅+1) (5/3440) mxbn55 2014-12-20 2014-12-23 09:58:30 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结]同时显示原子和有限元网格 (1/686) jfyh2008 2014-12-22 2014-12-23 09:35:47 by jfyh2008
[MS] [已完结]Materials Studio--Anderson/nose/Berendsen/NHL/velocity scale是什么 (3/1884) oudegeshen 2014-12-20 2014-12-23 03:39:36 by oudegeshen
[MS] [已完结]MS模拟电解质溶液 (评阅+1) (5/1177) mxbn55 2014-12-19 2014-12-22 21:48:25 by mxbn55
[CPMD/CP ] [已完结]【已经解决，编译出的问题】DAY1_water_inp1计算出错 (3/1512) cenwanglai 2013-08-31 2014-12-22 19:08:34 by 李天帮
[MS] [已完结][关贴]ms建模及优化问题 (0/1332) xb490284223 2014-12-22 2014-12-22 16:29:00 by xb490284223
[DS/Syby ] [已完结]请问sybyl 中怎样实现“撤销” 这个操作    ( 1 2 ) (评阅+1) (11/1960) paul34 2014-02-12 2014-12-22 14:52:09 by 宝马bm
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps中怎么固定一族原子 (3/2224) naterriver 2014-08-31 2014-12-22 13:38:41 by 没有烟的火柴
[MS] [已完结]模拟扩散系数 (0/478) 说好de 2014-12-22 2014-12-22 11:27:04 by 说好de
[MS] [已完结]Materials Studio 7.0 氧原子的颜色问题 (1/2039) oudegeshen 2014-12-22 2014-12-22 10:46:07 by pigrass
[LAMMPS/ ] [已完结]颗粒表面水分子径向分布函数怎么如此奇怪 (0/739) jane8556 2014-12-22 2014-12-22 10:42:41 by jane8556
[其他] [已完结]微扰理论硬球模型    ( 1 2 ) (评阅+1) (18/2701) ys322 2014-12-18 2014-12-22 08:14:39 by ys322
[其他] [已完结]packmol如何构建初始结构供dl_poly使用？ (9/2277) longwei1221 2012-11-18 2014-12-22 07:45:12 by Darlingjack
[Gromacs ] [已完结][关贴]求助gromacs (评阅+1) (0/608) XUEZEXU 2014-12-21 2014-12-21 21:24:41 by XUEZEXU
[MS] [已完结]求助MS 安装时候出现的一个问题 (3/532) 心如止水dc 2014-12-20 2014-12-21 12:07:20 by 但丁
[MS] 请教分子力学与分子动力学的区别 (模拟EPI+1)(14/7017) shengxiang 2011-09-14 2014-12-21 11:17:37 by 淡在风中的云
[MS] [已完结]如何在MS中构建过渡金属Fe Co Ni 等改姓的分子筛模型 (0/707) 四叶草嘟嘟 2014-12-21 2014-12-21 11:06:21 by 四叶草嘟嘟
[资源] [已完结][关贴]分子模拟实验 武汉大学主编 (2/1320) xiaobomhx 2013-12-01 2014-12-20 18:31:48 by Ergon
[其他] [已完结]Gaussian建模 (7/1375) 未央于一 2014-12-18 2014-12-20 08:34:31 by nuolan
[MS] [已完结]对晶胞内放置的分子进行结构优化，不收敛，该怎么调节参数？ (评阅+1) (0/906) qianshuiyuan 2014-12-20 2014-12-20 02:09:13 by qianshuiyuan
[MS] [已完结]分子扩散的动能 (4/876) 虫虫小小小 2014-12-18 2014-12-19 23:46:06 by lsloneil
[MS] 求教，分子对接模拟 (17/1194) 寒冰fire 2014-12-19 2014-12-19 18:19:18 by wangjielin
[MS] [已完结]想借助分子模拟来研究多孔材料对分子的吸附，可行吗？ (评阅+1) (7/977) iljosie 2014-12-11 2014-12-19 17:15:32 by beeper
[Gromacs ] [已完结]控温中的时间参数 (评阅+1) (0/574) cyl001 2014-12-19 2014-12-19 16:39:08 by cyl001
[MS] [已完结]morphology版权求助 (0/318) mzlwait 2014-12-19 2014-12-19 16:01:06 by mzlwait
[其他] [已完结]分子动力学 Fe-C-Si 势函数，求告知 (1/894) OMGod123 2014-12-17 2014-12-19 15:34:02 by bjxmqp
[CPMD/CP ] [已完结][关贴]CPMD 画图 (1/999) 海韵315 2014-10-19 2014-12-19 14:54:44 by abinitio
20954113/210首页上一页111112113114115116下一页
相关版块跳转
查看