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求助：gromacs怎样进行REMD的计算？ 已有2人参与
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求助各位有经验的前辈，用gromacs怎样进行REMD的计算，有操作过的大侠吗？求指导，tutorial上只有原理，没有实际操作方法，不会实际操作啊~ |
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jianchen7882
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 20:16:35
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http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... lysozyme/index.html 这个网址可以做，在最后结果分析那呢，具体也有一些中文教程，百度文库好像就有，水中的溶菌酶 吧 大约搜 |
2楼2014-05-29 17:30:50
3楼2014-06-01 10:41:55
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
moye1991: 金币+15, ★★★很有帮助, 好的，非常感谢~ 2014-06-05 10:57:21
moye1991: 金币+15, ★★★很有帮助, 好的，非常感谢~ 2014-06-05 10:57:21
| 温度副本交换模拟啊，这个估计一句话两句话教不会你啊，你可以去gromacs的官网http://www.gromacs.org/Documentation/Tutorials上看，那里有一个比较详细的介绍，然后你在自己学习一下温度副本的设置，跑模拟的过程都是一样的，最后就是在分析的时候有差别，需要对轨迹文件，能量文件自己处理，那个就是后期的工作了，你先把前期工作学会了，后边的分析可以到时候在学 |
4楼2014-06-04 12:43:14
5楼2015-01-05 15:01:34
