| 查看: 2679 | 回复: 4 | |||
[求助]
求助：gromacs怎样进行REMD的计算？ 已有2人参与
|
求助各位有经验的前辈，用gromacs怎样进行REMD的计算，有操作过的大侠吗？求指导，tutorial上只有原理，没有实际操作方法，不会实际操作啊~ |
回复此楼» 猜你喜欢
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有3人回复
-
售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs运行问题
已经有9人回复
- gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子
已经有19人回复
- 求问 分子模拟中 提高温度是否就能实现增强抽样呢？
已经有10人回复
- 【菜鸟求助】gromacs如何计算大分子和小分子间的非共价键力？？
已经有13人回复
- Namd， Gromacs 可以计算分子中电荷分布随时间的变化吗？
已经有4人回复
- gromacs 添加新的力场pdb2gmx报错
已经有5人回复
- gromacs计算时原系统带电荷，如何添加离子中和电性？
已经有8人回复
- gromacs中MM-GBSA计算
已经有7人回复
- 【转帖】用Amber+Gaussian做小分子力场
已经有16人回复
- 【转帖】一些计算化学相关的免费的在线数据库、分子结构库及工具
已经有109人回复
- 【求助】NAMD和Gromacs哪个简单？
已经有5人回复
jianchen7882
金虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 1406
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 76.1小时
- 虫号: 2182099
- 注册: 2012-12-12
- 性别: GG
- 专业: 分离过程
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 20:16:35
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-30 20:16:35
|
http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... lysozyme/index.html 这个网址可以做，在最后结果分析那呢，具体也有一些中文教程，百度文库好像就有，水中的溶菌酶 吧 大约搜 |
2楼2014-05-29 17:30:50
3楼2014-06-01 10:41:55
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
moye1991: 金币+15, ★★★很有帮助, 好的，非常感谢~ 2014-06-05 10:57:21
moye1991: 金币+15, ★★★很有帮助, 好的，非常感谢~ 2014-06-05 10:57:21
| 温度副本交换模拟啊，这个估计一句话两句话教不会你啊，你可以去gromacs的官网http://www.gromacs.org/Documentation/Tutorials上看，那里有一个比较详细的介绍，然后你在自己学习一下温度副本的设置，跑模拟的过程都是一样的，最后就是在分析的时候有差别，需要对轨迹文件，能量文件自己处理，那个就是后期的工作了，你先把前期工作学会了，后边的分析可以到时候在学 |
4楼2014-06-04 12:43:14
5楼2015-01-05 15:01:34
20