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lyxdjdj

新虫 (初入文坛)

[求助] GLOD分子模拟结果分析和参数设置

各位大神,本人初涉分子模拟领域,导师让我用GLOD进行screen和dock。 以前我用过autodock进行对接,知道可以在对接完成后直接看能量数据,氢键也可以visualize,但是请问GOLD也可以进行类似操作吗?看GOLD的说明书感觉GOLDMine可以用来分析对接结果,但是要怎么样才可以把数据导入到GOLDMine进行查看?

另外请问对接时候我导入的是带有配体的蛋白分子,在delete ligand部分我extract了需要的ligand,其他的是不是默认自动删除的?(后期对接完成想把这个配体和后面对接上的配体作为比较)

如果大牛用过GOLD求交流~~
谢谢!!!
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